MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 22959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020974	ATT	2	6	181943	181948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020974	AATT	2	8	181962	181969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020974	TGT	2	6	181986	181991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020974	T	6	6	182090	182095	0 %	100 %	0 %	0 %	478463219
4005	NC_020974	TTGAA	2	10	182116	182125	40 %	40 %	20 %	0 %	478463219
4006	NC_020974	TTTG	2	8	182130	182137	0 %	75 %	25 %	0 %	478463219
4007	NC_020974	ATC	2	6	182227	182232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463219
4008	NC_020974	TGCA	2	8	182248	182255	25 %	25 %	25 %	25 %	478463219
4009	NC_020974	TGT	2	6	182266	182271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463219
4010	NC_020974	AGT	2	6	182285	182290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463219
4011	NC_020974	CT	3	6	182330	182335	0 %	50 %	0 %	50 %	478463219
4012	NC_020974	T	6	6	182335	182340	0 %	100 %	0 %	0 %	478463219
4013	NC_020974	CTC	2	6	182364	182369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463219
4014	NC_020974	GA	3	6	182409	182414	50 %	0 %	50 %	0 %	478463219
4015	NC_020974	GAT	2	6	182464	182469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463219
4016	NC_020974	AAAG	2	8	182617	182624	75 %	0 %	25 %	0 %	478463219
4017	NC_020974	CGA	2	6	182798	182803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463219
4018	NC_020974	AAT	2	6	182824	182829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463219
4019	NC_020974	ATT	2	6	182864	182869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463219
4020	NC_020974	GTTT	2	8	182920	182927	0 %	75 %	25 %	0 %	478463219
4021	NC_020974	TGAGT	2	10	182930	182939	20 %	40 %	40 %	0 %	478463219
4022	NC_020974	CTT	2	6	183008	183013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463219
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4025	NC_020974	G	13	13	183128	183140	0 %	0 %	100 %	0 %	478463219
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4029	NC_020974	AGAAA	2	10	183298	183307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020974	AAGA	2	8	183319	183326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020974	T	8	8	183343	183350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020974	AGAAAA	2	12	183361	183372	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020974	A	6	6	183369	183374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020974	TCG	2	6	183409	183414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463220
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4038	NC_020974	AAG	2	6	183499	183504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463220
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4040	NC_020974	TCT	2	6	183547	183552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463220
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4043	NC_020974	TTGAG	2	10	183680	183689	20 %	40 %	40 %	0 %	478463220
4044	NC_020974	ATAGA	2	10	183702	183711	60 %	20 %	20 %	0 %	478463220
4045	NC_020974	CT	3	6	183755	183760	0 %	50 %	0 %	50 %	478463220
4046	NC_020974	TGA	2	6	183769	183774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463220
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4050	NC_020974	TGA	2	6	183871	183876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463220
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4053	NC_020974	TTG	2	6	183936	183941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463220
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4055	NC_020974	GAT	2	6	183975	183980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463220
4056	NC_020974	GA	3	6	184001	184006	50 %	0 %	50 %	0 %	478463220
4057	NC_020974	GCG	2	6	184009	184014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478463220
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4059	NC_020974	TAG	2	6	184091	184096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_020974	AGA	2	6	184192	184197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020974	GCA	2	6	184201	184206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_020974	TA	3	6	184236	184241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020974	GAA	2	6	184271	184276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_020974	AGA	2	6	184310	184315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4068	NC_020974	GTT	2	6	184401	184406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4072	NC_020974	GAG	2	6	184484	184489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4083	NC_020974	ATT	2	6	184878	184883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463221
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4090	NC_020974	GA	3	6	185124	185129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_020974	AGT	2	6	185564	185569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463222
4100	NC_020974	ATCG	2	8	185591	185598	25 %	25 %	25 %	25 %	478463222
4101	NC_020974	TCA	2	6	185676	185681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463223
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4104	NC_020974	TTA	2	6	186177	186182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463223
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4107	NC_020974	TCTA	2	8	186347	186354	25 %	50 %	0 %	25 %	478463223
4108	NC_020974	GTT	2	6	186407	186412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_020974	TGC	2	6	186540	186545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463224
4110	NC_020974	CA	3	6	186561	186566	50 %	0 %	0 %	50 %	478463224
4111	NC_020974	AC	3	6	186579	186584	50 %	0 %	0 %	50 %	478463224
4112	NC_020974	AGA	2	6	186678	186683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463224
4113	NC_020974	GTT	3	9	186807	186815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_020974	T	6	6	186821	186826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020974	T	7	7	186829	186835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_020974	T	6	6	186841	186846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020974	T	8	8	186891	186898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020974	A	6	6	186914	186919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020974	T	6	6	186936	186941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020974	T	7	7	187031	187037	0 %	100 %	0 %	0 %	478463225
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4123	NC_020974	GTC	2	6	187156	187161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463225
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4126	NC_020974	CTT	2	6	187261	187266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463225
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4257	NC_020974	TCT	2	6	193179	193184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463231
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4261	NC_020974	A	7	7	193445	193451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_020974	T	6	6	193544	193549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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