MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L3/404/LN complete genome

Total Repeats: 22959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020974	ACA	2	6	69279	69284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_020974	GCA	2	6	69352	69357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463122
1503	NC_020974	CAAGC	2	10	69362	69371	40 %	0 %	20 %	40 %	478463122
1504	NC_020974	A	6	6	69398	69403	100 %	0 %	0 %	0 %	478463122
1505	NC_020974	TCT	2	6	69539	69544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463122
1506	NC_020974	CTG	2	6	69570	69575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463122
1507	NC_020974	ATG	2	6	69578	69583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463122
1508	NC_020974	AAAAG	2	10	69610	69619	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020974	A	6	6	69711	69716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020974	TA	3	6	69746	69751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020974	TTC	2	6	69786	69791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463123
1512	NC_020974	CTT	3	9	69795	69803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463123
1513	NC_020974	AT	3	6	69808	69813	50 %	50 %	0 %	0 %	478463123
1514	NC_020974	TTCG	2	8	69828	69835	0 %	50 %	25 %	25 %	478463123
1515	NC_020974	TGT	2	6	69853	69858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463123
1516	NC_020974	TGAT	2	8	69945	69952	25 %	50 %	25 %	0 %	478463123
1517	NC_020974	T	6	6	69993	69998	0 %	100 %	0 %	0 %	478463123
1518	NC_020974	TCT	2	6	70109	70114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463123
1519	NC_020974	GGAGC	2	10	70232	70241	20 %	0 %	60 %	20 %	478463123
1520	NC_020974	TGC	2	6	70315	70320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463123
1521	NC_020974	A	7	7	70352	70358	100 %	0 %	0 %	0 %	478463123
1522	NC_020974	CT	3	6	70360	70365	0 %	50 %	0 %	50 %	478463123
1523	NC_020974	AGA	2	6	70369	70374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463123
1524	NC_020974	ATT	2	6	70380	70385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463123
1525	NC_020974	GCGAT	2	10	70422	70431	20 %	20 %	40 %	20 %	478463123
1526	NC_020974	GTT	2	6	70444	70449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463123
1527	NC_020974	GCT	2	6	70466	70471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463123
1528	NC_020974	GCA	3	9	70568	70576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463123
1529	NC_020974	AAAG	2	8	70601	70608	75 %	0 %	25 %	0 %	478463123
1530	NC_020974	GCA	2	6	70615	70620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463123
1531	NC_020974	ATT	2	6	70629	70634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463123
1532	NC_020974	TAT	2	6	70737	70742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463123
1533	NC_020974	CTT	2	6	70761	70766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463123
1534	NC_020974	GA	3	6	70770	70775	50 %	0 %	50 %	0 %	478463123
1535	NC_020974	CTCTT	2	10	70776	70785	0 %	60 %	0 %	40 %	478463123
1536	NC_020974	AGAA	2	8	70788	70795	75 %	0 %	25 %	0 %	478463123
1537	NC_020974	TGA	2	6	70816	70821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463123
1538	NC_020974	TTG	2	6	70905	70910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463123
1539	NC_020974	TCT	2	6	70928	70933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463123
1540	NC_020974	GA	3	6	70969	70974	50 %	0 %	50 %	0 %	478463123
1541	NC_020974	AGCT	2	8	71010	71017	25 %	25 %	25 %	25 %	478463123
1542	NC_020974	TGA	2	6	71056	71061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463123
1543	NC_020974	GCAT	2	8	71071	71078	25 %	25 %	25 %	25 %	478463123
1544	NC_020974	AGA	2	6	71089	71094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463123
1545	NC_020974	TCAA	2	8	71215	71222	50 %	25 %	0 %	25 %	478463123
1546	NC_020974	GT	3	6	71245	71250	0 %	50 %	50 %	0 %	478463123
1547	NC_020974	CT	3	6	71326	71331	0 %	50 %	0 %	50 %	478463123
1548	NC_020974	GA	3	6	71347	71352	50 %	0 %	50 %	0 %	478463123
1549	NC_020974	AGT	2	6	71389	71394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463123
1550	NC_020974	AGGGG	2	10	71422	71431	20 %	0 %	80 %	0 %	478463123
1551	NC_020974	AAGAA	2	10	71464	71473	80 %	0 %	20 %	0 %	478463123
1552	NC_020974	AGA	2	6	71536	71541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463123
1553	NC_020974	TGA	2	6	71572	71577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463123
1554	NC_020974	TAT	2	6	71583	71588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463123
1555	NC_020974	T	6	6	71672	71677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020974	T	8	8	71693	71700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020974	CAT	2	6	71758	71763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463124
1558	NC_020974	CCTT	2	8	71787	71794	0 %	50 %	0 %	50 %	478463124
1559	NC_020974	GCTT	2	8	71817	71824	0 %	50 %	25 %	25 %	478463124
1560	NC_020974	A	6	6	71912	71917	100 %	0 %	0 %	0 %	478463124
1561	NC_020974	ATT	2	6	71962	71967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463124
1562	NC_020974	CAA	2	6	72109	72114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478463124
1563	NC_020974	TCC	2	6	72133	72138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463124
1564	NC_020974	TTCT	2	8	72155	72162	0 %	75 %	0 %	25 %	478463124
1565	NC_020974	ATG	2	6	72167	72172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463124
1566	NC_020974	GCTT	2	8	72201	72208	0 %	50 %	25 %	25 %	478463124
1567	NC_020974	AGA	2	6	72210	72215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463124
1568	NC_020974	GAGC	2	8	72229	72236	25 %	0 %	50 %	25 %	478463124
1569	NC_020974	TCA	2	6	72254	72259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478463124
1570	NC_020974	A	7	7	72261	72267	100 %	0 %	0 %	0 %	478463124
1571	NC_020974	CTATTT	2	12	72272	72283	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478463124
1572	NC_020974	TGA	2	6	72306	72311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463124
1573	NC_020974	ATG	2	6	72344	72349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463124
1574	NC_020974	AGA	2	6	72474	72479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020974	CT	3	6	72482	72487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_020974	CGT	2	6	72522	72527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_020974	T	7	7	72527	72533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020974	CTTGC	2	10	72553	72562	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1579	NC_020974	GATA	2	8	72577	72584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020974	TTC	2	6	72668	72673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478463125
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1582	NC_020974	ATTGG	2	10	72754	72763	20 %	40 %	40 %	0 %	478463125
1583	NC_020974	T	6	6	72770	72775	0 %	100 %	0 %	0 %	478463125
1584	NC_020974	AGC	2	6	72785	72790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463125
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1586	NC_020974	ATA	2	6	72898	72903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463125
1587	NC_020974	GCT	2	6	72918	72923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463125
1588	NC_020974	GCTA	2	8	72927	72934	25 %	25 %	25 %	25 %	478463125
1589	NC_020974	AAT	2	6	72957	72962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478463125
1590	NC_020974	TGG	2	6	72988	72993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478463125
1591	NC_020974	T	6	6	72995	73000	0 %	100 %	0 %	0 %	478463125
1592	NC_020974	AGC	2	6	73057	73062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478463125
1593	NC_020974	TTAT	2	8	73103	73110	25 %	75 %	0 %	0 %	478463125
1594	NC_020974	TGC	2	6	73111	73116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478463125
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1597	NC_020974	GATT	2	8	73205	73212	25 %	50 %	25 %	0 %	478463125
1598	NC_020974	GAA	2	6	73280	73285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463125
1599	NC_020974	CTGG	2	8	73313	73320	0 %	25 %	50 %	25 %	478463125
1600	NC_020974	CTC	2	6	73333	73338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478463125
1601	NC_020974	ACTCTT	2	12	73401	73412	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478463125
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1603	NC_020974	TGA	2	6	73439	73444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463125
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1605	NC_020974	T	6	6	73554	73559	0 %	100 %	0 %	0 %	478463125
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1607	NC_020974	TAG	2	6	73603	73608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463125
1608	NC_020974	AGA	2	6	73710	73715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478463125
1609	NC_020974	ATCA	2	8	73740	73747	50 %	25 %	0 %	25 %	478463125
1610	NC_020974	TGT	2	6	73813	73818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478463125
1611	NC_020974	GAAAA	2	10	73826	73835	80 %	0 %	20 %	0 %	478463125
1612	NC_020974	A	7	7	73832	73838	100 %	0 %	0 %	0 %	478463125
1613	NC_020974	AGG	2	6	73858	73863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478463125
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1617	NC_020974	GA	3	6	74011	74016	50 %	0 %	50 %	0 %	478463126
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1620	NC_020974	TGA	2	6	74114	74119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478463126
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1622	NC_020974	TAT	2	6	74184	74189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478463126
1623	NC_020974	A	6	6	74220	74225	100 %	0 %	0 %	0 %	478463126
1624	NC_020974	TGGGA	2	10	74243	74252	20 %	20 %	60 %	0 %	478463126
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