MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 22958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020973	AAG	2	6	584567	584572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462679
13003	NC_020973	AAC	2	6	584603	584608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462679
13004	NC_020973	A	6	6	584650	584655	100 %	0 %	0 %	0 %	478462679
13005	NC_020973	GCAA	2	8	584769	584776	50 %	0 %	25 %	25 %	478462679
13006	NC_020973	T	6	6	584794	584799	0 %	100 %	0 %	0 %	478462679
13007	NC_020973	GCA	2	6	584911	584916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462680
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13009	NC_020973	TCTT	2	8	584994	585001	0 %	75 %	0 %	25 %	478462680
13010	NC_020973	GTTGT	2	10	585053	585062	0 %	60 %	40 %	0 %	478462680
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13013	NC_020973	TTC	2	6	585251	585256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462680
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13016	NC_020973	ATT	2	6	585385	585390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462681
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13018	NC_020973	TCC	2	6	585544	585549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462681
13019	NC_020973	T	6	6	585575	585580	0 %	100 %	0 %	0 %	478462681
13020	NC_020973	AGC	2	6	585583	585588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462681
13021	NC_020973	AAACT	2	10	585686	585695	60 %	20 %	0 %	20 %	478462681
13022	NC_020973	CCT	2	6	585701	585706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462681
13023	NC_020973	AAC	2	6	585709	585714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462681
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13027	NC_020973	CTA	2	6	585848	585853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462682
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13031	NC_020973	AAAT	2	8	586004	586011	75 %	25 %	0 %	0 %	478462682
13032	NC_020973	CAT	2	6	586031	586036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462682
13033	NC_020973	TA	3	6	586157	586162	50 %	50 %	0 %	0 %	478462682
13034	NC_020973	T	6	6	586200	586205	0 %	100 %	0 %	0 %	478462683
13035	NC_020973	GCT	2	6	586216	586221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462683
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13038	NC_020973	GTCT	2	8	586565	586572	0 %	50 %	25 %	25 %	478462683
13039	NC_020973	CAA	2	6	586592	586597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462683
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13041	NC_020973	TCA	2	6	586681	586686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462683
13042	NC_020973	ACCAA	2	10	586778	586787	60 %	0 %	0 %	40 %	478462684
13043	NC_020973	CGC	2	6	586799	586804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478462684
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13051	NC_020973	ATC	2	6	587339	587344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462685
13052	NC_020973	CATA	2	8	587446	587453	50 %	25 %	0 %	25 %	478462685
13053	NC_020973	TTA	2	6	587629	587634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462685
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13055	NC_020973	TCTT	2	8	587695	587702	0 %	75 %	0 %	25 %	478462685
13056	NC_020973	TA	3	6	587713	587718	50 %	50 %	0 %	0 %	478462685
13057	NC_020973	T	7	7	587720	587726	0 %	100 %	0 %	0 %	478462685
13058	NC_020973	TC	4	8	587748	587755	0 %	50 %	0 %	50 %	478462686
13059	NC_020973	GAA	2	6	587773	587778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462686
13060	NC_020973	ACGT	2	8	587865	587872	25 %	25 %	25 %	25 %	478462686
13061	NC_020973	GAG	2	6	587885	587890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462686
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13065	NC_020973	AGCA	2	8	588027	588034	50 %	0 %	25 %	25 %	478462686
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13087	NC_020973	T	6	6	588851	588856	0 %	100 %	0 %	0 %	478462689
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13101	NC_020973	CA	3	6	589360	589365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_020973	GCA	2	6	589389	589394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462691
13103	NC_020973	AGC	2	6	589403	589408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462691
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13105	NC_020973	AGT	2	6	589484	589489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462691
13106	NC_020973	CCGA	2	8	589564	589571	25 %	0 %	25 %	50 %	478462691
13107	NC_020973	GAAA	2	8	589670	589677	75 %	0 %	25 %	0 %	478462691
13108	NC_020973	CGA	2	6	589711	589716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462691
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13119	NC_020973	TCA	2	6	590335	590340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462692
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13232	NC_020973	CAGA	2	8	595314	595321	50 %	0 %	25 %	25 %	478462699
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13242	NC_020973	TCT	2	6	595845	595850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462700
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13492	NC_020973	AAG	2	6	607911	607916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13493	NC_020973	GAC	2	6	607921	607926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13494	NC_020973	TAC	2	6	607929	607934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13495	NC_020973	ATG	2	6	607946	607951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_020973	A	6	6	607981	607986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_020973	AC	3	6	608054	608059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13498	NC_020973	CCT	2	6	608106	608111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462713
13499	NC_020973	TCT	2	6	608179	608184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462713
13500	NC_020973	TTC	2	6	608208	608213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462713

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