MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 22958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020973	CTG	2	6	518249	518254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462615
11503	NC_020973	TCA	2	6	518341	518346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462615
11504	NC_020973	TAA	2	6	518376	518381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462615
11505	NC_020973	CCT	2	6	518422	518427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462615
11506	NC_020973	TCT	2	6	518609	518614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462615
11507	NC_020973	TAC	2	6	518625	518630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462615
11508	NC_020973	TGT	2	6	518815	518820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462615
11509	NC_020973	AGC	2	6	518826	518831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462615
11510	NC_020973	TTC	2	6	518832	518837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462615
11511	NC_020973	GCC	2	6	519109	519114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478462615
11512	NC_020973	AACT	2	8	519234	519241	50 %	25 %	0 %	25 %	478462615
11513	NC_020973	AGC	2	6	519252	519257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462615
11514	NC_020973	AAC	2	6	519280	519285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462615
11515	NC_020973	GA	3	6	519323	519328	50 %	0 %	50 %	0 %	478462615
11516	NC_020973	CAA	2	6	519341	519346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462615
11517	NC_020973	AAG	2	6	519407	519412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462615
11518	NC_020973	CTC	2	6	519423	519428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462615
11519	NC_020973	CTTC	2	8	519434	519441	0 %	50 %	0 %	50 %	478462615
11520	NC_020973	TGT	2	6	519451	519456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462615
11521	NC_020973	ATAA	2	8	519655	519662	75 %	25 %	0 %	0 %	478462615
11522	NC_020973	TTG	2	6	519665	519670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462615
11523	NC_020973	AAAG	2	8	519724	519731	75 %	0 %	25 %	0 %	478462615
11524	NC_020973	AAG	2	6	519746	519751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462615
11525	NC_020973	AAC	2	6	519774	519779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462615
11526	NC_020973	TC	3	6	519782	519787	0 %	50 %	0 %	50 %	478462615
11527	NC_020973	ACA	2	6	519808	519813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462615
11528	NC_020973	AATA	2	8	519867	519874	75 %	25 %	0 %	0 %	478462615
11529	NC_020973	TCT	2	6	519883	519888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462615
11530	NC_020973	TGC	2	6	519931	519936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462615
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11532	NC_020973	AAT	3	9	520134	520142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462615
11533	NC_020973	GAAG	2	8	520239	520246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_020973	AT	3	6	520265	520270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_020973	AAAG	2	8	520278	520285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_020973	T	6	6	520326	520331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_020973	TTGGA	2	10	520349	520358	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_020973	T	6	6	520372	520377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_020973	ACA	2	6	520380	520385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_020973	AACC	2	8	520413	520420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11541	NC_020973	A	7	7	520484	520490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_020973	T	6	6	520506	520511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_020973	A	7	7	520557	520563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_020973	AGA	2	6	520610	520615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462616
11545	NC_020973	AAAG	2	8	520623	520630	75 %	0 %	25 %	0 %	478462616
11546	NC_020973	CAA	2	6	520679	520684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462616
11547	NC_020973	GAACT	2	10	520836	520845	40 %	20 %	20 %	20 %	478462616
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11550	NC_020973	A	7	7	520950	520956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_020973	CTAA	2	8	520971	520978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11552	NC_020973	AAT	2	6	520995	521000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020973	ACTT	2	8	521005	521012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11554	NC_020973	GCT	2	6	521096	521101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_020973	CAAAA	2	10	521115	521124	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11556	NC_020973	AGA	2	6	521173	521178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_020973	ATA	2	6	521207	521212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_020973	CTA	2	6	521281	521286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_020973	TCCC	2	8	521443	521450	0 %	25 %	0 %	75 %	478462617
11560	NC_020973	CAT	3	9	521463	521471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462617
11561	NC_020973	TCG	2	6	521481	521486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462617
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11572	NC_020973	GTC	2	6	522207	522212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462618
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11579	NC_020973	CTT	2	6	522476	522481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462618
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11599	NC_020973	AAG	2	6	523326	523331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462619
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11602	NC_020973	CCTC	2	8	523528	523535	0 %	25 %	0 %	75 %	478462619
11603	NC_020973	CAA	2	6	523595	523600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462619
11604	NC_020973	AG	3	6	523601	523606	50 %	0 %	50 %	0 %	478462619
11605	NC_020973	AGA	2	6	523768	523773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462620
11606	NC_020973	AAGC	2	8	523790	523797	50 %	0 %	25 %	25 %	478462620
11607	NC_020973	TAT	2	6	523818	523823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462620
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11610	NC_020973	ATTC	2	8	523919	523926	25 %	50 %	0 %	25 %	478462620
11611	NC_020973	TGC	2	6	523983	523988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462620
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11613	NC_020973	GGAG	2	8	524023	524030	25 %	0 %	75 %	0 %	478462620
11614	NC_020973	TCA	2	6	524033	524038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462620
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11618	NC_020973	CAA	2	6	524335	524340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462620
11619	NC_020973	ACA	2	6	524382	524387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462621
11620	NC_020973	CTT	2	6	524388	524393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462621
11621	NC_020973	TCA	2	6	524426	524431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462621
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11990	NC_020973	TCT	2	6	539635	539640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462635
11991	NC_020973	ATT	2	6	539695	539700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478462635
11992	NC_020973	GAA	2	6	539899	539904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462635
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