MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/224 complete genome

Total Repeats: 22958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_020973	ACA	2	6	316036	316041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462444
7003	NC_020973	GAA	2	6	316058	316063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462444
7004	NC_020973	TGA	2	6	316078	316083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462444
7005	NC_020973	AGT	2	6	316099	316104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462444
7006	NC_020973	AAAG	2	8	316186	316193	75 %	0 %	25 %	0 %	478462444
7007	NC_020973	CGT	2	6	316238	316243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462444
7008	NC_020973	TCCT	2	8	316283	316290	0 %	50 %	0 %	50 %	478462444
7009	NC_020973	GCA	2	6	316330	316335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462444
7010	NC_020973	GGA	2	6	316355	316360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462444
7011	NC_020973	GAT	2	6	316420	316425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462444
7012	NC_020973	TCC	2	6	316432	316437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462444
7013	NC_020973	CGC	2	6	316487	316492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478462444
7014	NC_020973	TGTGT	2	10	316499	316508	0 %	60 %	40 %	0 %	478462444
7015	NC_020973	TGA	2	6	316513	316518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462444
7016	NC_020973	CAT	3	9	316621	316629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462444
7017	NC_020973	GTG	2	6	316668	316673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478462444
7018	NC_020973	TGC	2	6	316732	316737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462444
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7020	NC_020973	AAG	2	6	316809	316814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462444
7021	NC_020973	TAA	2	6	316843	316848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462444
7022	NC_020973	GGA	2	6	316981	316986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478462444
7023	NC_020973	AAG	2	6	317025	317030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462444
7024	NC_020973	CG	4	8	317042	317049	0 %	0 %	50 %	50 %	478462444
7025	NC_020973	AGA	2	6	317056	317061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462444
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7028	NC_020973	TGA	2	6	317140	317145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462444
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7030	NC_020973	TAAAG	2	10	317386	317395	60 %	20 %	20 %	0 %	478462445
7031	NC_020973	GAT	2	6	317396	317401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478462445
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7033	NC_020973	TAA	2	6	317509	317514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462445
7034	NC_020973	TGT	2	6	317542	317547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462445
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7039	NC_020973	AAT	2	6	317831	317836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462445
7040	NC_020973	A	6	6	317848	317853	100 %	0 %	0 %	0 %	478462445
7041	NC_020973	CTT	2	6	317874	317879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462445
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7043	NC_020973	ATGGA	2	10	318011	318020	40 %	20 %	40 %	0 %	478462445
7044	NC_020973	CAA	2	6	318116	318121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462445
7045	NC_020973	CTT	2	6	318138	318143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462445
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7047	NC_020973	CTC	2	6	318173	318178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462445
7048	NC_020973	CAA	2	6	318188	318193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462445
7049	NC_020973	CAT	2	6	318262	318267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_020973	A	7	7	318274	318280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_020973	A	7	7	318288	318294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_020973	GCC	2	6	318307	318312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_020973	AATT	2	8	318341	318348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_020973	A	6	6	318358	318363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_020973	TTG	2	6	318379	318384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_020973	A	7	7	318386	318392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_020973	ATA	2	6	318409	318414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_020973	TCA	2	6	318458	318463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462446
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7061	NC_020973	TGC	2	6	318656	318661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478462446
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7066	NC_020973	AAG	2	6	318895	318900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462446
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7083	NC_020973	TAA	2	6	319634	319639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478462446
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7086	NC_020973	ACG	2	6	319745	319750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462446
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7095	NC_020973	CT	3	6	320088	320093	0 %	50 %	0 %	50 %	478462446
7096	NC_020973	ACA	2	6	320099	320104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478462446
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7098	NC_020973	AAAAAG	2	12	320154	320165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_020973	CCT	4	12	320238	320249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478462447
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7103	NC_020973	AAG	2	6	320380	320385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478462447
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7108	NC_020973	TCA	2	6	320547	320552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478462447
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7111	NC_020973	TCT	2	6	320796	320801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478462447
7112	NC_020973	AGC	3	9	320819	320827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478462447
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7118	NC_020973	GTT	2	6	320961	320966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462447
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7499	NC_020973	TGT	2	6	338369	338374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478462463
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