MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020969	CCAG	2	8	183131	183138	25 %	0 %	25 %	50 %	478473120
4003	NC_020969	TTG	2	6	183140	183145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473120
4004	NC_020969	GAC	2	6	183149	183154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473120
4005	NC_020969	GAT	2	6	183179	183184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473120
4006	NC_020969	GA	3	6	183205	183210	50 %	0 %	50 %	0 %	478473120
4007	NC_020969	GCG	2	6	183213	183218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478473120
4008	NC_020969	ACT	2	6	183261	183266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473120
4009	NC_020969	TAG	2	6	183295	183300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473120
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4011	NC_020969	TCGC	2	8	183393	183400	0 %	25 %	25 %	50 %	478473121
4012	NC_020969	AGA	2	6	183404	183409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473121
4013	NC_020969	GCA	2	6	183413	183418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473121
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4015	NC_020969	AGA	2	6	183480	183485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473121
4016	NC_020969	GA	3	6	183519	183524	50 %	0 %	50 %	0 %	478473121
4017	NC_020969	GTT	2	6	183536	183541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473121
4018	NC_020969	GTT	2	6	183571	183576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473121
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4021	NC_020969	GTT	2	6	183633	183638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473121
4022	NC_020969	GAG	2	6	183654	183659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473121
4023	NC_020969	GAA	2	6	183674	183679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473121
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4029	NC_020969	GTA	2	6	183958	183963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473121
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4031	NC_020969	GGA	3	9	184013	184021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473121
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4033	NC_020969	ATT	2	6	184048	184053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473121
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4035	NC_020969	T	8	8	184090	184097	0 %	100 %	0 %	0 %	478473121
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4038	NC_020969	TAT	2	6	184221	184226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_020969	GA	3	6	184261	184266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4044	NC_020969	CTG	2	6	184552	184557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473122
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4055	NC_020969	ATA	2	6	185474	185479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473123
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4057	NC_020969	GTT	2	6	185583	185588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_020969	TGC	2	6	185716	185721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473124
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4063	NC_020969	T	7	7	186006	186012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_020969	T	7	7	186018	186024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020969	T	7	7	186069	186075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_020969	A	7	7	186091	186097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_020969	T	6	6	186114	186119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4096	NC_020969	T	7	7	187256	187262	0 %	100 %	0 %	0 %	478473125
4097	NC_020969	A	6	6	187297	187302	100 %	0 %	0 %	0 %	478473125
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4104	NC_020969	TTA	2	6	187802	187807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473125
4105	NC_020969	ATC	2	6	187809	187814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_020969	CGATA	2	10	187837	187846	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4107	NC_020969	T	6	6	187850	187855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_020969	TCC	2	6	187870	187875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_020969	ACA	3	9	187876	187884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_020969	AGT	2	6	187894	187899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_020969	AAAC	2	8	187919	187926	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_020969	TGC	2	6	187985	187990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_020969	AGT	2	6	188053	188058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_020969	AGT	2	6	188076	188081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020969	TTG	2	6	188084	188089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_020969	TAT	2	6	188164	188169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020969	T	6	6	188183	188188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_020969	CTT	2	6	188251	188256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_020969	GGAC	2	8	188278	188285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_020969	AAG	2	6	188388	188393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020969	TTG	2	6	188410	188415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020969	CAT	2	6	188420	188425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_020969	T	7	7	188459	188465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020969	TAA	2	6	188538	188543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020969	TTG	2	6	188566	188571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020969	CTC	2	6	188641	188646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_020969	CAC	2	6	188687	188692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4373	NC_020969	GAA	2	6	200163	200168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473138
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