MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020969	CTA	2	6	114311	114316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473060
2502	NC_020969	TC	3	6	114338	114343	0 %	50 %	0 %	50 %	478473060
2503	NC_020969	CTC	2	6	114389	114394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_020969	A	7	7	114408	114414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020969	A	8	8	114417	114424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020969	GCTCT	2	10	114451	114460	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2507	NC_020969	ATT	2	6	114485	114490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020969	AGA	2	6	114513	114518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473061
2509	NC_020969	TTC	3	9	114519	114527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473061
2510	NC_020969	AG	3	6	114639	114644	50 %	0 %	50 %	0 %	478473061
2511	NC_020969	TAC	2	6	114753	114758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473061
2512	NC_020969	T	7	7	114842	114848	0 %	100 %	0 %	0 %	478473061
2513	NC_020969	CTTT	2	8	114850	114857	0 %	75 %	0 %	25 %	478473061
2514	NC_020969	ACAG	2	8	114862	114869	50 %	0 %	25 %	25 %	478473061
2515	NC_020969	T	6	6	114894	114899	0 %	100 %	0 %	0 %	478473061
2516	NC_020969	T	6	6	114924	114929	0 %	100 %	0 %	0 %	478473061
2517	NC_020969	CTG	2	6	115019	115024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473061
2518	NC_020969	TTC	2	6	115050	115055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473061
2519	NC_020969	TGTTT	2	10	115075	115084	0 %	80 %	20 %	0 %	478473061
2520	NC_020969	GA	4	8	115095	115102	50 %	0 %	50 %	0 %	478473061
2521	NC_020969	AGAA	2	8	115125	115132	75 %	0 %	25 %	0 %	478473061
2522	NC_020969	ACT	2	6	115135	115140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473061
2523	NC_020969	TCA	2	6	115147	115152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473061
2524	NC_020969	TTG	2	6	115156	115161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473061
2525	NC_020969	CTT	2	6	115232	115237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473061
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2527	NC_020969	GGA	2	6	115300	115305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473061
2528	NC_020969	TCT	2	6	115310	115315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473061
2529	NC_020969	TTTG	2	8	115343	115350	0 %	75 %	25 %	0 %	478473061
2530	NC_020969	GAT	2	6	115392	115397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473061
2531	NC_020969	CATGT	2	10	115453	115462	20 %	40 %	20 %	20 %	478473061
2532	NC_020969	TCT	2	6	115614	115619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473061
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2534	NC_020969	CGA	2	6	115636	115641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473061
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2537	NC_020969	GGAA	2	8	115732	115739	50 %	0 %	50 %	0 %	478473061
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2539	NC_020969	TTG	2	6	115853	115858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473061
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2541	NC_020969	ACTTCG	2	12	115915	115926	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478473061
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2543	NC_020969	CAA	2	6	116030	116035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473061
2544	NC_020969	TTC	3	9	116079	116087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473061
2545	NC_020969	TCT	2	6	116140	116145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473061
2546	NC_020969	AAGC	2	8	116149	116156	50 %	0 %	25 %	25 %	478473061
2547	NC_020969	TATCG	2	10	116157	116166	20 %	40 %	20 %	20 %	478473061
2548	NC_020969	T	6	6	116173	116178	0 %	100 %	0 %	0 %	478473061
2549	NC_020969	ATG	2	6	116214	116219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_020969	AGT	2	6	116248	116253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020969	A	6	6	116269	116274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_020969	TAA	2	6	116300	116305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020969	A	7	7	116322	116328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020969	TTTTAG	2	12	116350	116361	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020969	TG	3	6	116366	116371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020969	GGTT	2	8	116481	116488	0 %	50 %	50 %	0 %	478473062
2557	NC_020969	T	7	7	116497	116503	0 %	100 %	0 %	0 %	478473062
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2559	NC_020969	TTTCT	2	10	116673	116682	0 %	80 %	0 %	20 %	478473062
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2563	NC_020969	TTTG	2	8	117027	117034	0 %	75 %	25 %	0 %	478473062
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2567	NC_020969	A	6	6	117167	117172	100 %	0 %	0 %	0 %	478473062
2568	NC_020969	GTTC	2	8	117223	117230	0 %	50 %	25 %	25 %	478473062
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2592	NC_020969	T	6	6	118097	118102	0 %	100 %	0 %	0 %	478473064
2593	NC_020969	CA	3	6	118284	118289	50 %	0 %	0 %	50 %	478473064
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2596	NC_020969	TAA	2	6	118403	118408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_020969	AT	3	6	118490	118495	50 %	50 %	0 %	0 %	478473065
2598	NC_020969	T	6	6	118500	118505	0 %	100 %	0 %	0 %	478473065
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2609	NC_020969	CTC	2	6	118877	118882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473065
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2612	NC_020969	AG	4	8	118952	118959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_020969	CTT	2	6	118960	118965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_020969	TTA	2	6	118982	118987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473066
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2618	NC_020969	TTTA	2	8	119204	119211	25 %	75 %	0 %	0 %	478473066
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2626	NC_020969	GTT	2	6	119636	119641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473066
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2747	NC_020969	GCA	2	6	125169	125174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2998	NC_020969	TCA	2	6	136439	136444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473080
2999	NC_020969	GCTA	2	8	136481	136488	25 %	25 %	25 %	25 %	478473080
3000	NC_020969	CGC	2	6	136514	136519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478473080

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