MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020969	AC	3	6	611774	611779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13502	NC_020969	CCT	2	6	611826	611831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473517
13503	NC_020969	TCT	2	6	611899	611904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473517
13504	NC_020969	TTC	2	6	611928	611933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473517
13505	NC_020969	TGCCA	2	10	611960	611969	20 %	20 %	20 %	40 %	478473517
13506	NC_020969	GTA	2	6	612019	612024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473517
13507	NC_020969	CT	3	6	612025	612030	0 %	50 %	0 %	50 %	478473517
13508	NC_020969	GATT	2	8	612109	612116	25 %	50 %	25 %	0 %	478473517
13509	NC_020969	TCT	2	6	612136	612141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473517
13510	NC_020969	TC	3	6	612146	612151	0 %	50 %	0 %	50 %	478473517
13511	NC_020969	GGTT	2	8	612192	612199	0 %	50 %	50 %	0 %	478473517
13512	NC_020969	GGATGG	2	12	612204	612215	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478473517
13513	NC_020969	AG	4	8	612257	612264	50 %	0 %	50 %	0 %	478473517
13514	NC_020969	TGG	2	6	612270	612275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478473517
13515	NC_020969	ATA	2	6	612295	612300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473517
13516	NC_020969	GGCGC	2	10	612355	612364	0 %	0 %	60 %	40 %	478473517
13517	NC_020969	ATT	2	6	612381	612386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473517
13518	NC_020969	TAT	2	6	612389	612394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473517
13519	NC_020969	ATCG	2	8	612411	612418	25 %	25 %	25 %	25 %	478473517
13520	NC_020969	AGA	2	6	612473	612478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473517
13521	NC_020969	GAA	2	6	612495	612500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473517
13522	NC_020969	AG	3	6	612534	612539	50 %	0 %	50 %	0 %	478473517
13523	NC_020969	CT	3	6	612540	612545	0 %	50 %	0 %	50 %	478473517
13524	NC_020969	TTAC	2	8	612562	612569	25 %	50 %	0 %	25 %	478473517
13525	NC_020969	TAA	2	6	612578	612583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473517
13526	NC_020969	CCT	2	6	612607	612612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473517
13527	NC_020969	TTTA	2	8	612615	612622	25 %	75 %	0 %	0 %	478473517
13528	NC_020969	CT	3	6	612655	612660	0 %	50 %	0 %	50 %	478473517
13529	NC_020969	ATT	2	6	612679	612684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473517
13530	NC_020969	TTTG	2	8	612713	612720	0 %	75 %	25 %	0 %	478473517
13531	NC_020969	ATT	2	6	612731	612736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473517
13532	NC_020969	GGCT	2	8	612753	612760	0 %	25 %	50 %	25 %	478473517
13533	NC_020969	TCT	2	6	612805	612810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473517
13534	NC_020969	ATT	2	6	612818	612823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473517
13535	NC_020969	TGG	2	6	612867	612872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478473517
13536	NC_020969	T	6	6	612902	612907	0 %	100 %	0 %	0 %	478473517
13537	NC_020969	ATG	2	6	612924	612929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473517
13538	NC_020969	ATTGG	2	10	612930	612939	20 %	40 %	40 %	0 %	478473517
13539	NC_020969	A	6	6	612960	612965	100 %	0 %	0 %	0 %	478473517
13540	NC_020969	AGC	2	6	613013	613018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473517
13541	NC_020969	TTG	2	6	613075	613080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473517
13542	NC_020969	TCAA	2	8	613240	613247	50 %	25 %	0 %	25 %	478473518
13543	NC_020969	TTG	2	6	613253	613258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473518
13544	NC_020969	CGCT	2	8	613286	613293	0 %	25 %	25 %	50 %	478473518
13545	NC_020969	TTTG	2	8	613311	613318	0 %	75 %	25 %	0 %	478473518
13546	NC_020969	ATC	2	6	613366	613371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473518
13547	NC_020969	A	9	9	613411	613419	100 %	0 %	0 %	0 %	478473518
13548	NC_020969	CTT	2	6	613453	613458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473518
13549	NC_020969	GAA	2	6	613468	613473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473518
13550	NC_020969	TTTG	2	8	613487	613494	0 %	75 %	25 %	0 %	478473518
13551	NC_020969	CTCTC	2	10	613495	613504	0 %	40 %	0 %	60 %	478473518
13552	NC_020969	ATAG	2	8	613540	613547	50 %	25 %	25 %	0 %	478473518
13553	NC_020969	GAA	2	6	613633	613638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473518
13554	NC_020969	AAG	2	6	613679	613684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473518
13555	NC_020969	AGA	2	6	613719	613724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473518
13556	NC_020969	GAA	2	6	613741	613746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473518
13557	NC_020969	AAAAC	2	10	613755	613764	80 %	0 %	0 %	20 %	478473518
13558	NC_020969	AAC	2	6	613784	613789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473518
13559	NC_020969	GCTC	2	8	613884	613891	0 %	25 %	25 %	50 %	478473518
13560	NC_020969	AG	3	6	613918	613923	50 %	0 %	50 %	0 %	478473518
13561	NC_020969	TAG	2	6	613983	613988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473518
13562	NC_020969	ATTTT	2	10	613992	614001	20 %	80 %	0 %	0 %	478473518
13563	NC_020969	GCA	2	6	614032	614037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473518
13564	NC_020969	CTATC	2	10	614112	614121	20 %	40 %	0 %	40 %	478473518
13565	NC_020969	A	8	8	614141	614148	100 %	0 %	0 %	0 %	478473518
13566	NC_020969	AGA	2	6	614160	614165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473518
13567	NC_020969	CTT	2	6	614190	614195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473518
13568	NC_020969	AGA	2	6	614196	614201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473518
13569	NC_020969	AC	3	6	614231	614236	50 %	0 %	0 %	50 %	478473518
13570	NC_020969	TAT	3	9	614322	614330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473518
13571	NC_020969	ATT	2	6	614371	614376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473518
13572	NC_020969	TTC	2	6	614491	614496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473518
13573	NC_020969	TCA	2	6	614504	614509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473518
13574	NC_020969	CGATAT	3	18	614532	614549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478473518
13575	NC_020969	AG	3	6	614563	614568	50 %	0 %	50 %	0 %	478473518
13576	NC_020969	TTA	2	6	614573	614578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473518
13577	NC_020969	ATT	2	6	614620	614625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473518
13578	NC_020969	TGTA	2	8	614780	614787	25 %	50 %	25 %	0 %	478473518
13579	NC_020969	A	6	6	614824	614829	100 %	0 %	0 %	0 %	478473518
13580	NC_020969	TGC	2	6	614862	614867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473518
13581	NC_020969	T	6	6	614994	614999	0 %	100 %	0 %	0 %	478473518
13582	NC_020969	CA	3	6	615033	615038	50 %	0 %	0 %	50 %	478473518
13583	NC_020969	A	7	7	615049	615055	100 %	0 %	0 %	0 %	478473518
13584	NC_020969	TC	3	6	615107	615112	0 %	50 %	0 %	50 %	478473518
13585	NC_020969	TTC	2	6	615113	615118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473518
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13587	NC_020969	CAT	2	6	615257	615262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473518
13588	NC_020969	CGC	2	6	615421	615426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478473518
13589	NC_020969	GA	3	6	615467	615472	50 %	0 %	50 %	0 %	478473518
13590	NC_020969	TAA	2	6	615564	615569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473518
13591	NC_020969	ACA	2	6	615604	615609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473518
13592	NC_020969	GCC	2	6	615646	615651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478473518
13593	NC_020969	AAG	2	6	615701	615706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473518
13594	NC_020969	CCT	2	6	615733	615738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473518
13595	NC_020969	TTG	2	6	615839	615844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473518
13596	NC_020969	AG	4	8	615846	615853	50 %	0 %	50 %	0 %	478473518
13597	NC_020969	A	7	7	615854	615860	100 %	0 %	0 %	0 %	478473518
13598	NC_020969	A	6	6	615907	615912	100 %	0 %	0 %	0 %	478473518
13599	NC_020969	TGG	2	6	615938	615943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478473518
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13601	NC_020969	A	8	8	616028	616035	100 %	0 %	0 %	0 %	478473518
13602	NC_020969	GCT	2	6	616039	616044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473518
13603	NC_020969	T	7	7	616060	616066	0 %	100 %	0 %	0 %	478473518
13604	NC_020969	TC	3	6	616106	616111	0 %	50 %	0 %	50 %	478473518
13605	NC_020969	GTT	2	6	616143	616148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473518
13606	NC_020969	ATT	2	6	616273	616278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473518
13607	NC_020969	ACT	2	6	616306	616311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473518
13608	NC_020969	GCAGA	2	10	616324	616333	40 %	0 %	40 %	20 %	478473518
13609	NC_020969	A	6	6	616333	616338	100 %	0 %	0 %	0 %	478473518
13610	NC_020969	GAA	2	6	616426	616431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473518
13611	NC_020969	TTAT	2	8	616439	616446	25 %	75 %	0 %	0 %	478473518
13612	NC_020969	CGA	2	6	616545	616550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473518
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13614	NC_020969	A	7	7	616629	616635	100 %	0 %	0 %	0 %	478473518
13615	NC_020969	AG	3	6	616645	616650	50 %	0 %	50 %	0 %	478473518
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13617	NC_020969	TAAA	2	8	616679	616686	75 %	25 %	0 %	0 %	478473518
13618	NC_020969	TTAT	2	8	616702	616709	25 %	75 %	0 %	0 %	478473518
13619	NC_020969	CT	4	8	616750	616757	0 %	50 %	0 %	50 %	478473518
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13993	NC_020969	ATGCT	2	10	633476	633485	20 %	40 %	20 %	20 %	478473533
13994	NC_020969	ACGGA	2	10	633610	633619	40 %	0 %	40 %	20 %	478473533
13995	NC_020969	ATT	2	6	633629	633634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473533
13996	NC_020969	GGA	2	6	633687	633692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473533
13997	NC_020969	CTT	2	6	633735	633740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473533
13998	NC_020969	AGA	2	6	633759	633764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473533
13999	NC_020969	GATA	2	8	633843	633850	50 %	25 %	25 %	0 %	478473533
14000	NC_020969	TCT	2	6	633923	633928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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