MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020969	AATC	2	8	520520	520527	50 %	25 %	0 %	25 %	478473420
11503	NC_020969	AGCAC	2	10	520561	520570	40 %	0 %	20 %	40 %	478473420
11504	NC_020969	TAA	2	6	520578	520583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473420
11505	NC_020969	AAT	2	6	520672	520677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473420
11506	NC_020969	AGT	2	6	520764	520769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473420
11507	NC_020969	GAA	2	6	520796	520801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473420
11508	NC_020969	GAT	2	6	520811	520816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473420
11509	NC_020969	TTCTG	2	10	520828	520837	0 %	60 %	20 %	20 %	478473420
11510	NC_020969	AT	3	6	520887	520892	50 %	50 %	0 %	0 %	478473420
11511	NC_020969	TTG	2	6	520953	520958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473420
11512	NC_020969	CA	4	8	521003	521010	50 %	0 %	0 %	50 %	478473420
11513	NC_020969	ATCC	2	8	521046	521053	25 %	25 %	0 %	50 %	478473420
11514	NC_020969	ACT	2	6	521107	521112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473420
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11516	NC_020969	TCA	2	6	521177	521182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473420
11517	NC_020969	TC	4	8	521195	521202	0 %	50 %	0 %	50 %	478473420
11518	NC_020969	GAT	2	6	521274	521279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473420
11519	NC_020969	CAG	2	6	521322	521327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473420
11520	NC_020969	TAG	2	6	521345	521350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473420
11521	NC_020969	ATA	2	6	521494	521499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473420
11522	NC_020969	CAG	2	6	521568	521573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473420
11523	NC_020969	GTA	2	6	521607	521612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473420
11524	NC_020969	CAACA	2	10	521646	521655	60 %	0 %	0 %	40 %	478473420
11525	NC_020969	GA	3	6	521656	521661	50 %	0 %	50 %	0 %	478473420
11526	NC_020969	CTT	2	6	521705	521710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473420
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11528	NC_020969	CTCC	2	8	521884	521891	0 %	25 %	0 %	75 %	478473420
11529	NC_020969	T	6	6	521905	521910	0 %	100 %	0 %	0 %	478473420
11530	NC_020969	CTT	2	6	521924	521929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473420
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11533	NC_020969	AAG	2	6	522167	522172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473420
11534	NC_020969	GAG	2	6	522305	522310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473420
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11537	NC_020969	CTG	2	6	522458	522463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473420
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11541	NC_020969	TCT	2	6	522818	522823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473420
11542	NC_020969	TAC	2	6	522834	522839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473420
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11571	NC_020969	AT	3	6	524474	524479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_020969	AAAG	2	8	524487	524494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_020969	T	6	6	524535	524540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_020969	TTGGA	2	10	524558	524567	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_020969	T	6	6	524581	524586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11578	NC_020969	T	6	6	524714	524719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_020969	A	7	7	524765	524771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11582	NC_020969	CAA	2	6	524887	524892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473421
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11587	NC_020969	CTAA	2	8	525179	525186	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11588	NC_020969	AAT	2	6	525203	525208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_020969	ACTT	2	8	525213	525220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11590	NC_020969	GCT	2	6	525314	525319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_020969	CAAAA	2	10	525333	525342	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11592	NC_020969	AGA	2	6	525391	525396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_020969	ATA	2	6	525425	525430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020969	CTA	2	6	525499	525504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11596	NC_020969	CAT	3	9	525682	525690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473422
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11601	NC_020969	CT	3	6	525917	525922	0 %	50 %	0 %	50 %	478473422
11602	NC_020969	ACA	2	6	525993	525998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473422
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11605	NC_020969	A	7	7	526121	526127	100 %	0 %	0 %	0 %	478473422
11606	NC_020969	CAA	2	6	526337	526342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473422
11607	NC_020969	TAAA	2	8	526360	526367	75 %	25 %	0 %	0 %	478473422
11608	NC_020969	GTC	2	6	526426	526431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473423
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11610	NC_020969	TTC	2	6	526460	526465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473423
11611	NC_020969	CTT	2	6	526507	526512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473423
11612	NC_020969	TCC	2	6	526513	526518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473423
11613	NC_020969	TTTC	2	8	526577	526584	0 %	75 %	0 %	25 %	478473423
11614	NC_020969	TTCT	2	8	526687	526694	0 %	75 %	0 %	25 %	478473423
11615	NC_020969	CTT	2	6	526695	526700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473423
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11621	NC_020969	A	6	6	526939	526944	100 %	0 %	0 %	0 %	478473423
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