MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020969	TG	3	6	274696	274701	0 %	50 %	50 %	0 %	478473206
6003	NC_020969	TGG	2	6	274733	274738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478473206
6004	NC_020969	GCA	2	6	274761	274766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473206
6005	NC_020969	TCT	2	6	274791	274796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473206
6006	NC_020969	TCCCT	2	10	274875	274884	0 %	40 %	0 %	60 %	478473206
6007	NC_020969	ATT	2	6	274893	274898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473206
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6009	NC_020969	TCTT	2	8	274985	274992	0 %	75 %	0 %	25 %	478473206
6010	NC_020969	ATTT	2	8	275014	275021	25 %	75 %	0 %	0 %	478473206
6011	NC_020969	CAC	2	6	275052	275057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478473206
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6014	NC_020969	TCT	2	6	275165	275170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473206
6015	NC_020969	ATCCT	2	10	275179	275188	20 %	40 %	0 %	40 %	478473206
6016	NC_020969	GAT	2	6	275232	275237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473206
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6018	NC_020969	TGA	2	6	275391	275396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473207
6019	NC_020969	AGGAG	2	10	275430	275439	40 %	0 %	60 %	0 %	478473207
6020	NC_020969	GCT	2	6	275530	275535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473207
6021	NC_020969	TGGAAT	2	12	275541	275552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473207
6022	NC_020969	AGC	2	6	275556	275561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473207
6023	NC_020969	ATT	2	6	275581	275586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473207
6024	NC_020969	TC	3	6	275606	275611	0 %	50 %	0 %	50 %	478473207
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6028	NC_020969	GCT	2	6	275710	275715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473207
6029	NC_020969	CTT	2	6	275818	275823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473207
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6032	NC_020969	AAG	2	6	275945	275950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473207
6033	NC_020969	GCT	2	6	276004	276009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473207
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6037	NC_020969	CTC	2	6	276088	276093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473207
6038	NC_020969	A	7	7	276103	276109	100 %	0 %	0 %	0 %	478473207
6039	NC_020969	TTGTC	2	10	276117	276126	0 %	60 %	20 %	20 %	478473207
6040	NC_020969	GAA	2	6	276130	276135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473207
6041	NC_020969	ATT	2	6	276140	276145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473207
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6054	NC_020969	ACC	2	6	276721	276726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478473208
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6057	NC_020969	CT	3	6	276818	276823	0 %	50 %	0 %	50 %	478473208
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6108	NC_020969	GAA	2	6	278955	278960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473209
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6110	NC_020969	TC	3	6	278986	278991	0 %	50 %	0 %	50 %	478473209
6111	NC_020969	GAA	2	6	279003	279008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473209
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6113	NC_020969	CAT	2	6	279094	279099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473209
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6118	NC_020969	TCT	2	6	279627	279632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473209
6119	NC_020969	CAT	2	6	279750	279755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473209
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6121	NC_020969	AGA	2	6	279821	279826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473209
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6123	NC_020969	ATA	2	6	279910	279915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473209
6124	NC_020969	ACC	2	6	279933	279938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478473209
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6128	NC_020969	GTTT	2	8	280113	280120	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6225	NC_020969	CAAA	2	8	284529	284536	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6226	NC_020969	C	6	6	284691	284696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6227	NC_020969	AT	4	8	284750	284757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6235	NC_020969	CAC	2	6	285255	285260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478473213
6236	NC_020969	CCT	2	6	285289	285294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473213
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6238	NC_020969	AAGC	2	8	285359	285366	50 %	0 %	25 %	25 %	478473213
6239	NC_020969	ATG	2	6	285376	285381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473213
6240	NC_020969	T	6	6	285432	285437	0 %	100 %	0 %	0 %	478473213
6241	NC_020969	CTC	2	6	285438	285443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473213
6242	NC_020969	GAT	2	6	285487	285492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473213
6243	NC_020969	A	7	7	285493	285499	100 %	0 %	0 %	0 %	478473213
6244	NC_020969	AG	3	6	285560	285565	50 %	0 %	50 %	0 %	478473213
6245	NC_020969	CT	3	6	285602	285607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6497	NC_020969	AAAC	2	8	296507	296514	75 %	0 %	0 %	25 %	478473225
6498	NC_020969	ACT	2	6	296549	296554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473225
6499	NC_020969	ACT	2	6	296647	296652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473225
6500	NC_020969	AAG	2	6	296708	296713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473225

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