MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_020968	AGA	2	6	158577	158582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459592
3503	NC_020968	AAAG	2	8	158614	158621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_020968	TTTA	2	8	158623	158630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020968	CTA	2	6	158684	158689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_020968	AAG	2	6	158726	158731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_020968	TAAT	2	8	158740	158747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_020968	TCCTTG	2	12	158805	158816	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478459593
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3510	NC_020968	GTT	2	6	158843	158848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459593
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3512	NC_020968	TTA	2	6	159014	159019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459593
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3518	NC_020968	T	6	6	159245	159250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_020968	T	7	7	159369	159375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_020968	ATT	2	6	159488	159493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_020968	T	7	7	159518	159524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020968	A	7	7	159552	159558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_020968	TAAT	2	8	159576	159583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3608	NC_020968	CCT	2	6	164070	164075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459597
3609	NC_020968	GT	3	6	164089	164094	0 %	50 %	50 %	0 %	478459597
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3615	NC_020968	TCAA	2	8	164300	164307	50 %	25 %	0 %	25 %	478459598
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3623	NC_020968	GGA	2	6	164827	164832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459598
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3999	NC_020968	AGA	2	6	182504	182509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459608
4000	NC_020968	GAA	2	6	182517	182522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459608

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