MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19153	NC_020968	TAGA	2	8	866858	866865	50 %	25 %	25 %	0 %	478460211
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19156	NC_020968	GCT	2	6	866977	866982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478460211
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19162	NC_020968	AG	3	6	867174	867179	50 %	0 %	50 %	0 %	478460211
19163	NC_020968	GAG	2	6	867296	867301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478460211
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19191	NC_020968	ATC	2	6	868517	868522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460212
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19209	NC_020968	AGT	2	6	869531	869536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460213
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19213	NC_020968	AG	3	6	870154	870159	50 %	0 %	50 %	0 %	478460213
19214	NC_020968	TAA	2	6	870193	870198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478460213
19215	NC_020968	A	9	9	870242	870250	100 %	0 %	0 %	0 %	478460213
19216	NC_020968	TA	3	6	870292	870297	50 %	50 %	0 %	0 %	478460213
19217	NC_020968	GGA	2	6	870312	870317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478460213
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19219	NC_020968	CCTCTA	2	12	870382	870393	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19220	NC_020968	CTT	2	6	870429	870434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478460214
19221	NC_020968	T	6	6	870477	870482	0 %	100 %	0 %	0 %	478460214
19222	NC_020968	TTTG	2	8	870486	870493	0 %	75 %	25 %	0 %	478460214
19223	NC_020968	CTG	2	6	870508	870513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478460214
19224	NC_020968	AT	3	6	870515	870520	50 %	50 %	0 %	0 %	478460214
19225	NC_020968	CTT	2	6	870642	870647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478460214
19226	NC_020968	CTC	2	6	870661	870666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478460214
19227	NC_020968	T	6	6	870687	870692	0 %	100 %	0 %	0 %	478460214
19228	NC_020968	TA	3	6	870724	870729	50 %	50 %	0 %	0 %	478460214
19229	NC_020968	GC	3	6	870742	870747	0 %	0 %	50 %	50 %	478460214
19230	NC_020968	ATC	2	6	870772	870777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460214
19231	NC_020968	T	6	6	870823	870828	0 %	100 %	0 %	0 %	478460214
19232	NC_020968	CTC	2	6	870903	870908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478460214
19233	NC_020968	TTG	2	6	871180	871185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478460214
19234	NC_020968	GCAT	2	8	871223	871230	25 %	25 %	25 %	25 %	478460214
19235	NC_020968	TGC	2	6	871360	871365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478460214
19236	NC_020968	TTC	2	6	871375	871380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478460214
19237	NC_020968	AGG	2	6	871423	871428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478460214
19238	NC_020968	GA	3	6	871438	871443	50 %	0 %	50 %	0 %	478460214
19239	NC_020968	AG	3	6	871465	871470	50 %	0 %	50 %	0 %	478460214
19240	NC_020968	GTT	2	6	871566	871571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478460214
19241	NC_020968	TCA	2	6	871574	871579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460214
19242	NC_020968	ATA	2	6	871580	871585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478460214
19243	NC_020968	T	7	7	871680	871686	0 %	100 %	0 %	0 %	478460214
19244	NC_020968	CAGCC	2	10	871735	871744	20 %	0 %	20 %	60 %	478460214
19245	NC_020968	CTTG	2	8	871809	871816	0 %	50 %	25 %	25 %	478460214
19246	NC_020968	CA	4	8	871824	871831	50 %	0 %	0 %	50 %	478460214
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19500	NC_020968	CTTTT	2	10	885862	885871	0 %	80 %	0 %	20 %	478460219

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