MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14003	NC_020968	ATGCT	2	10	633458	633467	20 %	40 %	20 %	20 %	478460023
14004	NC_020968	GT	3	6	633578	633583	0 %	50 %	50 %	0 %	478460023
14005	NC_020968	ACGGA	2	10	633592	633601	40 %	0 %	40 %	20 %	478460023
14006	NC_020968	ATT	2	6	633611	633616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478460023
14007	NC_020968	GGA	2	6	633669	633674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478460023
14008	NC_020968	CTT	2	6	633717	633722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478460023
14009	NC_020968	AGA	2	6	633741	633746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460023
14010	NC_020968	GATA	2	8	633825	633832	50 %	25 %	25 %	0 %	478460023
14011	NC_020968	TCT	2	6	633905	633910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_020968	AT	3	6	633929	633934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_020968	A	8	8	633937	633944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_020968	T	6	6	633968	633973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_020968	A	6	6	634035	634040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_020968	CCTG	2	8	634126	634133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14017	NC_020968	AT	3	6	634188	634193	50 %	50 %	0 %	0 %	478460024
14018	NC_020968	GTC	2	6	634206	634211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478460024
14019	NC_020968	TAA	2	6	634214	634219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478460024
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14021	NC_020968	TC	3	6	634226	634231	0 %	50 %	0 %	50 %	478460024
14022	NC_020968	AAG	2	6	634285	634290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460024
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14033	NC_020968	GATT	2	8	634858	634865	25 %	50 %	25 %	0 %	478460025
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14055	NC_020968	ATG	3	9	635664	635672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460025
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14057	NC_020968	CTA	2	6	635742	635747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460025
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14093	NC_020968	CTCC	2	8	636961	636968	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14094	NC_020968	A	6	6	636969	636974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14102	NC_020968	TG	3	6	637375	637380	0 %	50 %	50 %	0 %	478460028
14103	NC_020968	GAG	2	6	637436	637441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478460028
14104	NC_020968	CT	3	6	637442	637447	0 %	50 %	0 %	50 %	478460028
14105	NC_020968	T	7	7	637481	637487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_020968	ATTAA	2	10	637494	637503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_020968	A	6	6	637548	637553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_020968	CAG	2	6	637638	637643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478460029
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14111	NC_020968	GCA	2	6	637769	637774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478460029
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14113	NC_020968	CG	3	6	637811	637816	0 %	0 %	50 %	50 %	478460029
14114	NC_020968	GAA	2	6	637884	637889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460029
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14118	NC_020968	AGCA	2	8	638092	638099	50 %	0 %	25 %	25 %	478460029
14119	NC_020968	GAA	2	6	638192	638197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478460029
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14123	NC_020968	GCTCT	2	10	638346	638355	0 %	40 %	20 %	40 %	478460029
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14151	NC_020968	ACGA	2	8	639379	639386	50 %	0 %	25 %	25 %	478460031
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14156	NC_020968	ACA	2	6	639541	639546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478460032
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14162	NC_020968	CAC	2	6	639625	639630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478460032
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14164	NC_020968	CAT	2	6	639702	639707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460032
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14169	NC_020968	TTC	2	6	639871	639876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478460032
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14198	NC_020968	CCT	2	6	641075	641080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14489	NC_020968	A	7	7	654369	654375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14490	NC_020968	A	7	7	654403	654409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14491	NC_020968	A	6	6	654419	654424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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