MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020968	AAT	2	6	520342	520347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459908
11503	NC_020968	AGT	2	6	520434	520439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459908
11504	NC_020968	GAA	2	6	520466	520471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459908
11505	NC_020968	GAT	2	6	520481	520486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459908
11506	NC_020968	TTCTG	2	10	520498	520507	0 %	60 %	20 %	20 %	478459908
11507	NC_020968	AT	3	6	520557	520562	50 %	50 %	0 %	0 %	478459908
11508	NC_020968	TTG	2	6	520623	520628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459908
11509	NC_020968	CA	4	8	520673	520680	50 %	0 %	0 %	50 %	478459908
11510	NC_020968	ATCC	2	8	520716	520723	25 %	25 %	0 %	50 %	478459908
11511	NC_020968	ACT	2	6	520777	520782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459908
11512	NC_020968	AAG	2	6	520816	520821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459908
11513	NC_020968	TCA	2	6	520847	520852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459908
11514	NC_020968	TC	4	8	520865	520872	0 %	50 %	0 %	50 %	478459908
11515	NC_020968	GAT	2	6	520944	520949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459908
11516	NC_020968	CAG	2	6	520992	520997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459908
11517	NC_020968	TAG	2	6	521015	521020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459908
11518	NC_020968	ATA	2	6	521164	521169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459908
11519	NC_020968	CAG	2	6	521238	521243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459908
11520	NC_020968	GTA	2	6	521277	521282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459908
11521	NC_020968	CAACA	2	10	521316	521325	60 %	0 %	0 %	40 %	478459908
11522	NC_020968	GA	3	6	521326	521331	50 %	0 %	50 %	0 %	478459908
11523	NC_020968	CTT	2	6	521375	521380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459908
11524	NC_020968	CTCC	2	8	521554	521561	0 %	25 %	0 %	75 %	478459908
11525	NC_020968	T	6	6	521575	521580	0 %	100 %	0 %	0 %	478459908
11526	NC_020968	CTT	2	6	521594	521599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459908
11527	NC_020968	TTG	2	6	521628	521633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459908
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11533	NC_020968	AGA	2	6	522117	522122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459908
11534	NC_020968	CTG	2	6	522128	522133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459908
11535	NC_020968	TCA	2	6	522220	522225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459908
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11537	NC_020968	CCT	2	6	522301	522306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459908
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11539	NC_020968	TAC	2	6	522504	522509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459908
11540	NC_020968	TGT	2	6	522694	522699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459908
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11543	NC_020968	GCC	2	6	522988	522993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478459908
11544	NC_020968	AACT	2	8	523113	523120	50 %	25 %	0 %	25 %	478459908
11545	NC_020968	AGC	2	6	523131	523136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459908
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11551	NC_020968	CTTC	2	8	523313	523320	0 %	50 %	0 %	50 %	478459908
11552	NC_020968	TGT	2	6	523330	523335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459908
11553	NC_020968	ATAA	2	8	523534	523541	75 %	25 %	0 %	0 %	478459908
11554	NC_020968	TTG	2	6	523544	523549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459908
11555	NC_020968	AAAG	2	8	523603	523610	75 %	0 %	25 %	0 %	478459908
11556	NC_020968	AAG	2	6	523625	523630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459908
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11561	NC_020968	TCT	2	6	523762	523767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459908
11562	NC_020968	TGC	2	6	523810	523815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459908
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11564	NC_020968	AAT	3	9	524013	524021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459908
11565	NC_020968	AGC	2	6	524110	524115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_020968	GAAG	2	8	524118	524125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_020968	AT	3	6	524144	524149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020968	AAAG	2	8	524157	524164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_020968	T	6	6	524205	524210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_020968	TTGGA	2	10	524228	524237	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_020968	T	6	6	524251	524256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_020968	ACA	2	6	524259	524264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_020968	AACC	2	8	524292	524299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11574	NC_020968	A	7	7	524363	524369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_020968	T	6	6	524385	524390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_020968	A	7	7	524436	524442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11580	NC_020968	GAACT	2	10	524715	524724	40 %	20 %	20 %	20 %	478459909
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11585	NC_020968	CTAA	2	8	524850	524857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11587	NC_020968	ACTT	2	8	524884	524891	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11588	NC_020968	GCT	2	6	524975	524980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_020968	CAAAA	2	10	524994	525003	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11590	NC_020968	AGA	2	6	525052	525057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_020968	ATA	2	6	525086	525091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_020968	CTA	2	6	525160	525165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_020968	CTTTAG	2	12	525270	525281	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478459910
11594	NC_020968	TCCC	2	8	525323	525330	0 %	25 %	0 %	75 %	478459910
11595	NC_020968	CAT	3	9	525343	525351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459910
11596	NC_020968	TCG	2	6	525361	525366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459910
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11601	NC_020968	ACA	2	6	525654	525659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459910
11602	NC_020968	CCT	2	6	525669	525674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459910
11603	NC_020968	ATTA	2	8	525716	525723	50 %	50 %	0 %	0 %	478459910
11604	NC_020968	A	7	7	525782	525788	100 %	0 %	0 %	0 %	478459910
11605	NC_020968	CAA	2	6	525998	526003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459910
11606	NC_020968	TAAA	2	8	526021	526028	75 %	25 %	0 %	0 %	478459910
11607	NC_020968	GTC	2	6	526087	526092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459911
11608	NC_020968	TTC	2	6	526100	526105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459911
11609	NC_020968	TTC	2	6	526121	526126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459911
11610	NC_020968	CTT	2	6	526168	526173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459911
11611	NC_020968	TCC	2	6	526174	526179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459911
11612	NC_020968	TTTC	2	8	526238	526245	0 %	75 %	0 %	25 %	478459911
11613	NC_020968	TTCT	2	8	526348	526355	0 %	75 %	0 %	25 %	478459911
11614	NC_020968	CTT	2	6	526356	526361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459911
11615	NC_020968	GTT	2	6	526431	526436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459911
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11619	NC_020968	CTT	2	6	526578	526583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459911
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11621	NC_020968	AGT	2	6	526638	526643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459911
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