MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_020968	TGC	2	6	497997	498002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459886
11003	NC_020968	ATG	2	6	498093	498098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459886
11004	NC_020968	TAT	2	6	498102	498107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459886
11005	NC_020968	AGC	2	6	498166	498171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459886
11006	NC_020968	TTC	2	6	498226	498231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459886
11007	NC_020968	ATTTC	2	10	498236	498245	20 %	60 %	0 %	20 %	478459886
11008	NC_020968	ATT	2	6	498276	498281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459886
11009	NC_020968	AGA	2	6	498295	498300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459886
11010	NC_020968	AGC	2	6	498313	498318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459886
11011	NC_020968	ATACT	2	10	498355	498364	40 %	40 %	0 %	20 %	478459886
11012	NC_020968	TAT	2	6	498422	498427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459886
11013	NC_020968	CAA	2	6	498440	498445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459886
11014	NC_020968	CCTA	2	8	498480	498487	25 %	25 %	0 %	50 %	478459886
11015	NC_020968	TC	3	6	498549	498554	0 %	50 %	0 %	50 %	478459887
11016	NC_020968	TTG	2	6	498649	498654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459887
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11021	NC_020968	TATCC	2	10	498796	498805	20 %	40 %	0 %	40 %	478459887
11022	NC_020968	GGA	2	6	498846	498851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459887
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11051	NC_020968	GTC	2	6	500123	500128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459888
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11057	NC_020968	ATC	2	6	500452	500457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459889
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11061	NC_020968	A	6	6	500599	500604	100 %	0 %	0 %	0 %	478459889
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11101	NC_020968	TGA	2	6	503167	503172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11103	NC_020968	TAACTA	2	12	503210	503221	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11104	NC_020968	AAGAAA	2	12	503223	503234	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_020968	AAG	2	6	503343	503348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_020968	CTA	2	6	503353	503358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_020968	A	6	6	503361	503366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_020968	CTTCT	2	10	503368	503377	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11109	NC_020968	A	8	8	503382	503389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_020968	ATCC	2	8	503456	503463	25 %	25 %	0 %	50 %	478459892
11111	NC_020968	CTG	2	6	503480	503485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459892
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11117	NC_020968	CTC	2	6	503787	503792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459892
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11119	NC_020968	CT	3	6	503835	503840	0 %	50 %	0 %	50 %	478459892
11120	NC_020968	TCC	2	6	503860	503865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459892
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11494	NC_020968	CAT	2	6	520061	520066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459908
11495	NC_020968	TCT	2	6	520108	520113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459908
11496	NC_020968	AAT	2	6	520128	520133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459908
11497	NC_020968	TCA	2	6	520166	520171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459908
11498	NC_020968	TTGC	2	8	520181	520188	0 %	50 %	25 %	25 %	478459908
11499	NC_020968	AATC	2	8	520190	520197	50 %	25 %	0 %	25 %	478459908
11500	NC_020968	AGCAC	2	10	520231	520240	40 %	0 %	20 %	40 %	478459908

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