MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_020968	TCCA	2	8	340658	340665	25 %	25 %	0 %	50 %	478459754
7503	NC_020968	TA	3	6	340767	340772	50 %	50 %	0 %	0 %	478459754
7504	NC_020968	CAT	2	6	340797	340802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459754
7505	NC_020968	GAA	2	6	340848	340853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459754
7506	NC_020968	GA	3	6	340861	340866	50 %	0 %	50 %	0 %	478459754
7507	NC_020968	GCT	2	6	340905	340910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459754
7508	NC_020968	TCC	2	6	341017	341022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459754
7509	NC_020968	CAGAG	2	10	341029	341038	40 %	0 %	40 %	20 %	478459754
7510	NC_020968	CGC	2	6	341041	341046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478459754
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7512	NC_020968	CAA	2	6	341104	341109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459755
7513	NC_020968	AT	3	6	341135	341140	50 %	50 %	0 %	0 %	478459755
7514	NC_020968	CA	3	6	341174	341179	50 %	0 %	0 %	50 %	478459755
7515	NC_020968	ACTG	2	8	341246	341253	25 %	25 %	25 %	25 %	478459755
7516	NC_020968	CAT	2	6	341278	341283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459755
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7518	NC_020968	TGA	2	6	341321	341326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459755
7519	NC_020968	CAGA	2	8	341335	341342	50 %	0 %	25 %	25 %	478459755
7520	NC_020968	AAT	2	6	341345	341350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459755
7521	NC_020968	ACT	2	6	341463	341468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459755
7522	NC_020968	AT	3	6	341481	341486	50 %	50 %	0 %	0 %	478459755
7523	NC_020968	T	7	7	341510	341516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_020968	A	7	7	341518	341524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_020968	T	6	6	341575	341580	0 %	100 %	0 %	0 %	478459756
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7529	NC_020968	CCA	2	6	341928	341933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478459756
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7543	NC_020968	TGT	2	6	342370	342375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459756
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7546	NC_020968	A	7	7	342497	342503	100 %	0 %	0 %	0 %	478459756
7547	NC_020968	TAA	2	6	342525	342530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459756
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7549	NC_020968	A	6	6	342548	342553	100 %	0 %	0 %	0 %	478459756
7550	NC_020968	CTTCA	2	10	342727	342736	20 %	40 %	0 %	40 %	478459756
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7558	NC_020968	CTG	2	6	343308	343313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459756
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7565	NC_020968	T	6	6	343620	343625	0 %	100 %	0 %	0 %	478459757
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7609	NC_020968	CA	3	6	346389	346394	50 %	0 %	0 %	50 %	478459759
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