MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020968	T	6	6	251122	251127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_020968	T	7	7	251141	251147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_020968	A	6	6	251149	251154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020968	ACA	2	6	251249	251254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_020968	CTT	2	6	251256	251261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_020968	AAG	2	6	251287	251292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_020968	GCA	2	6	251306	251311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_020968	TTG	2	6	251326	251331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_020968	CAAA	2	8	251490	251497	75 %	0 %	0 %	25 %	478459673
5510	NC_020968	ATA	2	6	251513	251518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459673
5511	NC_020968	CAAT	2	8	251600	251607	50 %	25 %	0 %	25 %	478459673
5512	NC_020968	CTTT	3	12	251652	251663	0 %	75 %	0 %	25 %	478459673
5513	NC_020968	CGA	2	6	251694	251699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459673
5514	NC_020968	CTT	2	6	251705	251710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459673
5515	NC_020968	ACA	2	6	251727	251732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459673
5516	NC_020968	CTC	2	6	251746	251751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_020968	CAA	2	6	251790	251795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_020968	AG	3	6	251835	251840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_020968	A	8	8	251841	251848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_020968	AAG	2	6	251859	251864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_020968	CAT	4	12	251909	251920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459674
5522	NC_020968	TTA	2	6	252055	252060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459674
5523	NC_020968	CTC	2	6	252086	252091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459674
5524	NC_020968	AGT	2	6	252110	252115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459674
5525	NC_020968	GCAG	2	8	252157	252164	25 %	0 %	50 %	25 %	478459674
5526	NC_020968	TCTT	2	8	252174	252181	0 %	75 %	0 %	25 %	478459674
5527	NC_020968	C	7	7	252186	252192	0 %	0 %	0 %	100 %	478459674
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5530	NC_020968	TC	3	6	252276	252281	0 %	50 %	0 %	50 %	478459674
5531	NC_020968	TTG	2	6	252333	252338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459674
5532	NC_020968	TCT	2	6	252355	252360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459674
5533	NC_020968	CAA	2	6	252412	252417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459674
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5535	NC_020968	GGC	2	6	252496	252501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478459674
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5537	NC_020968	CAC	2	6	252533	252538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478459674
5538	NC_020968	CAG	2	6	252539	252544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459674
5539	NC_020968	T	8	8	252608	252615	0 %	100 %	0 %	0 %	478459674
5540	NC_020968	TCC	2	6	252699	252704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_020968	GAAA	2	8	252720	252727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_020968	T	7	7	252741	252747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_020968	GCAG	2	8	252769	252776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_020968	AGAA	2	8	252802	252809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_020968	AG	3	6	252844	252849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_020968	TAT	2	6	252867	252872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_020968	ACA	2	6	252908	252913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_020968	A	6	6	252957	252962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020968	TTG	2	6	253137	253142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459675
5550	NC_020968	TCT	2	6	253159	253164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459675
5551	NC_020968	TC	3	6	253206	253211	0 %	50 %	0 %	50 %	478459675
5552	NC_020968	T	7	7	253242	253248	0 %	100 %	0 %	0 %	478459675
5553	NC_020968	CCA	2	6	253255	253260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478459675
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5555	NC_020968	AATA	2	8	253362	253369	75 %	25 %	0 %	0 %	478459675
5556	NC_020968	GCT	2	6	253372	253377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459675
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5558	NC_020968	CCA	2	6	253469	253474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478459675
5559	NC_020968	CAA	2	6	253517	253522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459675
5560	NC_020968	CCCA	2	8	253625	253632	25 %	0 %	0 %	75 %	478459676
5561	NC_020968	CTT	2	6	253754	253759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459676
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5572	NC_020968	TAA	2	6	254081	254086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5591	NC_020968	TA	3	6	254651	254656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_020968	CCAA	2	8	254686	254693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_020968	A	7	7	254710	254716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5598	NC_020968	CGA	2	6	254956	254961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459678
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5601	NC_020968	A	6	6	255120	255125	100 %	0 %	0 %	0 %	478459678
5602	NC_020968	A	7	7	255151	255157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_020968	ATA	2	6	255164	255169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_020968	AACCCT	2	12	255210	255221	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5609	NC_020968	TTA	2	6	255620	255625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459679
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5611	NC_020968	T	6	6	255695	255700	0 %	100 %	0 %	0 %	478459679
5612	NC_020968	CA	3	6	255754	255759	50 %	0 %	0 %	50 %	478459679
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5618	NC_020968	TAG	2	6	255983	255988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_020968	ATTTTT	2	12	256003	256014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_020968	GAG	2	6	256131	256136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5622	NC_020968	T	6	6	256147	256152	0 %	100 %	0 %	0 %	478459680
5623	NC_020968	ACG	2	6	256153	256158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459680
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