MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020968	GAG	2	6	227528	227533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459653
5003	NC_020968	CT	3	6	227574	227579	0 %	50 %	0 %	50 %	478459653
5004	NC_020968	TCGA	2	8	227623	227630	25 %	25 %	25 %	25 %	478459653
5005	NC_020968	TCC	2	6	227640	227645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459653
5006	NC_020968	GAT	2	6	227673	227678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459653
5007	NC_020968	ATG	2	6	227710	227715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459653
5008	NC_020968	CAT	2	6	227748	227753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459653
5009	NC_020968	G	6	6	227754	227759	0 %	0 %	100 %	0 %	478459653
5010	NC_020968	AAG	2	6	227780	227785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459653
5011	NC_020968	TAA	2	6	227844	227849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459653
5012	NC_020968	GCAACG	2	12	227862	227873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459653
5013	NC_020968	GT	3	6	227896	227901	0 %	50 %	50 %	0 %	478459653
5014	NC_020968	AATT	2	8	227909	227916	50 %	50 %	0 %	0 %	478459653
5015	NC_020968	ATTT	2	8	227972	227979	25 %	75 %	0 %	0 %	478459653
5016	NC_020968	T	6	6	228009	228014	0 %	100 %	0 %	0 %	478459653
5017	NC_020968	TCA	2	6	228017	228022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459653
5018	NC_020968	CTG	2	6	228035	228040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459653
5019	NC_020968	TAG	2	6	228086	228091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459653
5020	NC_020968	CTT	2	6	228148	228153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459653
5021	NC_020968	T	8	8	228222	228229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_020968	TGT	2	6	228291	228296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020968	TCCT	2	8	228372	228379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_020968	AGA	2	6	228424	228429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_020968	ATT	2	6	228461	228466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_020968	TTC	2	6	228545	228550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459654
5027	NC_020968	GAA	2	6	228619	228624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459654
5028	NC_020968	TGA	2	6	228651	228656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459654
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5030	NC_020968	AGA	2	6	228792	228797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459654
5031	NC_020968	TC	3	6	228798	228803	0 %	50 %	0 %	50 %	478459654
5032	NC_020968	TGA	2	6	228825	228830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459654
5033	NC_020968	TCG	2	6	228914	228919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459654
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5035	NC_020968	CCTT	2	8	228994	229001	0 %	50 %	0 %	50 %	478459654
5036	NC_020968	TTG	2	6	229016	229021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459654
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5038	NC_020968	GATA	2	8	229089	229096	50 %	25 %	25 %	0 %	478459654
5039	NC_020968	ATT	2	6	229129	229134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459654
5040	NC_020968	GAA	2	6	229138	229143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459654
5041	NC_020968	TCCTC	2	10	229169	229178	0 %	40 %	0 %	60 %	478459654
5042	NC_020968	AGA	2	6	229203	229208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459654
5043	NC_020968	CTT	2	6	229295	229300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459655
5044	NC_020968	TAC	2	6	229397	229402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459655
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5046	NC_020968	TCT	2	6	229466	229471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459655
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5052	NC_020968	TAT	2	6	229871	229876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459655
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5056	NC_020968	ATT	2	6	230082	230087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459655
5057	NC_020968	CAA	2	6	230149	230154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459655
5058	NC_020968	TTCT	2	8	230218	230225	0 %	75 %	0 %	25 %	478459655
5059	NC_020968	ACT	2	6	230229	230234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459655
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5062	NC_020968	TTAT	2	8	230380	230387	25 %	75 %	0 %	0 %	478459655
5063	NC_020968	CTAT	2	8	230399	230406	25 %	50 %	0 %	25 %	478459655
5064	NC_020968	TCTT	2	8	230446	230453	0 %	75 %	0 %	25 %	478459655
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5071	NC_020968	TGG	3	9	230661	230669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478459655
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5112	NC_020968	C	6	6	232916	232921	0 %	0 %	0 %	100 %	478459657
5113	NC_020968	A	6	6	232956	232961	100 %	0 %	0 %	0 %	478459657
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5122	NC_020968	GCTA	2	8	233350	233357	25 %	25 %	25 %	25 %	478459658
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5497	NC_020968	GA	3	6	250923	250928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_020968	ACT	2	6	250983	250988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5499	NC_020968	TG	3	6	251033	251038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_020968	AATA	2	8	251100	251107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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