MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19125	NC_020965	GCA	2	6	865898	865903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458407
19126	NC_020965	TTC	2	6	865940	865945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458407
19127	NC_020965	ATT	2	6	866114	866119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458407
19128	NC_020965	ATT	2	6	866144	866149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458407
19129	NC_020965	TTG	2	6	866163	866168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458407
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19131	NC_020965	TAT	2	6	866301	866306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458407
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19141	NC_020965	TAGA	2	8	866744	866751	50 %	25 %	25 %	0 %	478458408
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19144	NC_020965	GCT	2	6	866863	866868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458408
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19151	NC_020965	GAG	2	6	867182	867187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458408
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19154	NC_020965	AT	3	6	867428	867433	50 %	50 %	0 %	0 %	478458408
19155	NC_020965	TCT	2	6	867480	867485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458408
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19160	NC_020965	TTTG	2	8	867584	867591	0 %	75 %	25 %	0 %	478458408
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19162	NC_020965	TA	3	6	867665	867670	50 %	50 %	0 %	0 %	478458408
19163	NC_020965	GT	3	6	867712	867717	0 %	50 %	50 %	0 %	478458408
19164	NC_020965	CAT	2	6	867722	867727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458408
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19166	NC_020965	TTG	2	6	867771	867776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458408
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19201	NC_020965	AG	3	6	870040	870045	50 %	0 %	50 %	0 %	478458410
19202	NC_020965	TAA	2	6	870079	870084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458410
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19204	NC_020965	TA	3	6	870178	870183	50 %	50 %	0 %	0 %	478458410
19205	NC_020965	GGA	2	6	870198	870203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458410
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19207	NC_020965	CCTCTA	2	12	870268	870279	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19210	NC_020965	TTTG	2	8	870372	870379	0 %	75 %	25 %	0 %	478458411
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19213	NC_020965	CTT	2	6	870528	870533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458411
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19216	NC_020965	TA	3	6	870610	870615	50 %	50 %	0 %	0 %	478458411
19217	NC_020965	GC	3	6	870628	870633	0 %	0 %	50 %	50 %	478458411
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19220	NC_020965	CTC	2	6	870789	870794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458411
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19223	NC_020965	TGC	2	6	871246	871251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458411
19224	NC_020965	TTC	2	6	871261	871266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458411
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19226	NC_020965	GA	3	6	871324	871329	50 %	0 %	50 %	0 %	478458411
19227	NC_020965	AG	3	6	871351	871356	50 %	0 %	50 %	0 %	478458411
19228	NC_020965	GTT	2	6	871452	871457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458411
19229	NC_020965	TCA	2	6	871460	871465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458411
19230	NC_020965	ATA	2	6	871466	871471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458411
19231	NC_020965	T	7	7	871566	871572	0 %	100 %	0 %	0 %	478458411
19232	NC_020965	CAGCC	2	10	871621	871630	20 %	0 %	20 %	60 %	478458411
19233	NC_020965	CTTG	2	8	871695	871702	0 %	50 %	25 %	25 %	478458411
19234	NC_020965	CA	4	8	871710	871717	50 %	0 %	0 %	50 %	478458411
19235	NC_020965	CAT	2	6	871801	871806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458411
19236	NC_020965	TTC	2	6	871849	871854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458411
19237	NC_020965	GATA	2	8	871902	871909	50 %	25 %	25 %	0 %	478458411
19238	NC_020965	TCG	2	6	871996	872001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458411
19239	NC_020965	GAT	2	6	872148	872153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458411
19240	NC_020965	TC	3	6	872211	872216	0 %	50 %	0 %	50 %	478458411
19241	NC_020965	CTT	2	6	872235	872240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458411
19242	NC_020965	GTA	2	6	872246	872251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458411
19243	NC_020965	GTT	2	6	872265	872270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458411
19244	NC_020965	GGA	2	6	872280	872285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458411
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19500	NC_020965	GAA	2	6	886327	886332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458417

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