MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020965	A	8	8	633810	633817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_020965	T	6	6	633841	633846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_020965	A	6	6	633908	633913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_020965	CCTG	2	8	633999	634006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14005	NC_020965	AT	3	6	634061	634066	50 %	50 %	0 %	0 %	478458221
14006	NC_020965	GTC	2	6	634079	634084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458221
14007	NC_020965	TAA	2	6	634087	634092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458221
14008	NC_020965	A	6	6	634091	634096	100 %	0 %	0 %	0 %	478458221
14009	NC_020965	TC	3	6	634099	634104	0 %	50 %	0 %	50 %	478458221
14010	NC_020965	AAG	2	6	634158	634163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458221
14011	NC_020965	GAA	2	6	634193	634198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458221
14012	NC_020965	AGGA	2	8	634239	634246	50 %	0 %	50 %	0 %	478458221
14013	NC_020965	TTA	2	6	634278	634283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458221
14014	NC_020965	CCTC	2	8	634317	634324	0 %	25 %	0 %	75 %	478458221
14015	NC_020965	ATC	2	6	634355	634360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458221
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14017	NC_020965	A	7	7	634501	634507	100 %	0 %	0 %	0 %	478458221
14018	NC_020965	CT	3	6	634535	634540	0 %	50 %	0 %	50 %	478458221
14019	NC_020965	A	6	6	634661	634666	100 %	0 %	0 %	0 %	478458221
14020	NC_020965	AAGA	2	8	634703	634710	75 %	0 %	25 %	0 %	478458221
14021	NC_020965	GATT	2	8	634731	634738	25 %	50 %	25 %	0 %	478458222
14022	NC_020965	TCT	2	6	634749	634754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458222
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14024	NC_020965	CTT	2	6	634818	634823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458222
14025	NC_020965	CTC	2	6	634842	634847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458222
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14027	NC_020965	CCT	2	6	634937	634942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458222
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14030	NC_020965	CCT	2	6	635052	635057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458222
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14034	NC_020965	A	6	6	635204	635209	100 %	0 %	0 %	0 %	478458222
14035	NC_020965	TCGAG	2	10	635214	635223	20 %	20 %	40 %	20 %	478458222
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14037	NC_020965	TTG	2	6	635271	635276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458222
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14041	NC_020965	TCA	2	6	635433	635438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458222
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14043	NC_020965	ATG	3	9	635537	635545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458222
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14045	NC_020965	CTA	2	6	635615	635620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458222
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14056	NC_020965	TGC	2	6	635904	635909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458223
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14058	NC_020965	TA	3	6	636001	636006	50 %	50 %	0 %	0 %	478458224
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14063	NC_020965	TGC	2	6	636152	636157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458224
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14065	NC_020965	TGC	2	6	636282	636287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458224
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14082	NC_020965	A	6	6	636842	636847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14090	NC_020965	TG	3	6	637248	637253	0 %	50 %	50 %	0 %	478458225
14091	NC_020965	GAG	2	6	637309	637314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458225
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14093	NC_020965	T	7	7	637354	637360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_020965	ATTAA	2	10	637367	637376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_020965	A	6	6	637421	637426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14102	NC_020965	CG	3	6	637684	637689	0 %	0 %	50 %	50 %	478458226
14103	NC_020965	GAA	2	6	637757	637762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458226
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14107	NC_020965	AGCA	2	8	637965	637972	50 %	0 %	25 %	25 %	478458226
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14113	NC_020965	TCGTT	2	10	638247	638256	0 %	60 %	20 %	20 %	478458226
14114	NC_020965	TTG	2	6	638289	638294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458226
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14121	NC_020965	TCCAT	2	10	638548	638557	20 %	40 %	0 %	40 %	478458227
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14123	NC_020965	CCT	2	6	638599	638604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458227
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14127	NC_020965	A	6	6	638716	638721	100 %	0 %	0 %	0 %	478458227
14128	NC_020965	CTCTTT	2	12	638819	638830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458227
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14132	NC_020965	TAAACA	2	12	638947	638958	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478458227
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14187	NC_020965	CCT	2	6	640948	640953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14234	NC_020965	T	7	7	643319	643325	0 %	100 %	0 %	0 %	478458232
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14236	NC_020965	ATCTTG	2	12	643351	643362	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478458232
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14241	NC_020965	CT	3	6	643657	643662	0 %	50 %	0 %	50 %	478458232
14242	NC_020965	AGCG	2	8	643732	643739	25 %	0 %	50 %	25 %	478458232
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14244	NC_020965	TCT	2	6	643786	643791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458232
14245	NC_020965	TCT	2	6	643807	643812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458232
14246	NC_020965	GCT	2	6	643819	643824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458232
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14249	NC_020965	AGA	2	6	644052	644057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458232
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14352	NC_020965	GA	3	6	648949	648954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14480	NC_020965	A	6	6	654293	654298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14488	NC_020965	CTA	2	6	654777	654782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458241
14489	NC_020965	GAA	2	6	654808	654813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458241
14490	NC_020965	AGA	2	6	654852	654857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458241
14491	NC_020965	GCT	2	6	654898	654903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458241
14492	NC_020965	GAA	2	6	654958	654963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458241
14493	NC_020965	CCTT	2	8	655020	655027	0 %	50 %	0 %	50 %	478458241
14494	NC_020965	TCT	2	6	655066	655071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458241
14495	NC_020965	AT	3	6	655114	655119	50 %	50 %	0 %	0 %	478458241
14496	NC_020965	TCA	2	6	655161	655166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458241
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14498	NC_020965	A	7	7	655179	655185	100 %	0 %	0 %	0 %	478458241
14499	NC_020965	TC	3	6	655223	655228	0 %	50 %	0 %	50 %	478458241
14500	NC_020965	CTG	2	6	655241	655246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458241

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