MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020965	ATG	2	6	611524	611529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_020965	A	6	6	611559	611564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_020965	AC	3	6	611632	611637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13504	NC_020965	CCT	2	6	611684	611689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458203
13505	NC_020965	TCT	2	6	611757	611762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458203
13506	NC_020965	TTC	2	6	611786	611791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458203
13507	NC_020965	TGCCA	2	10	611818	611827	20 %	20 %	20 %	40 %	478458203
13508	NC_020965	GTA	2	6	611877	611882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458203
13509	NC_020965	CT	3	6	611883	611888	0 %	50 %	0 %	50 %	478458203
13510	NC_020965	GATT	2	8	611967	611974	25 %	50 %	25 %	0 %	478458203
13511	NC_020965	TCT	2	6	611994	611999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458203
13512	NC_020965	TC	3	6	612004	612009	0 %	50 %	0 %	50 %	478458203
13513	NC_020965	GGTT	2	8	612050	612057	0 %	50 %	50 %	0 %	478458203
13514	NC_020965	GGATGG	2	12	612062	612073	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	478458203
13515	NC_020965	AG	4	8	612115	612122	50 %	0 %	50 %	0 %	478458203
13516	NC_020965	TGG	2	6	612128	612133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458203
13517	NC_020965	ATA	2	6	612153	612158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458203
13518	NC_020965	GGCGC	2	10	612213	612222	0 %	0 %	60 %	40 %	478458203
13519	NC_020965	ATT	2	6	612239	612244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458203
13520	NC_020965	ATCG	2	8	612269	612276	25 %	25 %	25 %	25 %	478458203
13521	NC_020965	AGA	2	6	612331	612336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458203
13522	NC_020965	GAA	2	6	612353	612358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458203
13523	NC_020965	AG	3	6	612392	612397	50 %	0 %	50 %	0 %	478458203
13524	NC_020965	CT	3	6	612398	612403	0 %	50 %	0 %	50 %	478458203
13525	NC_020965	TTAC	2	8	612420	612427	25 %	50 %	0 %	25 %	478458203
13526	NC_020965	TAA	2	6	612436	612441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458203
13527	NC_020965	CCT	2	6	612465	612470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458203
13528	NC_020965	TTTA	2	8	612473	612480	25 %	75 %	0 %	0 %	478458203
13529	NC_020965	CT	3	6	612513	612518	0 %	50 %	0 %	50 %	478458203
13530	NC_020965	ATT	2	6	612537	612542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458203
13531	NC_020965	TTTG	2	8	612571	612578	0 %	75 %	25 %	0 %	478458203
13532	NC_020965	ATT	2	6	612589	612594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458203
13533	NC_020965	GGCT	2	8	612611	612618	0 %	25 %	50 %	25 %	478458203
13534	NC_020965	TCT	2	6	612663	612668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458203
13535	NC_020965	ATT	2	6	612676	612681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458203
13536	NC_020965	TGG	2	6	612725	612730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458203
13537	NC_020965	T	6	6	612760	612765	0 %	100 %	0 %	0 %	478458203
13538	NC_020965	ATG	2	6	612782	612787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458203
13539	NC_020965	ATTGG	2	10	612788	612797	20 %	40 %	40 %	0 %	478458203
13540	NC_020965	A	6	6	612818	612823	100 %	0 %	0 %	0 %	478458203
13541	NC_020965	AGC	2	6	612871	612876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458203
13542	NC_020965	TTG	2	6	612933	612938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458203
13543	NC_020965	TCAA	2	8	613098	613105	50 %	25 %	0 %	25 %	478458204
13544	NC_020965	TTG	2	6	613111	613116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458204
13545	NC_020965	CGCT	2	8	613144	613151	0 %	25 %	25 %	50 %	478458204
13546	NC_020965	TTTG	2	8	613169	613176	0 %	75 %	25 %	0 %	478458204
13547	NC_020965	ATC	2	6	613224	613229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458204
13548	NC_020965	A	9	9	613269	613277	100 %	0 %	0 %	0 %	478458204
13549	NC_020965	CTT	2	6	613311	613316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458204
13550	NC_020965	GAA	2	6	613326	613331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458204
13551	NC_020965	TTTG	2	8	613345	613352	0 %	75 %	25 %	0 %	478458204
13552	NC_020965	CTCTC	2	10	613353	613362	0 %	40 %	0 %	60 %	478458204
13553	NC_020965	ATAG	2	8	613398	613405	50 %	25 %	25 %	0 %	478458204
13554	NC_020965	GAA	2	6	613491	613496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458204
13555	NC_020965	AAG	2	6	613537	613542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458204
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13557	NC_020965	GAA	2	6	613599	613604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458204
13558	NC_020965	AAAAC	2	10	613613	613622	80 %	0 %	0 %	20 %	478458204
13559	NC_020965	AAC	2	6	613642	613647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458204
13560	NC_020965	GCTC	2	8	613742	613749	0 %	25 %	25 %	50 %	478458204
13561	NC_020965	AG	3	6	613776	613781	50 %	0 %	50 %	0 %	478458204
13562	NC_020965	TAG	2	6	613841	613846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458204
13563	NC_020965	ATTTT	2	10	613850	613859	20 %	80 %	0 %	0 %	478458204
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13565	NC_020965	CTATC	2	10	613970	613979	20 %	40 %	0 %	40 %	478458204
13566	NC_020965	A	8	8	613999	614006	100 %	0 %	0 %	0 %	478458204
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13571	NC_020965	TAT	3	9	614180	614188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458204
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13573	NC_020965	TTC	2	6	614349	614354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458204
13574	NC_020965	TCA	2	6	614362	614367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458204
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13581	NC_020965	TGC	2	6	614720	614725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458204
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13599	NC_020965	A	7	7	615712	615718	100 %	0 %	0 %	0 %	478458204
13600	NC_020965	A	6	6	615765	615770	100 %	0 %	0 %	0 %	478458204
13601	NC_020965	TGG	2	6	615796	615801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458204
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13603	NC_020965	A	8	8	615886	615893	100 %	0 %	0 %	0 %	478458204
13604	NC_020965	GCT	2	6	615897	615902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458204
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13607	NC_020965	GTT	2	6	616001	616006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458204
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13611	NC_020965	A	6	6	616191	616196	100 %	0 %	0 %	0 %	478458204
13612	NC_020965	GAA	2	6	616284	616289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458204
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