MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020965	GAT	2	6	520501	520506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458105
11503	NC_020965	TTCTG	2	10	520518	520527	0 %	60 %	20 %	20 %	478458105
11504	NC_020965	AT	3	6	520577	520582	50 %	50 %	0 %	0 %	478458105
11505	NC_020965	TTG	2	6	520643	520648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458105
11506	NC_020965	CA	4	8	520693	520700	50 %	0 %	0 %	50 %	478458105
11507	NC_020965	ATCC	2	8	520736	520743	25 %	25 %	0 %	50 %	478458105
11508	NC_020965	ACT	2	6	520797	520802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458105
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11510	NC_020965	TCA	2	6	520867	520872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458105
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11512	NC_020965	GAT	2	6	520964	520969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458105
11513	NC_020965	CAG	2	6	521012	521017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458105
11514	NC_020965	TAG	2	6	521035	521040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458105
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11516	NC_020965	CAG	2	6	521258	521263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458105
11517	NC_020965	GTA	2	6	521297	521302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458105
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11519	NC_020965	GA	3	6	521346	521351	50 %	0 %	50 %	0 %	478458105
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11522	NC_020965	T	6	6	521595	521600	0 %	100 %	0 %	0 %	478458105
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11528	NC_020965	GAG	2	6	521995	522000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458105
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11536	NC_020965	TAC	2	6	522524	522529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458105
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11541	NC_020965	AACT	2	8	523133	523140	50 %	25 %	0 %	25 %	478458105
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11553	NC_020965	AAG	2	6	523645	523650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458105
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11564	NC_020965	AT	3	6	524164	524169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11573	NC_020965	A	7	7	524456	524462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11583	NC_020965	AAT	2	6	524894	524899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11587	NC_020965	AGA	2	6	525072	525077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_020965	ATA	2	6	525106	525111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_020965	CTA	2	6	525180	525185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11591	NC_020965	TCCC	2	8	525343	525350	0 %	25 %	0 %	75 %	478458107
11592	NC_020965	CAT	3	9	525363	525371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458107
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11604	NC_020965	GTC	2	6	526107	526112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458108
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11607	NC_020965	CTT	2	6	526188	526193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458108
11608	NC_020965	TCC	2	6	526194	526199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458108
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11610	NC_020965	TTCT	2	8	526368	526375	0 %	75 %	0 %	25 %	478458108
11611	NC_020965	CTT	2	6	526376	526381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458108
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11619	NC_020965	ATCT	2	8	526688	526695	25 %	50 %	0 %	25 %	478458108
11620	NC_020965	CTT	2	6	526704	526709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458108
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11623	NC_020965	CTT	2	6	526905	526910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458108
11624	NC_020965	TCC	2	6	526933	526938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458108
11625	NC_020965	GAT	2	6	526966	526971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458108
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11642	NC_020965	ATTC	2	8	527819	527826	25 %	50 %	0 %	25 %	478458110
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11654	NC_020965	CTA	2	6	528376	528381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458111
11655	NC_020965	ATCG	2	8	528464	528471	25 %	25 %	25 %	25 %	478458111
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11720	NC_020965	TGT	2	6	531529	531534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11721	NC_020965	TTTA	2	8	531536	531543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11722	NC_020965	CAT	2	6	531600	531605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11726	NC_020965	TCT	2	6	531716	531721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11730	NC_020965	CTT	2	6	531798	531803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11731	NC_020965	CA	3	6	531805	531810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11735	NC_020965	GTAG	2	8	531980	531987	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11736	NC_020965	AAC	2	6	531989	531994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11737	NC_020965	TGC	3	9	532021	532029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11740	NC_020965	N	168	168	532108	532275	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11741	NC_020965	AGC	3	9	532276	532284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11742	NC_020965	CTC	2	6	532303	532308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11743	NC_020965	ACA	2	6	532313	532318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11744	NC_020965	CTTC	2	8	532376	532383	0 %	50 %	0 %	50 %	478458113
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11993	NC_020965	TTA	2	6	543153	543158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458125
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