MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020965	TG	3	6	251042	251047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_020965	AATA	2	8	251109	251116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_020965	T	6	6	251131	251136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020965	T	7	7	251150	251156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020965	A	6	6	251158	251163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_020965	ACA	2	6	251258	251263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_020965	CTT	2	6	251265	251270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_020965	AAG	2	6	251296	251301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_020965	GCA	2	6	251315	251320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_020965	TTG	2	6	251335	251340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_020965	CAAA	2	8	251499	251506	75 %	0 %	0 %	25 %	478457870
5512	NC_020965	ATA	2	6	251522	251527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457870
5513	NC_020965	CAAT	2	8	251609	251616	50 %	25 %	0 %	25 %	478457870
5514	NC_020965	CTTT	3	12	251661	251672	0 %	75 %	0 %	25 %	478457870
5515	NC_020965	CGA	2	6	251703	251708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457870
5516	NC_020965	CTT	2	6	251714	251719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457870
5517	NC_020965	ACA	2	6	251736	251741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457870
5518	NC_020965	CTC	2	6	251755	251760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_020965	CAA	2	6	251799	251804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_020965	AG	3	6	251844	251849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_020965	A	8	8	251850	251857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_020965	AAG	2	6	251868	251873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_020965	CAT	4	12	251918	251929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457871
5524	NC_020965	TTA	2	6	252064	252069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457871
5525	NC_020965	CTC	2	6	252095	252100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457871
5526	NC_020965	AGT	2	6	252119	252124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457871
5527	NC_020965	GCAG	2	8	252166	252173	25 %	0 %	50 %	25 %	478457871
5528	NC_020965	TCTT	2	8	252183	252190	0 %	75 %	0 %	25 %	478457871
5529	NC_020965	C	7	7	252195	252201	0 %	0 %	0 %	100 %	478457871
5530	NC_020965	AGA	2	6	252211	252216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457871
5531	NC_020965	ACA	2	6	252243	252248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457871
5532	NC_020965	TC	3	6	252285	252290	0 %	50 %	0 %	50 %	478457871
5533	NC_020965	TTG	2	6	252342	252347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457871
5534	NC_020965	TCT	2	6	252364	252369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457871
5535	NC_020965	CAA	2	6	252421	252426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457871
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5537	NC_020965	GGC	2	6	252505	252510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478457871
5538	NC_020965	ACA	2	6	252535	252540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457871
5539	NC_020965	CAC	2	6	252542	252547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457871
5540	NC_020965	CAG	2	6	252548	252553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457871
5541	NC_020965	T	8	8	252617	252624	0 %	100 %	0 %	0 %	478457871
5542	NC_020965	TCC	2	6	252708	252713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_020965	GAAA	2	8	252729	252736	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_020965	T	7	7	252750	252756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_020965	GCAG	2	8	252778	252785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_020965	AGAA	2	8	252811	252818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_020965	AG	3	6	252853	252858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_020965	TAT	2	6	252876	252881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020965	ACA	2	6	252917	252922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_020965	A	6	6	252966	252971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020965	TTG	2	6	253146	253151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457872
5552	NC_020965	TCT	2	6	253168	253173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457872
5553	NC_020965	TC	3	6	253215	253220	0 %	50 %	0 %	50 %	478457872
5554	NC_020965	T	7	7	253251	253257	0 %	100 %	0 %	0 %	478457872
5555	NC_020965	CCA	2	6	253264	253269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457872
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5557	NC_020965	AATA	2	8	253371	253378	75 %	25 %	0 %	0 %	478457872
5558	NC_020965	GCT	2	6	253381	253386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457872
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5560	NC_020965	CCA	2	6	253478	253483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457872
5561	NC_020965	CAA	2	6	253526	253531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457872
5562	NC_020965	CCCA	2	8	253634	253641	25 %	0 %	0 %	75 %	478457873
5563	NC_020965	CTT	2	6	253763	253768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457873
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5565	NC_020965	CTC	2	6	253853	253858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457873
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5573	NC_020965	A	6	6	254039	254044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_020965	TAA	2	6	254090	254095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5578	NC_020965	CTT	2	6	254203	254208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457874
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5592	NC_020965	A	8	8	254610	254617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_020965	TA	3	6	254659	254664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_020965	CCAA	2	8	254694	254701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_020965	A	7	7	254718	254724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5600	NC_020965	CGA	2	6	254964	254969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457875
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5603	NC_020965	A	6	6	255128	255133	100 %	0 %	0 %	0 %	478457875
5604	NC_020965	A	7	7	255159	255165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_020965	ATA	2	6	255172	255177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_020965	AACCCT	2	12	255218	255229	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5611	NC_020965	TTA	2	6	255628	255633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457876
5612	NC_020965	CTTCT	2	10	255660	255669	0 %	60 %	0 %	40 %	478457876
5613	NC_020965	T	6	6	255703	255708	0 %	100 %	0 %	0 %	478457876
5614	NC_020965	CA	3	6	255762	255767	50 %	0 %	0 %	50 %	478457876
5615	NC_020965	AAT	2	6	255777	255782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457876
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