MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5005	NC_020965	GAG	2	6	227537	227542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457850
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5249	NC_020965	TCC	2	6	240574	240579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457859
5250	NC_020965	ACGG	2	8	240587	240594	25 %	0 %	50 %	25 %	478457859
5251	NC_020965	AGA	2	6	240607	240612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457859
5252	NC_020965	CAA	2	6	240637	240642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457859
5253	NC_020965	TCA	2	6	240695	240700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457859
5254	NC_020965	TCT	2	6	240722	240727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457859
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5258	NC_020965	TCA	2	6	240933	240938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457860
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5262	NC_020965	CTT	2	6	241174	241179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457860
5263	NC_020965	CTG	2	6	241180	241185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457860
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5267	NC_020965	T	7	7	241365	241371	0 %	100 %	0 %	0 %	478457861
5268	NC_020965	AAT	2	6	241437	241442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457861
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5274	NC_020965	CTC	2	6	241745	241750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457861
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5278	NC_020965	CCA	2	6	241988	241993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457861
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5281	NC_020965	AAT	2	6	242177	242182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457862
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5283	NC_020965	CT	3	6	242220	242225	0 %	50 %	0 %	50 %	478457862
5284	NC_020965	TAG	2	6	242259	242264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457862
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5287	NC_020965	AG	3	6	242326	242331	50 %	0 %	50 %	0 %	478457862
5288	NC_020965	T	8	8	242347	242354	0 %	100 %	0 %	0 %	478457862
5289	NC_020965	TGA	2	6	242356	242361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457862
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5303	NC_020965	AAG	2	6	242956	242961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457862
5304	NC_020965	AGCT	2	8	242974	242981	25 %	25 %	25 %	25 %	478457862
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5320	NC_020965	CGAT	2	8	243582	243589	25 %	25 %	25 %	25 %	478457862
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5323	NC_020965	TAA	2	6	243667	243672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457862
5324	NC_020965	TGC	2	6	243673	243678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457862
5325	NC_020965	GCT	2	6	243680	243685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457862
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5328	NC_020965	TAG	2	6	243774	243779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457862
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5331	NC_020965	CA	3	6	243847	243852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5333	NC_020965	AAGA	2	8	244015	244022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5334	NC_020965	GT	3	6	244064	244069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5335	NC_020965	T	6	6	244075	244080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5336	NC_020965	TCT	2	6	244134	244139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457863
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5340	NC_020965	CAGA	2	8	244241	244248	50 %	0 %	25 %	25 %	478457863
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5343	NC_020965	GCTG	2	8	244423	244430	0 %	25 %	50 %	25 %	478457863
5344	NC_020965	CTT	2	6	244442	244447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457863
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5353	NC_020965	CTTGG	2	10	244687	244696	0 %	40 %	40 %	20 %	478457863
5354	NC_020965	TGT	2	6	244734	244739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457863
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5363	NC_020965	TAAT	2	8	245030	245037	50 %	50 %	0 %	0 %	478457863
5364	NC_020965	TGG	2	6	245046	245051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478457863
5365	NC_020965	ATTT	2	8	245131	245138	25 %	75 %	0 %	0 %	478457863
5366	NC_020965	CAT	2	6	245180	245185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457864
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5370	NC_020965	GCA	2	6	245348	245353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457864
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5496	NC_020965	GCT	2	6	250739	250744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457869
5497	NC_020965	CCA	2	6	250766	250771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457869
5498	NC_020965	GTATG	2	10	250890	250899	20 %	40 %	40 %	0 %	478457869
5499	NC_020965	GA	3	6	250932	250937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_020965	ACT	2	6	250992	250997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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