MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020964	GGA	2	6	520103	520108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478474323
11503	NC_020964	TA	3	6	520111	520116	50 %	50 %	0 %	0 %	478474323
11504	NC_020964	AATG	2	8	520156	520163	50 %	25 %	25 %	0 %	478474323
11505	NC_020964	GTT	2	6	520220	520225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474323
11506	NC_020964	TCT	2	6	520254	520259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474323
11507	NC_020964	CAT	2	6	520266	520271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474323
11508	NC_020964	TCT	2	6	520313	520318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474323
11509	NC_020964	AAT	2	6	520333	520338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478474323
11510	NC_020964	TCA	2	6	520371	520376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474323
11511	NC_020964	TTGC	2	8	520386	520393	0 %	50 %	25 %	25 %	478474323
11512	NC_020964	AATC	2	8	520395	520402	50 %	25 %	0 %	25 %	478474323
11513	NC_020964	AGCAC	2	10	520436	520445	40 %	0 %	20 %	40 %	478474323
11514	NC_020964	TAA	2	6	520453	520458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478474323
11515	NC_020964	AAT	2	6	520547	520552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478474323
11516	NC_020964	AGT	2	6	520639	520644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474323
11517	NC_020964	GAA	2	6	520671	520676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474323
11518	NC_020964	GAT	2	6	520686	520691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474323
11519	NC_020964	TTCTG	2	10	520703	520712	0 %	60 %	20 %	20 %	478474323
11520	NC_020964	AT	3	6	520762	520767	50 %	50 %	0 %	0 %	478474323
11521	NC_020964	TTG	2	6	520828	520833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474323
11522	NC_020964	CA	4	8	520878	520885	50 %	0 %	0 %	50 %	478474323
11523	NC_020964	ATCC	2	8	520921	520928	25 %	25 %	0 %	50 %	478474323
11524	NC_020964	ACT	2	6	520982	520987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474323
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11528	NC_020964	GAT	2	6	521149	521154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474323
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11530	NC_020964	TAG	2	6	521220	521225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474323
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11532	NC_020964	CAG	2	6	521443	521448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478474323
11533	NC_020964	GTA	2	6	521482	521487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474323
11534	NC_020964	CAACA	2	10	521521	521530	60 %	0 %	0 %	40 %	478474323
11535	NC_020964	GA	3	6	521531	521536	50 %	0 %	50 %	0 %	478474323
11536	NC_020964	CTT	2	6	521580	521585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474323
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11538	NC_020964	CTCC	2	8	521759	521766	0 %	25 %	0 %	75 %	478474323
11539	NC_020964	T	6	6	521780	521785	0 %	100 %	0 %	0 %	478474323
11540	NC_020964	CTT	2	6	521799	521804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474323
11541	NC_020964	TTG	2	6	521833	521838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474323
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11543	NC_020964	AAG	2	6	522042	522047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474323
11544	NC_020964	GAG	2	6	522180	522185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478474323
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11547	NC_020964	CTG	2	6	522333	522338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478474323
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11551	NC_020964	TCT	2	6	522693	522698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474323
11552	NC_020964	TAC	2	6	522709	522714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474323
11553	NC_020964	TGT	2	6	522899	522904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474323
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11557	NC_020964	AACT	2	8	523318	523325	50 %	25 %	0 %	25 %	478474323
11558	NC_020964	AGC	2	6	523336	523341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478474323
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11569	NC_020964	AAG	2	6	523830	523835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474323
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11581	NC_020964	AT	3	6	524349	524354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_020964	AAAG	2	8	524362	524369	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_020964	T	6	6	524410	524415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_020964	TTGGA	2	10	524433	524442	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_020964	T	6	6	524456	524461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_020964	ACA	2	6	524464	524469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_020964	A	7	7	524567	524573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_020964	T	6	6	524589	524594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_020964	A	7	7	524640	524646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_020964	AGA	2	6	524693	524698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474324
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11592	NC_020964	CAA	2	6	524762	524767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478474324
11593	NC_020964	GAACT	2	10	524919	524928	40 %	20 %	20 %	20 %	478474324
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11596	NC_020964	A	7	7	525033	525039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_020964	CTAA	2	8	525054	525061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11598	NC_020964	AAT	2	6	525078	525083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_020964	ACTT	2	8	525088	525095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11600	NC_020964	GCT	2	6	525189	525194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_020964	CAAAA	2	10	525208	525217	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11602	NC_020964	AGA	2	6	525266	525271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_020964	ATA	2	6	525300	525305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_020964	CTA	2	6	525374	525379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_020964	TCCC	2	8	525537	525544	0 %	25 %	0 %	75 %	478474325
11606	NC_020964	CAT	3	9	525557	525565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474325
11607	NC_020964	TCG	2	6	525575	525580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478474325
11608	NC_020964	TTG	2	6	525661	525666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474325
11609	NC_020964	ATT	2	6	525755	525760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474325
11610	NC_020964	GCA	2	6	525784	525789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478474325
11611	NC_020964	CT	3	6	525792	525797	0 %	50 %	0 %	50 %	478474325
11612	NC_020964	ACA	2	6	525868	525873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478474325
11613	NC_020964	CCT	2	6	525883	525888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478474325
11614	NC_020964	ATTA	2	8	525930	525937	50 %	50 %	0 %	0 %	478474325
11615	NC_020964	A	7	7	525996	526002	100 %	0 %	0 %	0 %	478474325
11616	NC_020964	CAA	2	6	526212	526217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478474325
11617	NC_020964	TAAA	2	8	526235	526242	75 %	25 %	0 %	0 %	478474325
11618	NC_020964	GTC	2	6	526301	526306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478474326
11619	NC_020964	TTC	2	6	526314	526319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474326
11620	NC_020964	TTC	2	6	526335	526340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474326
11621	NC_020964	CTT	2	6	526382	526387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474326
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11623	NC_020964	TTTC	2	8	526452	526459	0 %	75 %	0 %	25 %	478474326
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