MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020964	T	8	8	228229	228236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_020964	AGA	2	6	228427	228432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_020964	ATT	2	6	228464	228469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_020964	TTC	2	6	228548	228553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474068
5006	NC_020964	GAA	2	6	228622	228627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474068
5007	NC_020964	TGA	2	6	228654	228659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474068
5008	NC_020964	ATT	2	6	228733	228738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474068
5009	NC_020964	AGA	2	6	228795	228800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474068
5010	NC_020964	TC	3	6	228801	228806	0 %	50 %	0 %	50 %	478474068
5011	NC_020964	TGA	2	6	228828	228833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474068
5012	NC_020964	TCG	2	6	228917	228922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478474068
5013	NC_020964	A	7	7	228989	228995	100 %	0 %	0 %	0 %	478474068
5014	NC_020964	CCTT	2	8	228997	229004	0 %	50 %	0 %	50 %	478474068
5015	NC_020964	TTG	2	6	229019	229024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474068
5016	NC_020964	T	6	6	229055	229060	0 %	100 %	0 %	0 %	478474068
5017	NC_020964	GATA	2	8	229092	229099	50 %	25 %	25 %	0 %	478474068
5018	NC_020964	ATT	2	6	229132	229137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474068
5019	NC_020964	GAA	2	6	229141	229146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474068
5020	NC_020964	TCCTC	2	10	229172	229181	0 %	40 %	0 %	60 %	478474068
5021	NC_020964	AGA	2	6	229206	229211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474068
5022	NC_020964	CTT	2	6	229298	229303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474069
5023	NC_020964	TAC	2	6	229400	229405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474069
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5025	NC_020964	TCT	2	6	229469	229474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474069
5026	NC_020964	TTTC	2	8	229545	229552	0 %	75 %	0 %	25 %	478474069
5027	NC_020964	CTT	2	6	229607	229612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478474069
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5030	NC_020964	T	6	6	229799	229804	0 %	100 %	0 %	0 %	478474069
5031	NC_020964	TAT	2	6	229874	229879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474069
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5037	NC_020964	TTCT	2	8	230221	230228	0 %	75 %	0 %	25 %	478474069
5038	NC_020964	ACT	2	6	230232	230237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474069
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5041	NC_020964	TTAT	2	8	230383	230390	25 %	75 %	0 %	0 %	478474069
5042	NC_020964	CTAT	2	8	230402	230409	25 %	50 %	0 %	25 %	478474069
5043	NC_020964	TCTT	2	8	230449	230456	0 %	75 %	0 %	25 %	478474069
5044	NC_020964	TGC	2	6	230492	230497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478474069
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5050	NC_020964	TGG	3	9	230664	230672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478474069
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5057	NC_020964	TGG	2	6	230970	230975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478474070
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5065	NC_020964	TTA	2	6	231455	231460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474070
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5109	NC_020964	CT	3	6	233639	233644	0 %	50 %	0 %	50 %	478474072
5110	NC_020964	A	6	6	233655	233660	100 %	0 %	0 %	0 %	478474072
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5122	NC_020964	TCTCT	2	10	234276	234285	0 %	60 %	0 %	40 %	478474072
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5124	NC_020964	TC	3	6	234518	234523	0 %	50 %	0 %	50 %	478474072
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