MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_020942	GCT	3	9	859984	859992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456599
19003	NC_020942	AGAAA	2	10	860032	860041	80 %	0 %	20 %	0 %	478456599
19004	NC_020942	TA	3	6	860087	860092	50 %	50 %	0 %	0 %	478456599
19005	NC_020942	AAG	2	6	860095	860100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456599
19006	NC_020942	TG	3	6	860137	860142	0 %	50 %	50 %	0 %	478456599
19007	NC_020942	GGCTAG	2	12	860190	860201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	478456599
19008	NC_020942	GAGAAA	2	12	860237	860248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456599
19009	NC_020942	GCTT	2	8	860250	860257	0 %	50 %	25 %	25 %	478456599
19010	NC_020942	CT	4	8	860282	860289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19011	NC_020942	AGT	2	6	860427	860432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_020942	AAG	2	6	860450	860455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_020942	ACG	2	6	860461	860466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_020942	TAA	2	6	860591	860596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_020942	T	7	7	860677	860683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_020942	A	8	8	860688	860695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_020942	A	7	7	860697	860703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19018	NC_020942	GT	3	6	860742	860747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19019	NC_020942	T	6	6	860780	860785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_020942	A	6	6	860797	860802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_020942	A	6	6	860812	860817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_020942	CTTT	2	8	860840	860847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19023	NC_020942	CGAA	2	8	860848	860855	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19024	NC_020942	GAAG	2	8	860860	860867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_020942	TAA	2	6	861004	861009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_020942	TA	3	6	861017	861022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19027	NC_020942	T	6	6	861023	861028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19028	NC_020942	GGC	2	6	861062	861067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19029	NC_020942	AAG	2	6	861229	861234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19030	NC_020942	TGG	2	6	861286	861291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_020942	GA	3	6	861330	861335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_020942	GCC	2	6	861339	861344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19033	NC_020942	CGC	2	6	861431	861436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19034	NC_020942	GT	3	6	861437	861442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_020942	AGA	2	6	861487	861492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_020942	AAG	2	6	861528	861533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_020942	CAG	2	6	861552	861557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19038	NC_020942	AGTT	2	8	861629	861636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_020942	GAA	2	6	861744	861749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_020942	GCC	2	6	861912	861917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19041	NC_020942	GAG	2	6	861919	861924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19042	NC_020942	TGC	2	6	862082	862087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19043	NC_020942	GTC	2	6	862094	862099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19044	NC_020942	AGG	2	6	862206	862211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_020942	AC	3	6	862258	862263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19046	NC_020942	AC	3	6	862427	862432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19047	NC_020942	CAT	2	6	862442	862447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19048	NC_020942	GA	3	6	862490	862495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19049	NC_020942	TGA	2	6	862513	862518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19050	NC_020942	CCT	2	6	862570	862575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19051	NC_020942	TAAGGA	2	12	862578	862589	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19052	NC_020942	AGCA	2	8	862640	862647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19053	NC_020942	TGT	2	6	862662	862667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_020942	AAT	2	6	862728	862733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_020942	ATA	3	9	862758	862766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19056	NC_020942	TAA	2	6	862834	862839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19057	NC_020942	TGG	2	6	862847	862852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_020942	GAA	2	6	862873	862878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19059	NC_020942	GCG	2	6	863070	863075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19060	NC_020942	GATG	2	8	863171	863178	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19061	NC_020942	GA	3	6	863208	863213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_020942	GACC	2	8	863216	863223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19063	NC_020942	ATG	2	6	863446	863451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19065	NC_020942	GGA	2	6	863604	863609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19067	NC_020942	ATA	2	6	863722	863727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_020942	CCG	2	6	863867	863872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19069	NC_020942	TGA	2	6	863911	863916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19072	NC_020942	GT	3	6	864039	864044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19073	NC_020942	GTA	2	6	864069	864074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19079	NC_020942	GGA	2	6	864414	864419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19080	NC_020942	AAT	2	6	864449	864454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19081	NC_020942	GC	3	6	864517	864522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19086	NC_020942	ATT	2	6	865074	865079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19087	NC_020942	TCC	2	6	865133	865138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19088	NC_020942	GGA	2	6	865150	865155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19089	NC_020942	CAA	2	6	865230	865235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19090	NC_020942	CGG	2	6	865269	865274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19091	NC_020942	CCA	2	6	865337	865342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19092	NC_020942	CGT	2	6	865465	865470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19093	NC_020942	GAG	2	6	865514	865519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19094	NC_020942	GT	3	6	865560	865565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19095	NC_020942	GTT	2	6	865568	865573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19096	NC_020942	CCTC	2	8	865641	865648	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19097	NC_020942	TAA	2	6	865739	865744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19098	NC_020942	AG	3	6	865809	865814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_020942	AGA	2	6	865826	865831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19100	NC_020942	ATA	2	6	865889	865894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19101	NC_020942	GA	3	6	865895	865900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19102	NC_020942	TA	3	6	865959	865964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_020942	GTC	2	6	865984	865989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19108	NC_020942	CTG	2	6	866279	866284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19109	NC_020942	ATGT	2	8	866299	866306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_020942	AAG	2	6	866358	866363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19111	NC_020942	TTA	2	6	866415	866420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_020942	GAAA	2	8	866433	866440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19113	NC_020942	GAA	2	6	866452	866457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19114	NC_020942	TGT	2	6	866466	866471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19115	NC_020942	CTT	2	6	866480	866485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19116	NC_020942	GAA	2	6	866495	866500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19117	NC_020942	ATC	2	6	866534	866539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456600
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19120	NC_020942	TCT	2	6	866634	866639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456600
19121	NC_020942	GA	4	8	866749	866756	50 %	0 %	50 %	0 %	478456600
19122	NC_020942	TTCT	2	8	866783	866790	0 %	75 %	0 %	25 %	478456600
19123	NC_020942	CTT	2	6	866806	866811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456600
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19127	NC_020942	AG	3	6	867015	867020	50 %	0 %	50 %	0 %	478456600
19128	NC_020942	AT	3	6	867022	867027	50 %	50 %	0 %	0 %	478456600
19129	NC_020942	GGTCG	2	10	867053	867062	0 %	20 %	60 %	20 %	478456600
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19256	NC_020942	CT	3	6	872167	872172	0 %	50 %	0 %	50 %	478456604
19257	NC_020942	TCA	2	6	872220	872225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456604
19258	NC_020942	GCA	2	6	872277	872282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456604
19259	NC_020942	TTC	2	6	872319	872324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456604
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19261	NC_020942	ATT	2	6	872523	872528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456604
19262	NC_020942	TTG	2	6	872542	872547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456604
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19264	NC_020942	TAT	2	6	872680	872685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456604
19265	NC_020942	ACCT	2	8	872710	872717	25 %	25 %	0 %	50 %	478456604
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19275	NC_020942	TAGA	2	8	873123	873130	50 %	25 %	25 %	0 %	478456605
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19277	NC_020942	GAG	2	6	873210	873215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456605
19278	NC_020942	GCT	2	6	873242	873247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456605
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19284	NC_020942	ATGC	2	8	873414	873421	25 %	25 %	25 %	25 %	478456605
19285	NC_020942	AG	3	6	873439	873444	50 %	0 %	50 %	0 %	478456605
19286	NC_020942	TCT	2	6	873491	873496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456605
19287	NC_020942	GAG	2	6	873561	873566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456605
19288	NC_020942	TCCCA	2	10	873670	873679	20 %	20 %	0 %	60 %	478456605
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19291	NC_020942	AT	3	6	873807	873812	50 %	50 %	0 %	0 %	478456605
19292	NC_020942	TCT	2	6	873859	873864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456605
19293	NC_020942	GAA	2	6	873872	873877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456605
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19296	NC_020942	GA	3	6	873950	873955	50 %	0 %	50 %	0 %	478456605
19297	NC_020942	TTTG	2	8	873963	873970	0 %	75 %	25 %	0 %	478456605
19298	NC_020942	TAT	3	9	874002	874010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456605
19299	NC_020942	TA	3	6	874044	874049	50 %	50 %	0 %	0 %	478456605
19300	NC_020942	GT	3	6	874091	874096	0 %	50 %	50 %	0 %	478456605
19301	NC_020942	CAT	2	6	874101	874106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456605
19302	NC_020942	AAAAC	2	10	874112	874121	80 %	0 %	0 %	20 %	478456605
19303	NC_020942	TTG	2	6	874150	874155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456605
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19313	NC_020942	TCT	2	6	874708	874713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456606
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19316	NC_020942	ATC	2	6	874782	874787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456606
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19318	NC_020942	TGTT	2	8	875013	875020	0 %	75 %	25 %	0 %	478456606
19319	NC_020942	TTC	2	6	875097	875102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456606
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19322	NC_020942	TTC	2	6	875250	875255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456606
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19329	NC_020942	GAG	2	6	875569	875574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456606
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19334	NC_020942	AGT	2	6	875796	875801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456607
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19336	NC_020942	GAG	2	6	876034	876039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456607
19337	NC_020942	C	6	6	876207	876212	0 %	0 %	0 %	100 %	478456607
19338	NC_020942	AG	3	6	876419	876424	50 %	0 %	50 %	0 %	478456607
19339	NC_020942	TAA	2	6	876458	876463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456607
19340	NC_020942	A	9	9	876507	876515	100 %	0 %	0 %	0 %	478456607
19341	NC_020942	TA	3	6	876557	876562	50 %	50 %	0 %	0 %	478456607
19342	NC_020942	GGA	2	6	876577	876582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456607
19343	NC_020942	GTT	2	6	876598	876603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456607
19344	NC_020942	CCTCTA	2	12	876647	876658	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19345	NC_020942	CTT	2	6	876694	876699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456608
19346	NC_020942	T	6	6	876742	876747	0 %	100 %	0 %	0 %	478456608
19347	NC_020942	TTTG	2	8	876751	876758	0 %	75 %	25 %	0 %	478456608
19348	NC_020942	CTG	2	6	876773	876778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456608
19349	NC_020942	AT	3	6	876780	876785	50 %	50 %	0 %	0 %	478456608
19350	NC_020942	CTT	2	6	876907	876912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456608
19351	NC_020942	CTC	2	6	876926	876931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456608
19352	NC_020942	T	6	6	876952	876957	0 %	100 %	0 %	0 %	478456608
19353	NC_020942	TA	3	6	876989	876994	50 %	50 %	0 %	0 %	478456608
19354	NC_020942	GC	3	6	877007	877012	0 %	0 %	50 %	50 %	478456608
19355	NC_020942	ATC	2	6	877037	877042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456608
19356	NC_020942	T	6	6	877088	877093	0 %	100 %	0 %	0 %	478456608
19357	NC_020942	CTC	2	6	877168	877173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456608
19358	NC_020942	T	6	6	877444	877449	0 %	100 %	0 %	0 %	478456608
19359	NC_020942	GCAT	2	8	877488	877495	25 %	25 %	25 %	25 %	478456608
19360	NC_020942	TGC	2	6	877625	877630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456608
19361	NC_020942	TTC	2	6	877640	877645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456608
19362	NC_020942	AGG	2	6	877688	877693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456608
19363	NC_020942	GA	3	6	877703	877708	50 %	0 %	50 %	0 %	478456608
19364	NC_020942	AG	3	6	877730	877735	50 %	0 %	50 %	0 %	478456608
19365	NC_020942	GTT	2	6	877831	877836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456608
19366	NC_020942	TCA	2	6	877839	877844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456608
19367	NC_020942	ATA	2	6	877845	877850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456608
19368	NC_020942	T	7	7	877945	877951	0 %	100 %	0 %	0 %	478456608
19369	NC_020942	CAGCC	2	10	878000	878009	20 %	0 %	20 %	60 %	478456608
19370	NC_020942	GTA	2	6	878052	878057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456608
19371	NC_020942	CTTG	2	8	878074	878081	0 %	50 %	25 %	25 %	478456608
19372	NC_020942	CA	4	8	878089	878096	50 %	0 %	0 %	50 %	478456608
19373	NC_020942	CAT	2	6	878180	878185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456608
19374	NC_020942	TTC	2	6	878228	878233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456608
19375	NC_020942	GATA	2	8	878281	878288	50 %	25 %	25 %	0 %	478456608
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19377	NC_020942	GAT	2	6	878527	878532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456608
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