MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_020942	ATC	2	6	700228	700233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456471
15503	NC_020942	TCAA	2	8	700243	700250	50 %	25 %	0 %	25 %	478456471
15504	NC_020942	AAC	2	6	700330	700335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456471
15505	NC_020942	CTT	2	6	700386	700391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456471
15506	NC_020942	AAAC	2	8	700453	700460	75 %	0 %	0 %	25 %	478456471
15507	NC_020942	CT	3	6	700484	700489	0 %	50 %	0 %	50 %	478456472
15508	NC_020942	GGA	2	6	700530	700535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456472
15509	NC_020942	TACT	2	8	700543	700550	25 %	50 %	0 %	25 %	478456472
15510	NC_020942	T	6	6	700594	700599	0 %	100 %	0 %	0 %	478456472
15511	NC_020942	ATT	2	6	700640	700645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456472
15512	NC_020942	CTT	2	6	700654	700659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456472
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15514	NC_020942	CTT	2	6	700729	700734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456472
15515	NC_020942	A	8	8	700736	700743	100 %	0 %	0 %	0 %	478456472
15516	NC_020942	ACA	3	9	700840	700848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456472
15517	NC_020942	GCA	2	6	700859	700864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15519	NC_020942	CTT	2	6	700909	700914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456473
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15523	NC_020942	CTT	2	6	701119	701124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456473
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15528	NC_020942	TCGT	2	8	701410	701417	0 %	50 %	25 %	25 %	478456473
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15536	NC_020942	TCCA	2	8	701649	701656	25 %	25 %	0 %	50 %	478456473
15537	NC_020942	T	6	6	701678	701683	0 %	100 %	0 %	0 %	478456473
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15541	NC_020942	GAAT	2	8	701819	701826	50 %	25 %	25 %	0 %	478456473
15542	NC_020942	ACC	2	6	701841	701846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478456473
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15551	NC_020942	CT	3	6	702227	702232	0 %	50 %	0 %	50 %	478456473
15552	NC_020942	AGTA	2	8	702233	702240	50 %	25 %	25 %	0 %	478456473
15553	NC_020942	TTTC	2	8	702256	702263	0 %	75 %	0 %	25 %	478456473
15554	NC_020942	ATAC	2	8	702266	702273	50 %	25 %	0 %	25 %	478456473
15555	NC_020942	ATC	2	6	702281	702286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456473
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15557	NC_020942	CTTT	2	8	702342	702349	0 %	75 %	0 %	25 %	478456473
15558	NC_020942	GATC	2	8	702415	702422	25 %	25 %	25 %	25 %	478456473
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15562	NC_020942	CTTT	2	8	702518	702525	0 %	75 %	0 %	25 %	478456473
15563	NC_020942	TCT	3	9	702531	702539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456473
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15593	NC_020942	T	7	7	704082	704088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15597	NC_020942	TTTAT	2	10	704177	704186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_020942	TTTC	2	8	704197	704204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15599	NC_020942	ACA	2	6	704354	704359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_020942	TCATG	2	10	704372	704381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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15602	NC_020942	GA	3	6	704462	704467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_020942	AGAGA	2	10	704523	704532	60 %	0 %	40 %	0 %	478456475
15604	NC_020942	TCAAA	2	10	704573	704582	60 %	20 %	0 %	20 %	478456475
15605	NC_020942	A	6	6	704599	704604	100 %	0 %	0 %	0 %	478456475
15606	NC_020942	T	6	6	704767	704772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_020942	TAAT	2	8	704784	704791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_020942	CCT	2	6	704919	704924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15609	NC_020942	T	7	7	704978	704984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_020942	GCA	2	6	705001	705006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456476
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15612	NC_020942	CCGCAA	2	12	705047	705058	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	478456476
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15614	NC_020942	AGCTC	2	10	705095	705104	20 %	20 %	20 %	40 %	478456476
15615	NC_020942	TGA	2	6	705108	705113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456476
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15618	NC_020942	AGT	2	6	705238	705243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456476
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15621	NC_020942	GCA	2	6	705650	705655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456476
15622	NC_020942	TCT	2	6	705746	705751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456476
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15993	NC_020942	A	7	7	722250	722256	100 %	0 %	0 %	0 %	478456485
15994	NC_020942	TCT	2	6	722292	722297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15995	NC_020942	TATT	2	8	722320	722327	25 %	75 %	0 %	0 %	478456486
15996	NC_020942	TCCA	2	8	722328	722335	25 %	25 %	0 %	50 %	478456486
15997	NC_020942	TGC	2	6	722449	722454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456486
15998	NC_020942	AAT	2	6	722465	722470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456486
15999	NC_020942	ATC	2	6	722500	722505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456486
16000	NC_020942	ATC	2	6	722524	722529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456486

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