MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020942	TCT	2	6	587671	587676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456358
13003	NC_020942	AAT	2	6	587698	587703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456358
13004	NC_020942	CTT	2	6	587727	587732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456358
13005	NC_020942	CAG	2	6	587753	587758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456358
13006	NC_020942	T	6	6	587760	587765	0 %	100 %	0 %	0 %	478456358
13007	NC_020942	TAA	3	9	587817	587825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456358
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13009	NC_020942	TTG	2	6	587913	587918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456358
13010	NC_020942	AAC	2	6	587941	587946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456358
13011	NC_020942	GA	3	6	587978	587983	50 %	0 %	50 %	0 %	478456358
13012	NC_020942	AAAGG	2	10	588153	588162	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_020942	CTT	2	6	588211	588216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456359
13014	NC_020942	CTG	2	6	588299	588304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456359
13015	NC_020942	CAT	2	6	588343	588348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456359
13016	NC_020942	TGA	2	6	588351	588356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456359
13017	NC_020942	TTG	2	6	588362	588367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456359
13018	NC_020942	TGT	2	6	588480	588485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456359
13019	NC_020942	CTT	2	6	588536	588541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456359
13020	NC_020942	AACA	2	8	588571	588578	75 %	0 %	0 %	25 %	478456359
13021	NC_020942	ACA	2	6	588583	588588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456359
13022	NC_020942	TTC	2	6	588665	588670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456359
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13024	NC_020942	CTC	2	6	588785	588790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13025	NC_020942	TAT	2	6	588809	588814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13027	NC_020942	CCA	2	6	588912	588917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13028	NC_020942	ACG	2	6	588929	588934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13030	NC_020942	GCAC	2	8	588978	588985	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13031	NC_020942	A	8	8	589024	589031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13035	NC_020942	GCT	2	6	589100	589105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456360
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13054	NC_020942	GTAC	2	8	589938	589945	25 %	25 %	25 %	25 %	478456361
13055	NC_020942	TAA	2	6	589948	589953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456361
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13069	NC_020942	GTA	2	6	590471	590476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456361
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13088	NC_020942	T	6	6	591453	591458	0 %	100 %	0 %	0 %	478456363
13089	NC_020942	ATTTC	2	10	591513	591522	20 %	60 %	0 %	20 %	478456363
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13094	NC_020942	TTCTC	2	10	591750	591759	0 %	60 %	0 %	40 %	478456363
13095	NC_020942	T	6	6	591765	591770	0 %	100 %	0 %	0 %	478456363
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13100	NC_020942	TCAT	2	8	591956	591963	25 %	50 %	0 %	25 %	478456363
13101	NC_020942	TTC	2	6	591970	591975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456363
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13106	NC_020942	AT	3	6	592298	592303	50 %	50 %	0 %	0 %	478456363
13107	NC_020942	CAA	2	6	592422	592427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456363
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13110	NC_020942	TCG	2	6	592566	592571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456364
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13113	NC_020942	TCCC	2	8	592666	592673	0 %	25 %	0 %	75 %	478456364
13114	NC_020942	CTT	2	6	592703	592708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456364
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13119	NC_020942	CAG	2	6	592832	592837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456364
13120	NC_020942	TAT	2	6	592859	592864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456364
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13364	NC_020942	TACA	2	8	604541	604548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13365	NC_020942	AG	3	6	604555	604560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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