MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_020942	CTC	2	6	566247	566252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456338
12503	NC_020942	ACC	2	6	566317	566322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478456338
12504	NC_020942	GCATAG	2	12	566343	566354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	478456338
12505	NC_020942	AGC	2	6	566386	566391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456338
12506	NC_020942	AAC	2	6	566455	566460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456338
12507	NC_020942	GAAA	2	8	566471	566478	75 %	0 %	25 %	0 %	478456338
12508	NC_020942	ACA	2	6	566489	566494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456338
12509	NC_020942	AAC	2	6	566506	566511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456338
12510	NC_020942	AAG	2	6	566517	566522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456338
12511	NC_020942	T	6	6	566528	566533	0 %	100 %	0 %	0 %	478456338
12512	NC_020942	GGTT	2	8	566641	566648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12514	NC_020942	AAG	2	6	566687	566692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020942	GTT	2	6	566720	566725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_020942	AAG	2	6	566747	566752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_020942	TCT	2	6	566755	566760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_020942	GCTT	2	8	566785	566792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12519	NC_020942	ACC	2	6	566811	566816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12520	NC_020942	CGAA	2	8	566834	566841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12521	NC_020942	CTTT	2	8	566871	566878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12522	NC_020942	T	8	8	566890	566897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_020942	TCT	2	6	566910	566915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_020942	AG	3	6	566924	566929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_020942	A	9	9	566950	566958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_020942	GGAT	2	8	567016	567023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12530	NC_020942	TTG	2	6	567148	567153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456339
12531	NC_020942	T	6	6	567274	567279	0 %	100 %	0 %	0 %	478456339
12532	NC_020942	CTC	2	6	567300	567305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456339
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12534	NC_020942	TCTT	2	8	567316	567323	0 %	75 %	0 %	25 %	478456339
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12542	NC_020942	CTG	2	6	567464	567469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456340
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12550	NC_020942	GAAA	2	8	567875	567882	75 %	0 %	25 %	0 %	478456340
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12554	NC_020942	A	6	6	567958	567963	100 %	0 %	0 %	0 %	478456340
12555	NC_020942	CTG	2	6	568006	568011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456340
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12562	NC_020942	AAAG	2	8	568219	568226	75 %	0 %	25 %	0 %	478456340
12563	NC_020942	GA	3	6	568422	568427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12588	NC_020942	GA	3	6	569846	569851	50 %	0 %	50 %	0 %	478456342
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12597	NC_020942	CCAC	2	8	570290	570297	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12598	NC_020942	GAAA	2	8	570354	570361	75 %	0 %	25 %	0 %	478456343
12599	NC_020942	C	6	6	570365	570370	0 %	0 %	0 %	100 %	478456343
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12605	NC_020942	GAAC	2	8	570582	570589	50 %	0 %	25 %	25 %	478456343
12606	NC_020942	CTA	2	6	570702	570707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456343
12607	NC_020942	AGATCC	2	12	570725	570736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478456343
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12609	NC_020942	CCT	2	6	570796	570801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456343
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12613	NC_020942	GA	3	6	571008	571013	50 %	0 %	50 %	0 %	478456344
12614	NC_020942	CCAT	2	8	571019	571026	25 %	25 %	0 %	50 %	478456344
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12619	NC_020942	CT	3	6	571188	571193	0 %	50 %	0 %	50 %	478456344
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12995	NC_020942	TAA	2	6	587336	587341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456357
12996	NC_020942	GC	3	6	587445	587450	0 %	0 %	50 %	50 %	478456357
12997	NC_020942	CTA	2	6	587455	587460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456357
12998	NC_020942	A	6	6	587460	587465	100 %	0 %	0 %	0 %	478456357
12999	NC_020942	ATA	2	6	587478	587483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456357
13000	NC_020942	TCA	2	6	587523	587528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456357

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