MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020942	TAA	2	6	521173	521178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_020942	CAAA	2	8	521200	521207	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11503	NC_020942	ATA	2	6	521213	521218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_020942	ACAA	2	8	521251	521258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11505	NC_020942	AATA	2	8	521274	521281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_020942	AACTAA	2	12	521282	521293	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11507	NC_020942	ATCT	2	8	521295	521302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11508	NC_020942	AACA	2	8	521314	521321	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11509	NC_020942	ACTA	2	8	521323	521330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11510	NC_020942	TA	3	6	521329	521334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_020942	A	6	6	521355	521360	100 %	0 %	0 %	0 %	478456299
11512	NC_020942	CTG	2	6	521391	521396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456299
11513	NC_020942	CCT	2	6	521398	521403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456299
11514	NC_020942	TC	3	6	521496	521501	0 %	50 %	0 %	50 %	478456299
11515	NC_020942	CTT	2	6	521527	521532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456299
11516	NC_020942	CAC	2	6	521541	521546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478456299
11517	NC_020942	GAA	2	6	521564	521569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456299
11518	NC_020942	TGC	3	9	521639	521647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456300
11519	NC_020942	CTC	2	6	521661	521666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456300
11520	NC_020942	CTT	2	6	521794	521799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456300
11521	NC_020942	ATG	2	6	521800	521805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456300
11522	NC_020942	AGA	2	6	521844	521849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456300
11523	NC_020942	CTT	2	6	521869	521874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456300
11524	NC_020942	ACA	2	6	521898	521903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456300
11525	NC_020942	CTC	2	6	521944	521949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456300
11526	NC_020942	AAG	2	6	521978	521983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456300
11527	NC_020942	GTA	2	6	522011	522016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456300
11528	NC_020942	AG	3	6	522030	522035	50 %	0 %	50 %	0 %	478456300
11529	NC_020942	GAA	2	6	522036	522041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456300
11530	NC_020942	CT	3	6	522095	522100	0 %	50 %	0 %	50 %	478456300
11531	NC_020942	CTT	2	6	522279	522284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456300
11532	NC_020942	T	6	6	522283	522288	0 %	100 %	0 %	0 %	478456300
11533	NC_020942	A	6	6	522309	522314	100 %	0 %	0 %	0 %	478456300
11534	NC_020942	TTCT	2	8	522326	522333	0 %	75 %	0 %	25 %	478456300
11535	NC_020942	AGA	2	6	522362	522367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456300
11536	NC_020942	CCCA	2	8	522396	522403	25 %	0 %	0 %	75 %	478456300
11537	NC_020942	AGA	2	6	522416	522421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456300
11538	NC_020942	ATC	2	6	522487	522492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456300
11539	NC_020942	ACGAC	2	10	522572	522581	40 %	0 %	20 %	40 %	478456300
11540	NC_020942	CTCTT	2	10	522655	522664	0 %	60 %	0 %	40 %	478456300
11541	NC_020942	TCC	2	6	522709	522714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456300
11542	NC_020942	GAG	2	6	522762	522767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456300
11543	NC_020942	T	6	6	522817	522822	0 %	100 %	0 %	0 %	478456300
11544	NC_020942	CTC	2	6	522864	522869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456300
11545	NC_020942	CAC	2	6	522902	522907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478456300
11546	NC_020942	CTA	2	6	523105	523110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_020942	AGGAA	2	10	523115	523124	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_020942	ATGAA	2	10	523139	523148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020942	AG	3	6	523227	523232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020942	ATTC	2	8	523233	523240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11551	NC_020942	CAA	2	6	523290	523295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_020942	A	12	12	523294	523305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020942	CTG	2	6	523346	523351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_020942	TCTCTA	2	12	523368	523379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478456301
11555	NC_020942	TC	3	6	523435	523440	0 %	50 %	0 %	50 %	478456301
11556	NC_020942	CTTC	2	8	523472	523479	0 %	50 %	0 %	50 %	478456301
11557	NC_020942	TCT	2	6	523583	523588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456301
11558	NC_020942	AGT	2	6	523740	523745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456301
11559	NC_020942	TCT	2	6	523763	523768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456301
11560	NC_020942	ATAG	2	8	523782	523789	50 %	25 %	25 %	0 %	478456301
11561	NC_020942	TCT	2	6	523864	523869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456301
11562	NC_020942	TGC	2	6	523870	523875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456301
11563	NC_020942	TGAACT	2	12	523876	523887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478456301
11564	NC_020942	TTG	2	6	523911	523916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456301
11565	NC_020942	TCC	2	6	523941	523946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_020942	AAT	2	6	523992	523997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_020942	AGCG	2	8	524100	524107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11568	NC_020942	CAA	2	6	524156	524161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_020942	A	6	6	524160	524165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_020942	TTA	2	6	524167	524172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_020942	AAAT	2	8	524190	524197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_020942	T	6	6	524226	524231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_020942	GA	3	6	524239	524244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_020942	AG	3	6	524275	524280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_020942	ATA	2	6	524282	524287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_020942	CAA	2	6	524376	524381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456302
11577	NC_020942	ATA	2	6	524410	524415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456302
11578	NC_020942	TC	3	6	524508	524513	0 %	50 %	0 %	50 %	478456302
11579	NC_020942	TAA	2	6	524550	524555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456302
11580	NC_020942	AGA	2	6	524588	524593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456302
11581	NC_020942	AAG	2	6	524625	524630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456302
11582	NC_020942	GA	3	6	524663	524668	50 %	0 %	50 %	0 %	478456302
11583	NC_020942	ATCC	2	8	524670	524677	25 %	25 %	0 %	50 %	478456302
11584	NC_020942	CAT	2	6	524705	524710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456302
11585	NC_020942	AGA	2	6	524721	524726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456302
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11587	NC_020942	TCT	2	6	524770	524775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456302
11588	NC_020942	A	6	6	524820	524825	100 %	0 %	0 %	0 %	478456302
11589	NC_020942	GAA	2	6	524840	524845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456302
11590	NC_020942	TAA	2	6	524850	524855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456302
11591	NC_020942	AAT	2	6	524910	524915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456302
11592	NC_020942	AAT	2	6	524955	524960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456302
11593	NC_020942	ACA	2	6	525094	525099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456302
11594	NC_020942	TAATTC	2	12	525206	525217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	478456302
11595	NC_020942	CGA	2	6	525228	525233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456302
11596	NC_020942	T	6	6	525271	525276	0 %	100 %	0 %	0 %	478456302
11597	NC_020942	TC	3	6	525335	525340	0 %	50 %	0 %	50 %	478456302
11598	NC_020942	A	6	6	525388	525393	100 %	0 %	0 %	0 %	478456302
11599	NC_020942	AAG	2	6	525419	525424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456302
11600	NC_020942	CTG	2	6	525429	525434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456302
11601	NC_020942	TTC	2	6	525441	525446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456302
11602	NC_020942	ACTCCT	2	12	525475	525486	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478456302
11603	NC_020942	TGCAA	2	10	525537	525546	40 %	20 %	20 %	20 %	478456302
11604	NC_020942	CTG	2	6	525629	525634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456302
11605	NC_020942	GCA	2	6	525677	525682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456302
11606	NC_020942	AAG	2	6	525695	525700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456302
11607	NC_020942	TC	3	6	525704	525709	0 %	50 %	0 %	50 %	478456302
11608	NC_020942	TGT	2	6	525712	525717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456302
11609	NC_020942	ATC	2	6	525826	525831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456302
11610	NC_020942	ATT	2	6	525840	525845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456302
11611	NC_020942	TAC	2	6	525867	525872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456302
11612	NC_020942	GAG	2	6	525913	525918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456302
11613	NC_020942	GATGAA	2	12	525995	526006	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478456302
11614	NC_020942	TCT	2	6	526019	526024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456302
11615	NC_020942	GGA	2	6	526071	526076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456302
11616	NC_020942	TACC	2	8	526096	526103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11617	NC_020942	GGA	2	6	526104	526109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_020942	A	8	8	526121	526128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_020942	CTCC	2	8	526130	526137	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11620	NC_020942	AGG	2	6	526144	526149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_020942	ATC	2	6	526164	526169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_020942	TCA	2	6	526205	526210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_020942	TTC	2	6	526230	526235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456303
11624	NC_020942	GGA	2	6	526261	526266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456303
11625	NC_020942	TA	3	6	526269	526274	50 %	50 %	0 %	0 %	478456303
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