MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_020942	TTG	2	6	498059	498064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_020942	A	7	7	498118	498124	100 %	0 %	0 %	0 %	478456274
11004	NC_020942	ATT	2	6	498235	498240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456274
11005	NC_020942	GA	3	6	498289	498294	50 %	0 %	50 %	0 %	478456275
11006	NC_020942	A	6	6	498372	498377	100 %	0 %	0 %	0 %	478456275
11007	NC_020942	CTT	2	6	498387	498392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456275
11008	NC_020942	AAGT	2	8	498408	498415	50 %	25 %	25 %	0 %	478456275
11009	NC_020942	T	8	8	498420	498427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_020942	GATC	2	8	498438	498445	25 %	25 %	25 %	25 %	478456276
11011	NC_020942	AAC	2	6	498472	498477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456276
11012	NC_020942	TTG	2	6	498514	498519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456276
11013	NC_020942	GAC	2	6	498576	498581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456276
11014	NC_020942	TTCCT	2	10	498671	498680	0 %	60 %	0 %	40 %	478456276
11015	NC_020942	AGC	2	6	498713	498718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456276
11016	NC_020942	GTC	2	6	498777	498782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456276
11017	NC_020942	ATG	2	6	498808	498813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456276
11018	NC_020942	CAT	2	6	498836	498841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456276
11019	NC_020942	CCTTT	2	10	498863	498872	0 %	60 %	0 %	40 %	478456276
11020	NC_020942	TTA	2	6	498891	498896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456276
11021	NC_020942	AAT	2	6	499003	499008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_020942	TCA	2	6	499039	499044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456277
11023	NC_020942	TA	3	6	499048	499053	50 %	50 %	0 %	0 %	478456277
11024	NC_020942	CTG	2	6	499056	499061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456277
11025	NC_020942	TAT	2	6	499064	499069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456277
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11029	NC_020942	TTC	2	6	499168	499173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456277
11030	NC_020942	CTT	2	6	499232	499237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456277
11031	NC_020942	CT	3	6	499238	499243	0 %	50 %	0 %	50 %	478456277
11032	NC_020942	T	6	6	499255	499260	0 %	100 %	0 %	0 %	478456277
11033	NC_020942	GAC	2	6	499326	499331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456277
11034	NC_020942	CTC	3	9	499426	499434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456277
11035	NC_020942	TGA	2	6	499613	499618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456277
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11039	NC_020942	CT	3	6	499739	499744	0 %	50 %	0 %	50 %	478456277
11040	NC_020942	TCG	2	6	499837	499842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456277
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11042	NC_020942	A	7	7	499899	499905	100 %	0 %	0 %	0 %	478456277
11043	NC_020942	AGT	2	6	499986	499991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456277
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11046	NC_020942	CGTAG	2	10	500100	500109	20 %	20 %	40 %	20 %	478456277
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11048	NC_020942	AAG	3	9	500129	500137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456277
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11051	NC_020942	TGT	2	6	500202	500207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_020942	TAG	2	6	500225	500230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_020942	ACT	2	6	500314	500319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11055	NC_020942	TCTCC	2	10	500412	500421	0 %	40 %	0 %	60 %	478456278
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11059	NC_020942	TG	3	6	500742	500747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_020942	A	6	6	500754	500759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11065	NC_020942	GACG	2	8	500999	501006	25 %	0 %	50 %	25 %	478456279
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11082	NC_020942	TGA	2	6	501924	501929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456279
11083	NC_020942	TA	3	6	501987	501992	50 %	50 %	0 %	0 %	478456279
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11091	NC_020942	AATA	2	8	502328	502335	75 %	25 %	0 %	0 %	478456279
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11093	NC_020942	TCGA	2	8	502523	502530	25 %	25 %	25 %	25 %	478456279
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11096	NC_020942	CGA	2	6	502597	502602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456279
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11098	NC_020942	TAC	2	6	502664	502669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456279
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11100	NC_020942	CTA	2	6	502829	502834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_020942	CTG	2	6	502870	502875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_020942	AAG	2	6	502883	502888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_020942	ACT	2	6	502926	502931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_020942	GAC	2	6	502934	502939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456280
11105	NC_020942	CCTA	2	8	502955	502962	25 %	25 %	0 %	50 %	478456280
11106	NC_020942	TGA	2	6	502988	502993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456280
11107	NC_020942	GAA	2	6	503019	503024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456280
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11109	NC_020942	TCG	2	6	503127	503132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456280
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11112	NC_020942	AAG	2	6	503434	503439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456280
11113	NC_020942	TGG	2	6	503480	503485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478456280
11114	NC_020942	GA	3	6	503515	503520	50 %	0 %	50 %	0 %	478456280
11115	NC_020942	GA	3	6	503623	503628	50 %	0 %	50 %	0 %	478456280
11116	NC_020942	GC	3	6	503663	503668	0 %	0 %	50 %	50 %	478456280
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11123	NC_020942	ATA	2	6	503991	503996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456280
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11162	NC_020942	CTC	3	9	505680	505688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456283
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11235	NC_020942	AATCT	2	10	509500	509509	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11236	NC_020942	TGA	2	6	509512	509517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11238	NC_020942	TAACTA	2	12	509555	509566	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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11240	NC_020942	AAG	2	6	509688	509693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11241	NC_020942	CTA	2	6	509698	509703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11242	NC_020942	A	6	6	509706	509711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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