MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_020942	ATT	2	6	319802	319807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456126
7004	NC_020942	GAA	2	6	319813	319818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456126
7005	NC_020942	ATC	2	6	319820	319825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456126
7006	NC_020942	CTT	2	6	319921	319926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456126
7007	NC_020942	TAA	2	6	319927	319932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456126
7008	NC_020942	AAG	2	6	319942	319947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456126
7009	NC_020942	GAT	2	6	319992	319997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456126
7010	NC_020942	GAAT	2	8	320019	320026	50 %	25 %	25 %	0 %	478456126
7011	NC_020942	AAT	2	6	320053	320058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456126
7012	NC_020942	T	6	6	320060	320065	0 %	100 %	0 %	0 %	478456126
7013	NC_020942	ATA	2	6	320073	320078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456126
7014	NC_020942	A	8	8	320109	320116	100 %	0 %	0 %	0 %	478456127
7015	NC_020942	CTT	2	6	320117	320122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456127
7016	NC_020942	ATA	2	6	320168	320173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456127
7017	NC_020942	CAA	2	6	320200	320205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456127
7018	NC_020942	CTT	2	6	320273	320278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456127
7019	NC_020942	A	6	6	320360	320365	100 %	0 %	0 %	0 %	478456127
7020	NC_020942	CTAA	2	8	320410	320417	50 %	25 %	0 %	25 %	478456127
7021	NC_020942	CTT	2	6	320459	320464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456127
7022	NC_020942	TCT	2	6	320494	320499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456127
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7031	NC_020942	AGGT	2	8	321100	321107	25 %	25 %	50 %	0 %	478456127
7032	NC_020942	TCT	2	6	321124	321129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456127
7033	NC_020942	AAACT	2	10	321140	321149	60 %	20 %	0 %	20 %	478456127
7034	NC_020942	TA	3	6	321263	321268	50 %	50 %	0 %	0 %	478456127
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7040	NC_020942	T	7	7	321454	321460	0 %	100 %	0 %	0 %	478456127
7041	NC_020942	AACAT	2	10	321473	321482	60 %	20 %	0 %	20 %	478456127
7042	NC_020942	AGA	2	6	321495	321500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456127
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7045	NC_020942	AGC	2	6	321675	321680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456127
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7052	NC_020942	A	6	6	321970	321975	100 %	0 %	0 %	0 %	478456127
7053	NC_020942	AAG	2	6	321984	321989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456127
7054	NC_020942	TTTG	2	8	322053	322060	0 %	75 %	25 %	0 %	478456127
7055	NC_020942	AAAC	2	8	322102	322109	75 %	0 %	0 %	25 %	478456127
7056	NC_020942	CTT	2	6	322134	322139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456127
7057	NC_020942	A	6	6	322152	322157	100 %	0 %	0 %	0 %	478456127
7058	NC_020942	CTT	2	6	322173	322178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_020942	T	6	6	322177	322182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_020942	AAT	2	6	322186	322191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_020942	A	9	9	322201	322209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_020942	ACT	2	6	322215	322220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_020942	AG	3	6	322241	322246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_020942	TTG	2	6	322278	322283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_020942	ATT	2	6	322290	322295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_020942	GGA	2	6	322324	322329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_020942	TCC	2	6	322340	322345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_020942	AGA	2	6	322354	322359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_020942	AAT	2	6	322399	322404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456128
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7078	NC_020942	AT	3	6	322850	322855	50 %	50 %	0 %	0 %	478456128
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7104	NC_020942	CTC	2	6	324030	324035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456129
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7106	NC_020942	CA	3	6	324082	324087	50 %	0 %	0 %	50 %	478456129
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7109	NC_020942	ATTG	2	8	324160	324167	25 %	50 %	25 %	0 %	478456129
7110	NC_020942	TAT	2	6	324267	324272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456129
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7114	NC_020942	TAA	2	6	324357	324362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456129
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7119	NC_020942	TAAA	2	8	324537	324544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_020942	CAGA	2	8	324545	324552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7121	NC_020942	AAC	2	6	324554	324559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_020942	TAA	2	6	324606	324611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_020942	AATA	2	8	324612	324619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_020942	A	6	6	324632	324637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7126	NC_020942	CAT	2	6	324714	324719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7255	NC_020942	ATG	2	6	330220	330225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456132
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7500	NC_020942	ATT	2	6	340830	340835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456144

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