MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_020942	CGAA	2	8	296966	296973	50 %	0 %	25 %	25 %	478456102
6503	NC_020942	CCT	2	6	296976	296981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456102
6504	NC_020942	TGT	2	6	296982	296987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456102
6505	NC_020942	CCT	2	6	296988	296993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456102
6506	NC_020942	ATT	2	6	297000	297005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456102
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6509	NC_020942	AGT	2	6	297153	297158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456102
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6512	NC_020942	AAGT	2	8	297312	297319	50 %	25 %	25 %	0 %	478456102
6513	NC_020942	TGCT	2	8	297332	297339	0 %	50 %	25 %	25 %	478456102
6514	NC_020942	CTG	2	6	297355	297360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456102
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6518	NC_020942	TA	3	6	297639	297644	50 %	50 %	0 %	0 %	478456102
6519	NC_020942	CTT	2	6	297735	297740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456103
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6536	NC_020942	T	7	7	298480	298486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6538	NC_020942	GTT	2	6	298521	298526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_020942	A	8	8	298543	298550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6541	NC_020942	C	13	13	298605	298617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6542	NC_020942	A	6	6	298645	298650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_020942	TAA	2	6	298693	298698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_020942	AAT	2	6	298746	298751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456104
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6550	NC_020942	TAC	2	6	299065	299070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456104
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6553	NC_020942	T	6	6	299235	299240	0 %	100 %	0 %	0 %	478456105
6554	NC_020942	AGAT	2	8	299265	299272	50 %	25 %	25 %	0 %	478456105
6555	NC_020942	AGCT	2	8	299289	299296	25 %	25 %	25 %	25 %	478456105
6556	NC_020942	CGAG	2	8	299313	299320	25 %	0 %	50 %	25 %	478456105
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6560	NC_020942	GAA	2	6	299642	299647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456105
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6565	NC_020942	TCTT	2	8	299971	299978	0 %	75 %	0 %	25 %	478456106
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6614	NC_020942	T	7	7	301957	301963	0 %	100 %	0 %	0 %	478456108
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6998	NC_020942	TGG	2	6	319417	319422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478456125
6999	NC_020942	TGG	2	6	319449	319454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478456125
7000	NC_020942	ATGGCT	2	12	319557	319568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478456125

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