MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 22938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_020941	CAA	2	6	566379	566384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457238
12503	NC_020941	CTC	2	6	566410	566415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457238
12504	NC_020941	CTT	2	6	566479	566484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457238
12505	NC_020941	CGTC	2	8	566486	566493	0 %	25 %	25 %	50 %	478457238
12506	NC_020941	CCA	2	6	566513	566518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_020941	A	6	6	566520	566525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_020941	A	6	6	566533	566538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_020941	ATT	2	6	566542	566547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_020941	ACAA	2	8	566559	566566	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12511	NC_020941	ATT	2	6	566574	566579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_020941	AAT	2	6	566585	566590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_020941	ATTTT	2	10	566597	566606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_020941	AAAAAT	2	12	566617	566628	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020941	A	6	6	566643	566648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_020941	TTG	2	6	566712	566717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457239
12517	NC_020941	CCT	2	6	566753	566758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457239
12518	NC_020941	AAAG	2	8	566813	566820	75 %	0 %	25 %	0 %	478457239
12519	NC_020941	CTA	2	6	566861	566866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457239
12520	NC_020941	ATC	2	6	566918	566923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457239
12521	NC_020941	AAC	2	6	567066	567071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457240
12522	NC_020941	ACA	2	6	567100	567105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457240
12523	NC_020941	TTC	2	6	567107	567112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457240
12524	NC_020941	ATCA	2	8	567248	567255	50 %	25 %	0 %	25 %	478457240
12525	NC_020941	TCC	2	6	567281	567286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457240
12526	NC_020941	GAA	2	6	567311	567316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457240
12527	NC_020941	GTT	2	6	567508	567513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457240
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12530	NC_020941	ATT	2	6	567617	567622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457240
12531	NC_020941	GAG	2	6	567673	567678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457240
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12533	NC_020941	ACG	2	6	567941	567946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457240
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12535	NC_020941	GGAA	2	8	567980	567987	50 %	0 %	50 %	0 %	478457240
12536	NC_020941	TCA	2	6	568065	568070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457240
12537	NC_020941	TTTC	2	8	568228	568235	0 %	75 %	0 %	25 %	478457240
12538	NC_020941	TCT	2	6	568236	568241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457240
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12540	NC_020941	CT	3	6	568338	568343	0 %	50 %	0 %	50 %	478457240
12541	NC_020941	CGA	2	6	568391	568396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457241
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12544	NC_020941	T	6	6	568446	568451	0 %	100 %	0 %	0 %	478457241
12545	NC_020941	AGA	2	6	568459	568464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457241
12546	NC_020941	T	7	7	568509	568515	0 %	100 %	0 %	0 %	478457241
12547	NC_020941	ACA	2	6	568596	568601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457241
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12550	NC_020941	TCT	2	6	568697	568702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457241
12551	NC_020941	CTA	2	6	568754	568759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457241
12552	NC_020941	T	6	6	568966	568971	0 %	100 %	0 %	0 %	478457242
12553	NC_020941	ACAG	2	8	568999	569006	50 %	0 %	25 %	25 %	478457242
12554	NC_020941	TTC	2	6	569058	569063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457242
12555	NC_020941	ATA	2	6	569078	569083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457242
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12557	NC_020941	TTAA	2	8	569164	569171	50 %	50 %	0 %	0 %	478457242
12558	NC_020941	GCA	2	6	569176	569181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457242
12559	NC_020941	CT	3	6	569265	569270	0 %	50 %	0 %	50 %	478457242
12560	NC_020941	TAA	2	6	569324	569329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457242
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12562	NC_020941	CTG	2	6	569424	569429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457242
12563	NC_020941	GCT	3	9	569471	569479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457242
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12565	NC_020941	AAT	2	6	569612	569617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457242
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12570	NC_020941	TCT	2	6	569878	569883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457242
12571	NC_020941	TTC	2	6	570027	570032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457242
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12574	NC_020941	AAGC	2	8	570212	570219	50 %	0 %	25 %	25 %	478457242
12575	NC_020941	C	6	6	570275	570280	0 %	0 %	0 %	100 %	478457242
12576	NC_020941	A	7	7	570290	570296	100 %	0 %	0 %	0 %	478457242
12577	NC_020941	GAAA	2	8	570339	570346	75 %	0 %	25 %	0 %	478457242
12578	NC_020941	CACT	2	8	570359	570366	25 %	25 %	0 %	50 %	478457242
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12595	NC_020941	T	6	6	571191	571196	0 %	100 %	0 %	0 %	478457242
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12600	NC_020941	T	6	6	571542	571547	0 %	100 %	0 %	0 %	478457242
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12603	NC_020941	AACCC	2	10	571686	571695	40 %	0 %	0 %	60 %	478457243
12604	NC_020941	TTC	2	6	571738	571743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457243
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12607	NC_020941	CTT	2	6	571785	571790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457243
12608	NC_020941	GCTT	2	8	571796	571803	0 %	50 %	25 %	25 %	478457243
12609	NC_020941	AATA	2	8	571807	571814	75 %	25 %	0 %	0 %	478457243
12610	NC_020941	AAC	2	6	571870	571875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457243
12611	NC_020941	GAA	2	6	571946	571951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457243
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12994	NC_020941	GCAA	2	8	588172	588179	50 %	0 %	25 %	25 %	478457259
12995	NC_020941	T	6	6	588197	588202	0 %	100 %	0 %	0 %	478457259
12996	NC_020941	GCA	2	6	588314	588319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457260
12997	NC_020941	TC	3	6	588378	588383	0 %	50 %	0 %	50 %	478457260
12998	NC_020941	TCTT	2	8	588397	588404	0 %	75 %	0 %	25 %	478457260
12999	NC_020941	GTTGT	2	10	588456	588465	0 %	60 %	40 %	0 %	478457260
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