MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 22938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020941	TCA	2	6	520714	520719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457196
11502	NC_020941	TC	4	8	520732	520739	0 %	50 %	0 %	50 %	478457196
11503	NC_020941	GAT	2	6	520811	520816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457196
11504	NC_020941	CAG	2	6	520859	520864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457196
11505	NC_020941	TAG	2	6	520882	520887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457196
11506	NC_020941	ATA	2	6	521031	521036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457196
11507	NC_020941	CAG	2	6	521105	521110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457196
11508	NC_020941	GTA	2	6	521144	521149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457196
11509	NC_020941	CAACA	2	10	521183	521192	60 %	0 %	0 %	40 %	478457196
11510	NC_020941	GA	3	6	521193	521198	50 %	0 %	50 %	0 %	478457196
11511	NC_020941	CTT	2	6	521242	521247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457196
11512	NC_020941	CTCC	2	8	521421	521428	0 %	25 %	0 %	75 %	478457196
11513	NC_020941	T	6	6	521442	521447	0 %	100 %	0 %	0 %	478457196
11514	NC_020941	CTT	2	6	521461	521466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457196
11515	NC_020941	TTG	2	6	521495	521500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457196
11516	NC_020941	CT	3	6	521657	521662	0 %	50 %	0 %	50 %	478457196
11517	NC_020941	AAG	2	6	521704	521709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457196
11518	NC_020941	CT	3	6	521750	521755	0 %	50 %	0 %	50 %	478457196
11519	NC_020941	GAG	2	6	521842	521847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457196
11520	NC_020941	CTT	2	6	521919	521924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457196
11521	NC_020941	AGA	2	6	521984	521989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457196
11522	NC_020941	CTG	2	6	521995	522000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457196
11523	NC_020941	TCA	2	6	522087	522092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457196
11524	NC_020941	TAA	2	6	522122	522127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457196
11525	NC_020941	CCT	2	6	522168	522173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457196
11526	NC_020941	TCT	2	6	522355	522360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457196
11527	NC_020941	TAC	2	6	522371	522376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457196
11528	NC_020941	TGT	2	6	522561	522566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457196
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11530	NC_020941	TTC	2	6	522578	522583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457196
11531	NC_020941	GCC	2	6	522855	522860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478457196
11532	NC_020941	AACT	2	8	522980	522987	50 %	25 %	0 %	25 %	478457196
11533	NC_020941	AGC	2	6	522998	523003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457196
11534	NC_020941	AAC	2	6	523026	523031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457196
11535	NC_020941	GA	3	6	523069	523074	50 %	0 %	50 %	0 %	478457196
11536	NC_020941	CAA	2	6	523087	523092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457196
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11539	NC_020941	CTTC	2	8	523180	523187	0 %	50 %	0 %	50 %	478457196
11540	NC_020941	TGT	2	6	523197	523202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457196
11541	NC_020941	ATAA	2	8	523401	523408	75 %	25 %	0 %	0 %	478457196
11542	NC_020941	TTG	2	6	523411	523416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457196
11543	NC_020941	AAAG	2	8	523470	523477	75 %	0 %	25 %	0 %	478457196
11544	NC_020941	AAG	2	6	523492	523497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457196
11545	NC_020941	AAC	2	6	523520	523525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457196
11546	NC_020941	TC	3	6	523528	523533	0 %	50 %	0 %	50 %	478457196
11547	NC_020941	ACA	2	6	523554	523559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457196
11548	NC_020941	AATA	2	8	523613	523620	75 %	25 %	0 %	0 %	478457196
11549	NC_020941	TCT	2	6	523629	523634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457196
11550	NC_020941	TGC	2	6	523677	523682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457196
11551	NC_020941	CAAAGC	2	12	523859	523870	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478457196
11552	NC_020941	AAT	3	9	523880	523888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457196
11553	NC_020941	AGC	2	6	523977	523982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_020941	GAAG	2	8	523985	523992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_020941	AT	3	6	524011	524016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_020941	AAAG	2	8	524024	524031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_020941	T	6	6	524072	524077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_020941	TTGGA	2	10	524095	524104	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_020941	T	6	6	524118	524123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_020941	ACA	2	6	524126	524131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_020941	AACC	2	8	524159	524166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11562	NC_020941	A	7	7	524230	524236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_020941	T	6	6	524252	524257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_020941	A	7	7	524303	524309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_020941	AGA	2	6	524356	524361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457197
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11567	NC_020941	CAA	2	6	524425	524430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457197
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11570	NC_020941	ACTC	2	8	524650	524657	25 %	25 %	0 %	50 %	478457197
11571	NC_020941	TCA	2	6	524686	524691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_020941	A	7	7	524696	524702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_020941	CTAA	2	8	524717	524724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11574	NC_020941	AAT	2	6	524741	524746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_020941	ACTT	2	8	524751	524758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11576	NC_020941	GCT	2	6	524842	524847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_020941	CAAAA	2	10	524861	524870	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11578	NC_020941	AGA	2	6	524919	524924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_020941	ATA	2	6	524953	524958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_020941	CTA	2	6	525027	525032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_020941	CTTTAG	2	12	525137	525148	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478457198
11582	NC_020941	TCCC	2	8	525190	525197	0 %	25 %	0 %	75 %	478457198
11583	NC_020941	CAT	3	9	525210	525218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457198
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11591	NC_020941	ATTA	2	8	525583	525590	50 %	50 %	0 %	0 %	478457198
11592	NC_020941	A	7	7	525649	525655	100 %	0 %	0 %	0 %	478457198
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11596	NC_020941	TTC	2	6	525967	525972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457199
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11601	NC_020941	TTCT	2	8	526215	526222	0 %	75 %	0 %	25 %	478457199
11602	NC_020941	CTT	2	6	526223	526228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457199
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11604	NC_020941	TCC	2	6	526339	526344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457199
11605	NC_020941	TGG	2	6	526392	526397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478457199
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11607	NC_020941	CTT	2	6	526445	526450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457199
11608	NC_020941	A	6	6	526467	526472	100 %	0 %	0 %	0 %	478457199
11609	NC_020941	AGT	2	6	526505	526510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457199
11610	NC_020941	ATCT	2	8	526535	526542	25 %	50 %	0 %	25 %	478457199
11611	NC_020941	CTT	2	6	526551	526556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457199
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11615	NC_020941	TCC	2	6	526780	526785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457199
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11621	NC_020941	TTTC	2	8	526995	527002	0 %	75 %	0 %	25 %	478457200
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11623	NC_020941	TCT	2	6	527226	527231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457200
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11731	NC_020941	N	144	144	531960	532103	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11732	NC_020941	AGC	3	9	532104	532112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11734	NC_020941	ACA	2	6	532141	532146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11735	NC_020941	CTTC	2	8	532204	532211	0 %	50 %	0 %	50 %	478457204
11736	NC_020941	AGT	2	6	532321	532326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457204
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11739	NC_020941	AAT	2	6	532552	532557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457204
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11742	NC_020941	TAG	2	6	532719	532724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457204
11743	NC_020941	GCT	2	6	532777	532782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457204
11744	NC_020941	ATC	2	6	532810	532815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457204
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11746	NC_020941	ACACC	2	10	532880	532889	40 %	0 %	0 %	60 %	478457204
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