MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 22938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_020941	TC	3	6	498415	498420	0 %	50 %	0 %	50 %	478457175
11003	NC_020941	TTG	2	6	498515	498520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457175
11004	NC_020941	CAA	2	6	498527	498532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457175
11005	NC_020941	AC	3	6	498598	498603	50 %	0 %	0 %	50 %	478457175
11006	NC_020941	ATA	2	6	498617	498622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457175
11007	NC_020941	CGTTT	2	10	498623	498632	0 %	60 %	20 %	20 %	478457175
11008	NC_020941	TATCC	2	10	498662	498671	20 %	40 %	0 %	40 %	478457175
11009	NC_020941	GGA	2	6	498712	498717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457175
11010	NC_020941	TTG	2	6	498794	498799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457175
11011	NC_020941	GAAA	2	8	498852	498859	75 %	0 %	25 %	0 %	478457175
11012	NC_020941	ACT	2	6	498939	498944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457175
11013	NC_020941	CTT	2	6	499019	499024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457176
11014	NC_020941	TTC	2	6	499044	499049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457176
11015	NC_020941	CTT	2	6	499063	499068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457176
11016	NC_020941	CGT	3	9	499069	499077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457176
11017	NC_020941	CTC	2	6	499079	499084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457176
11018	NC_020941	GAA	2	6	499088	499093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457176
11019	NC_020941	TC	3	6	499102	499107	0 %	50 %	0 %	50 %	478457176
11020	NC_020941	CTC	3	9	499201	499209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457176
11021	NC_020941	TTC	3	9	499226	499234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457176
11022	NC_020941	GAA	2	6	499263	499268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457176
11023	NC_020941	CGT	2	6	499299	499304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457176
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11029	NC_020941	AAACTG	2	12	499553	499564	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478457176
11030	NC_020941	ATT	2	6	499565	499570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457176
11031	NC_020941	ATG	2	6	499584	499589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457176
11032	NC_020941	T	6	6	499732	499737	0 %	100 %	0 %	0 %	478457176
11033	NC_020941	TCT	2	6	499759	499764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457176
11034	NC_020941	TTC	2	6	499814	499819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457176
11035	NC_020941	TC	4	8	499908	499915	0 %	50 %	0 %	50 %	478457176
11036	NC_020941	TCA	2	6	499917	499922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457176
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11038	NC_020941	GTC	2	6	499989	499994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457176
11039	NC_020941	CT	4	8	500033	500040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11040	NC_020941	ACC	2	6	500086	500091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457177
11041	NC_020941	A	6	6	500155	500160	100 %	0 %	0 %	0 %	478457177
11042	NC_020941	CTA	2	6	500175	500180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457177
11043	NC_020941	AC	3	6	500186	500191	50 %	0 %	0 %	50 %	478457177
11044	NC_020941	ATC	2	6	500318	500323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457177
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11047	NC_020941	CTTA	2	8	500414	500421	25 %	50 %	0 %	25 %	478457177
11048	NC_020941	A	6	6	500465	500470	100 %	0 %	0 %	0 %	478457177
11049	NC_020941	T	6	6	500519	500524	0 %	100 %	0 %	0 %	478457177
11050	NC_020941	AGA	2	6	500729	500734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457177
11051	NC_020941	AGAGA	2	10	500868	500877	60 %	0 %	40 %	0 %	478457177
11052	NC_020941	TCGA	2	8	500931	500938	25 %	25 %	25 %	25 %	478457178
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11056	NC_020941	CA	3	6	501131	501136	50 %	0 %	0 %	50 %	478457178
11057	NC_020941	TGC	2	6	501159	501164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457178
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11086	NC_020941	ATG	2	6	502852	502857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457179
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11088	NC_020941	TGA	2	6	503033	503038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_020941	ATTT	2	8	503068	503075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11091	NC_020941	AAGAAA	2	12	503089	503100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_020941	AAG	2	6	503209	503214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_020941	CTA	2	6	503219	503224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_020941	A	6	6	503227	503232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_020941	CTTCT	2	10	503234	503243	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11096	NC_020941	A	8	8	503248	503255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_020941	ATCC	2	8	503322	503329	25 %	25 %	0 %	50 %	478457180
11098	NC_020941	CTG	2	6	503346	503351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457180
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11105	NC_020941	CTCG	2	8	503681	503688	0 %	25 %	25 %	50 %	478457180
11106	NC_020941	CT	3	6	503701	503706	0 %	50 %	0 %	50 %	478457180
11107	NC_020941	TCC	2	6	503726	503731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457180
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11111	NC_020941	GA	3	6	503883	503888	50 %	0 %	50 %	0 %	478457180
11112	NC_020941	GCA	2	6	503894	503899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457180
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11114	NC_020941	T	6	6	503940	503945	0 %	100 %	0 %	0 %	478457180
11115	NC_020941	TATT	2	8	503984	503991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_020941	AAG	2	6	504009	504014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_020941	CTT	3	9	504087	504095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457181
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11119	NC_020941	AT	3	6	504119	504124	50 %	50 %	0 %	0 %	478457181
11120	NC_020941	ATT	2	6	504197	504202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457181
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11246	NC_020941	TCT	3	9	510247	510255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457188
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11353	NC_020941	TAA	2	6	514688	514693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11354	NC_020941	CAAA	2	8	514715	514722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11355	NC_020941	ATA	2	6	514728	514733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11356	NC_020941	ACAA	2	8	514766	514773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11357	NC_020941	AATA	2	8	514789	514796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11358	NC_020941	AACTAA	2	12	514797	514808	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11359	NC_020941	ATCT	2	8	514810	514817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11360	NC_020941	AACA	2	8	514829	514836	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11361	NC_020941	ACTA	2	8	514838	514845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11362	NC_020941	TA	3	6	514844	514849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_020941	A	6	6	514870	514875	100 %	0 %	0 %	0 %	478457192
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11492	NC_020941	GAA	2	6	520333	520338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457196
11493	NC_020941	GAT	2	6	520348	520353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457196
11494	NC_020941	TTCTG	2	10	520365	520374	0 %	60 %	20 %	20 %	478457196
11495	NC_020941	AT	3	6	520424	520429	50 %	50 %	0 %	0 %	478457196
11496	NC_020941	TTG	2	6	520490	520495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457196
11497	NC_020941	CA	4	8	520540	520547	50 %	0 %	0 %	50 %	478457196
11498	NC_020941	ATCC	2	8	520583	520590	25 %	25 %	0 %	50 %	478457196
11499	NC_020941	ACT	2	6	520644	520649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457196
11500	NC_020941	AAG	2	6	520683	520688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457196

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