MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 22938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020941	A	6	6	318318	318323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_020941	A	7	7	318338	318344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_020941	CAT	2	6	318400	318405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_020941	A	6	6	318509	318514	100 %	0 %	0 %	0 %	478457023
7005	NC_020941	GAA	2	6	318715	318720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457023
7006	NC_020941	GAA	2	6	318740	318745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457023
7007	NC_020941	GCT	2	6	318746	318751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457023
7008	NC_020941	TCAA	2	8	318801	318808	50 %	25 %	0 %	25 %	478457023
7009	NC_020941	ATTTA	2	10	318895	318904	40 %	60 %	0 %	0 %	478457023
7010	NC_020941	C	7	7	318910	318916	0 %	0 %	0 %	100 %	478457023
7011	NC_020941	TCC	2	6	318920	318925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457023
7012	NC_020941	CTT	3	9	318951	318959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457023
7013	NC_020941	TCT	3	9	318965	318973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457023
7014	NC_020941	AGG	2	6	318979	318984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457023
7015	NC_020941	TTAATT	2	12	319112	319123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457023
7016	NC_020941	GTC	2	6	319128	319133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457023
7017	NC_020941	GAA	2	6	319134	319139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457023
7018	NC_020941	A	6	6	319138	319143	100 %	0 %	0 %	0 %	478457023
7019	NC_020941	A	6	6	319244	319249	100 %	0 %	0 %	0 %	478457023
7020	NC_020941	GAA	2	6	319310	319315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457023
7021	NC_020941	GATG	2	8	319330	319337	25 %	25 %	50 %	0 %	478457023
7022	NC_020941	TTAT	2	8	319364	319371	25 %	75 %	0 %	0 %	478457023
7023	NC_020941	TGA	2	6	319372	319377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457023
7024	NC_020941	TTG	2	6	319389	319394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457023
7025	NC_020941	GCT	2	6	319403	319408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457023
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7030	NC_020941	A	6	6	319604	319609	100 %	0 %	0 %	0 %	478457023
7031	NC_020941	TCA	2	6	319632	319637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457023
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7033	NC_020941	TGC	2	6	319654	319659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457023
7034	NC_020941	CT	3	6	319667	319672	0 %	50 %	0 %	50 %	478457023
7035	NC_020941	TTC	2	6	319695	319700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457023
7036	NC_020941	A	6	6	319800	319805	100 %	0 %	0 %	0 %	478457023
7037	NC_020941	GCT	2	6	319853	319858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457023
7038	NC_020941	TGA	2	6	319867	319872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457023
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7042	NC_020941	TGA	2	6	319951	319956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457023
7043	NC_020941	AGT	2	6	319972	319977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457023
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7045	NC_020941	CGT	2	6	320111	320116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457023
7046	NC_020941	TCCT	2	8	320156	320163	0 %	50 %	0 %	50 %	478457023
7047	NC_020941	GCA	2	6	320203	320208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457023
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7051	NC_020941	CGC	2	6	320360	320365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478457023
7052	NC_020941	TGTGT	2	10	320372	320381	0 %	60 %	40 %	0 %	478457023
7053	NC_020941	TGA	2	6	320386	320391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457023
7054	NC_020941	CAT	3	9	320494	320502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457023
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7057	NC_020941	AAG	2	6	320615	320620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457023
7058	NC_020941	AAG	2	6	320682	320687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457023
7059	NC_020941	TAA	2	6	320716	320721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457023
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7061	NC_020941	AAG	2	6	320898	320903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457023
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7089	NC_020941	A	7	7	322162	322168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_020941	GCC	2	6	322181	322186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7091	NC_020941	TCAAT	2	10	322217	322226	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7092	NC_020941	A	7	7	322232	322238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_020941	TTG	2	6	322254	322259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_020941	A	6	6	322261	322266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_020941	ATA	2	6	322283	322288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_020941	TCA	2	6	322332	322337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457025
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7102	NC_020941	A	8	8	322754	322761	100 %	0 %	0 %	0 %	478457025
7103	NC_020941	AAG	2	6	322769	322774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457025
7104	NC_020941	CT	4	8	322843	322850	0 %	50 %	0 %	50 %	478457025
7105	NC_020941	GAG	2	6	322877	322882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457025
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7109	NC_020941	TA	3	6	323033	323038	50 %	50 %	0 %	0 %	478457025
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7114	NC_020941	A	6	6	323243	323248	100 %	0 %	0 %	0 %	478457025
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7124	NC_020941	ACG	2	6	323619	323624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457025
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7240	NC_020941	A	6	6	328680	328685	100 %	0 %	0 %	0 %	478457032
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7246	NC_020941	GCA	2	6	329174	329179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457032
7247	NC_020941	TCT	2	6	329195	329200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457032
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7498	NC_020941	CGC	2	6	340905	340910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478457040
7499	NC_020941	CAC	2	6	340915	340920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457040
7500	NC_020941	CAA	2	6	340968	340973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457041

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