MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 complete genome

Total Repeats: 22983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13004	NC_020940	GGTT	2	8	587635	587642	0 %	50 %	50 %	0 %	478475291
13005	NC_020940	TTC	2	6	587678	587683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478475291
13006	NC_020940	ATA	2	6	587744	587749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478475291
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13008	NC_020940	AAG	2	6	587817	587822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478475291
13009	NC_020940	GAAA	2	8	587831	587838	75 %	0 %	25 %	0 %	478475291
13010	NC_020940	CCT	2	6	587933	587938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478475291
13011	NC_020940	CT	3	6	587944	587949	0 %	50 %	0 %	50 %	478475291
13012	NC_020940	AAT	2	6	587956	587961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478475291
13013	NC_020940	AAT	2	6	588001	588006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478475291
13014	NC_020940	GGAA	2	8	588127	588134	50 %	0 %	50 %	0 %	478475291
13015	NC_020940	AAATA	2	10	588257	588266	80 %	20 %	0 %	0 %	478475291
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13018	NC_020940	ATTC	2	8	588331	588338	25 %	50 %	0 %	25 %	478475291
13019	NC_020940	A	6	6	588391	588396	100 %	0 %	0 %	0 %	478475291
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13022	NC_020940	AAC	2	6	588514	588519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478475291
13023	NC_020940	A	6	6	588561	588566	100 %	0 %	0 %	0 %	478475291
13024	NC_020940	GCAA	2	8	588680	588687	50 %	0 %	25 %	25 %	478475291
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13033	NC_020940	ATA	2	6	589231	589236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478475293
13034	NC_020940	AG	3	6	589248	589253	50 %	0 %	50 %	0 %	478475293
13035	NC_020940	AGG	2	6	589258	589263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478475293
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13039	NC_020940	T	6	6	589486	589491	0 %	100 %	0 %	0 %	478475293
13040	NC_020940	AGC	2	6	589494	589499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475293
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13051	NC_020940	CAT	2	6	589942	589947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475294
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13053	NC_020940	T	6	6	590111	590116	0 %	100 %	0 %	0 %	478475295
13054	NC_020940	GCT	2	6	590127	590132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475295
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13056	NC_020940	AACT	2	8	590234	590241	50 %	25 %	0 %	25 %	478475295
13057	NC_020940	TCTA	2	8	590477	590484	25 %	50 %	0 %	25 %	478475295
13058	NC_020940	AACA	2	8	590504	590511	75 %	0 %	0 %	25 %	478475295
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13077	NC_020940	TA	3	6	591624	591629	50 %	50 %	0 %	0 %	478475297
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13093	NC_020940	TAT	2	6	592327	592332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478475299
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13102	NC_020940	T	7	7	592646	592652	0 %	100 %	0 %	0 %	478475301
13103	NC_020940	TGA	2	6	592703	592708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478475301
13104	NC_020940	AGC	2	6	592732	592737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475301
13105	NC_020940	CGCA	2	8	592741	592748	25 %	0 %	25 %	50 %	478475301
13106	NC_020940	AG	3	6	592755	592760	50 %	0 %	50 %	0 %	478475301
13107	NC_020940	T	6	6	592762	592767	0 %	100 %	0 %	0 %	478475301
13108	NC_020940	TC	3	6	592806	592811	0 %	50 %	0 %	50 %	478475301
13109	NC_020940	TAA	2	6	592822	592827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478475301
13110	NC_020940	T	6	6	592832	592837	0 %	100 %	0 %	0 %	478475301
13111	NC_020940	GCA	2	6	592896	592901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475302
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13116	NC_020940	GGC	2	6	593128	593133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478475302
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13246	NC_020940	T	6	6	598670	598675	0 %	100 %	0 %	0 %	478475311
13247	NC_020940	AACC	2	8	598689	598696	50 %	0 %	0 %	50 %	478475311
13248	NC_020940	A	7	7	598710	598716	100 %	0 %	0 %	0 %	478475311
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