MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 23054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020939	TAT	2	6	226550	226555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448820
5002	NC_020939	TGC	2	6	226556	226561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448820
5003	NC_020939	A	7	7	226653	226659	100 %	0 %	0 %	0 %	478448820
5004	NC_020939	TTTTC	2	10	226675	226684	0 %	80 %	0 %	20 %	478448820
5005	NC_020939	TC	3	6	226789	226794	0 %	50 %	0 %	50 %	478448820
5006	NC_020939	CATT	2	8	226837	226844	25 %	50 %	0 %	25 %	478448820
5007	NC_020939	A	7	7	226880	226886	100 %	0 %	0 %	0 %	478448820
5008	NC_020939	TTA	2	6	226896	226901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448820
5009	NC_020939	TAA	2	6	226936	226941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448820
5010	NC_020939	AAC	2	6	226997	227002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448820
5011	NC_020939	TTG	2	6	227150	227155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448820
5012	NC_020939	ATA	2	6	227219	227224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448820
5013	NC_020939	TAA	2	6	227228	227233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_020939	AAAC	2	8	227244	227251	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_020939	ACAA	2	8	227296	227303	75 %	0 %	0 %	25 %	478448821
5016	NC_020939	TTC	2	6	227357	227362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448821
5017	NC_020939	CT	3	6	227491	227496	0 %	50 %	0 %	50 %	478448821
5018	NC_020939	ATT	2	6	227521	227526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448821
5019	NC_020939	ACT	2	6	227541	227546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448821
5020	NC_020939	A	7	7	227574	227580	100 %	0 %	0 %	0 %	478448821
5021	NC_020939	ATT	2	6	227641	227646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448821
5022	NC_020939	TTA	2	6	227650	227655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448821
5023	NC_020939	CTGG	2	8	227705	227712	0 %	25 %	50 %	25 %	478448821
5024	NC_020939	TAT	2	6	227727	227732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448821
5025	NC_020939	TGT	2	6	227771	227776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448821
5026	NC_020939	ATT	2	6	227848	227853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448821
5027	NC_020939	TCA	2	6	227900	227905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448821
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5029	NC_020939	CATT	2	8	227967	227974	25 %	50 %	0 %	25 %	478448821
5030	NC_020939	CTT	2	6	227997	228002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448821
5031	NC_020939	T	6	6	228013	228018	0 %	100 %	0 %	0 %	478448821
5032	NC_020939	TTA	2	6	228104	228109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448822
5033	NC_020939	GTC	2	6	228125	228130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448822
5034	NC_020939	AAC	2	6	228229	228234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448822
5035	NC_020939	GAA	2	6	228288	228293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448822
5036	NC_020939	GAA	2	6	228355	228360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448822
5037	NC_020939	AGA	2	6	228463	228468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448822
5038	NC_020939	ATTGCT	2	12	228581	228592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478448822
5039	NC_020939	ATT	2	6	228614	228619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448822
5040	NC_020939	CTA	2	6	228710	228715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448822
5041	NC_020939	TCA	2	6	228717	228722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448822
5042	NC_020939	TG	3	6	228750	228755	0 %	50 %	50 %	0 %	478448822
5043	NC_020939	TCCTAG	2	12	228871	228882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478448822
5044	NC_020939	CAA	2	6	228909	228914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448822
5045	NC_020939	AAC	2	6	228986	228991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448823
5046	NC_020939	GAG	2	6	229025	229030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448823
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5048	NC_020939	TCGA	2	8	229120	229127	25 %	25 %	25 %	25 %	478448823
5049	NC_020939	TCC	2	6	229137	229142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448823
5050	NC_020939	GAT	2	6	229170	229175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448823
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5052	NC_020939	CAT	2	6	229245	229250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448823
5053	NC_020939	G	6	6	229251	229256	0 %	0 %	100 %	0 %	478448823
5054	NC_020939	AAG	2	6	229277	229282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448823
5055	NC_020939	TAA	2	6	229341	229346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448823
5056	NC_020939	GCAACG	2	12	229359	229370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448823
5057	NC_020939	GT	3	6	229393	229398	0 %	50 %	50 %	0 %	478448823
5058	NC_020939	AATT	2	8	229406	229413	50 %	50 %	0 %	0 %	478448823
5059	NC_020939	ATTT	2	8	229469	229476	25 %	75 %	0 %	0 %	478448823
5060	NC_020939	T	6	6	229506	229511	0 %	100 %	0 %	0 %	478448823
5061	NC_020939	TCA	2	6	229514	229519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448823
5062	NC_020939	CTG	2	6	229532	229537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448823
5063	NC_020939	TAG	2	6	229583	229588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448823
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5065	NC_020939	T	8	8	229719	229726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_020939	TCCT	2	8	229869	229876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_020939	AGA	2	6	229921	229926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_020939	ATT	2	6	229958	229963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_020939	TTC	2	6	230042	230047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448824
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5075	NC_020939	TGA	2	6	230322	230327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448824
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5091	NC_020939	CTT	2	6	231101	231106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448825
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5094	NC_020939	T	6	6	231293	231298	0 %	100 %	0 %	0 %	478448825
5095	NC_020939	TAT	2	6	231368	231373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448825
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5099	NC_020939	ATT	2	6	231579	231584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448825
5100	NC_020939	CAA	2	6	231646	231651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448825
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5102	NC_020939	ACT	2	6	231726	231731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448825
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5104	NC_020939	CTTC	2	8	231775	231782	0 %	50 %	0 %	50 %	478448825
5105	NC_020939	TTAT	2	8	231877	231884	25 %	75 %	0 %	0 %	478448825
5106	NC_020939	CTAT	2	8	231896	231903	25 %	50 %	0 %	25 %	478448825
5107	NC_020939	TCTT	2	8	231943	231950	0 %	75 %	0 %	25 %	478448825
5108	NC_020939	TGC	2	6	231986	231991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448825
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5110	NC_020939	GGA	2	6	232023	232028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448825
5111	NC_020939	CA	3	6	232031	232036	50 %	0 %	0 %	50 %	478448825
5112	NC_020939	TGG	2	6	232095	232100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448825
5113	NC_020939	TTGG	2	8	232139	232146	0 %	50 %	50 %	0 %	478448825
5114	NC_020939	TGG	3	9	232158	232166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448825
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5119	NC_020939	CTA	2	6	232377	232382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448826
5120	NC_020939	ATTT	2	8	232386	232393	25 %	75 %	0 %	0 %	478448826
5121	NC_020939	TGG	2	6	232464	232469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448826
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5123	NC_020939	GAA	2	6	232663	232668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448826
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5498	NC_020939	AAG	2	6	250620	250625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448840
5499	NC_020939	TAGC	2	8	250692	250699	25 %	25 %	25 %	25 %	478448840
5500	NC_020939	CTT	2	6	250712	250717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448840

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