MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020934	A	6	6	135583	135588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_020934	GTTT	2	8	135589	135596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_020934	T	7	7	135604	135610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_020934	AAT	2	6	135629	135634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_020934	AG	4	8	135750	135757	50 %	0 %	50 %	0 %	478449639
3006	NC_020934	GGATA	2	10	135762	135771	40 %	20 %	40 %	0 %	478449639
3007	NC_020934	AG	3	6	135780	135785	50 %	0 %	50 %	0 %	478449639
3008	NC_020934	GGC	2	6	135828	135833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478449639
3009	NC_020934	GTT	2	6	135871	135876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449639
3010	NC_020934	TTG	2	6	135883	135888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449639
3011	NC_020934	TGT	2	6	135918	135923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449639
3012	NC_020934	TTC	2	6	135937	135942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449639
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3014	NC_020934	GGA	2	6	135979	135984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449639
3015	NC_020934	AG	3	6	136009	136014	50 %	0 %	50 %	0 %	478449639
3016	NC_020934	AAC	2	6	136045	136050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449639
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3019	NC_020934	AGG	2	6	136215	136220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_020934	AAC	2	6	136308	136313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449640
3021	NC_020934	AGC	2	6	136332	136337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449640
3022	NC_020934	GTT	2	6	136351	136356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449640
3023	NC_020934	ATT	2	6	136363	136368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449640
3024	NC_020934	GTG	2	6	136412	136417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449640
3025	NC_020934	TAT	2	6	136437	136442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449640
3026	NC_020934	ATTGT	2	10	136459	136468	20 %	60 %	20 %	0 %	478449640
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3032	NC_020934	GCTA	2	8	136723	136730	25 %	25 %	25 %	25 %	478449641
3033	NC_020934	CGC	2	6	136756	136761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478449641
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3035	NC_020934	TG	3	6	136808	136813	0 %	50 %	50 %	0 %	478449641
3036	NC_020934	TAG	2	6	136845	136850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449641
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3040	NC_020934	GCT	2	6	136898	136903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449641
3041	NC_020934	GGAT	2	8	136913	136920	25 %	25 %	50 %	0 %	478449641
3042	NC_020934	T	6	6	136982	136987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_020934	TGT	2	6	137035	137040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449642
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3045	NC_020934	GTT	2	6	137125	137130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449642
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3047	NC_020934	GCG	2	6	137185	137190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478449642
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3050	NC_020934	CTG	2	6	137227	137232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449642
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3056	NC_020934	CAG	2	6	137362	137367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449642
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3061	NC_020934	ACA	2	6	137501	137506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449642
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3064	NC_020934	T	8	8	137579	137586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_020934	TG	3	6	137618	137623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_020934	TTGCA	2	10	137674	137683	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3069	NC_020934	CT	3	6	137777	137782	0 %	50 %	0 %	50 %	478449643
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3090	NC_020934	AG	3	6	138863	138868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_020934	AAGAG	2	10	138926	138935	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3096	NC_020934	GTT	2	6	139098	139103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449645
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3099	NC_020934	AGAA	2	8	139406	139413	75 %	0 %	25 %	0 %	478449645
3100	NC_020934	GAAG	2	8	139452	139459	50 %	0 %	50 %	0 %	478449645
3101	NC_020934	TTGA	2	8	139464	139471	25 %	50 %	25 %	0 %	478449645
3102	NC_020934	GGT	2	6	139479	139484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449645
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3105	NC_020934	GAAA	2	8	139577	139584	75 %	0 %	25 %	0 %	478449645
3106	NC_020934	GAA	2	6	139605	139610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449645
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3109	NC_020934	GA	3	6	139762	139767	50 %	0 %	50 %	0 %	478449646
3110	NC_020934	AAG	2	6	139793	139798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449646
3111	NC_020934	T	6	6	139970	139975	0 %	100 %	0 %	0 %	478449646
3112	NC_020934	AGG	2	6	140049	140054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449646
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3114	NC_020934	TTA	2	6	140123	140128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449646
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3117	NC_020934	AAGA	2	8	140348	140355	75 %	0 %	25 %	0 %	478449647
3118	NC_020934	AG	3	6	140397	140402	50 %	0 %	50 %	0 %	478449647
3119	NC_020934	GAA	2	6	140409	140414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449647
3120	NC_020934	TTA	2	6	140504	140509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449647
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3123	NC_020934	TCCAG	2	10	140631	140640	20 %	20 %	20 %	40 %	478449647
3124	NC_020934	GAA	2	6	140682	140687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449648
3125	NC_020934	ATTG	2	8	140691	140698	25 %	50 %	25 %	0 %	478449648
3126	NC_020934	ATT	2	6	140725	140730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449648
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3129	NC_020934	GCA	2	6	140842	140847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449648
3130	NC_020934	CCTA	2	8	140852	140859	25 %	25 %	0 %	50 %	478449648
3131	NC_020934	GCT	2	6	140878	140883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449648
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3139	NC_020934	TAGAT	2	10	141735	141744	40 %	40 %	20 %	0 %	478449648
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3142	NC_020934	CTG	2	6	141767	141772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449648
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3149	NC_020934	T	8	8	142057	142064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_020934	T	6	6	142102	142107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_020934	AAG	2	6	142111	142116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_020934	AAAAG	2	10	142147	142156	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_020934	T	6	6	142171	142176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_020934	GCT	2	6	142207	142212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3156	NC_020934	ATC	2	6	142231	142236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3157	NC_020934	A	6	6	142280	142285	100 %	0 %	0 %	0 %	478449649
3158	NC_020934	CTC	2	6	142430	142435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449649
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3164	NC_020934	CTT	2	6	143056	143061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449650
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3166	NC_020934	A	6	6	143090	143095	100 %	0 %	0 %	0 %	478449650
3167	NC_020934	AT	3	6	143158	143163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_020934	CTT	2	6	143185	143190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3171	NC_020934	T	6	6	143319	143324	0 %	100 %	0 %	0 %	478449651
3172	NC_020934	GCA	2	6	143327	143332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449651
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3214	NC_020934	T	7	7	144947	144953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3215	NC_020934	T	7	7	144976	144982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3216	NC_020934	T	7	7	145009	145015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3219	NC_020934	CTGGG	2	10	145175	145184	0 %	20 %	60 %	20 %	478449653
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3231	NC_020934	AG	3	6	145552	145557	50 %	0 %	50 %	0 %	478449653
3232	NC_020934	GTA	2	6	145571	145576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449653
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3234	NC_020934	GTA	2	6	145892	145897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449654
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3236	NC_020934	GTTTT	2	10	145922	145931	0 %	80 %	20 %	0 %	478449654
3237	NC_020934	CAA	2	6	145933	145938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449654
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3239	NC_020934	A	6	6	145999	146004	100 %	0 %	0 %	0 %	478449654
3240	NC_020934	GA	4	8	146011	146018	50 %	0 %	50 %	0 %	478449654
3241	NC_020934	TCT	2	6	146040	146045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449654
3242	NC_020934	TCA	2	6	146085	146090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449654
3243	NC_020934	TGCTCT	2	12	146130	146141	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478449654
3244	NC_020934	TGA	2	6	146163	146168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449654
3245	NC_020934	TTC	2	6	146207	146212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449654
3246	NC_020934	ACG	2	6	146348	146353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449654
3247	NC_020934	AAG	2	6	146396	146401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449654
3248	NC_020934	ATT	2	6	146426	146431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449655
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3250	NC_020934	ATG	2	6	146492	146497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449655
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3371	NC_020934	AAG	2	6	152131	152136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3372	NC_020934	GTT	2	6	152139	152144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3373	NC_020934	T	9	9	152228	152236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3375	NC_020934	ATCT	2	8	152308	152315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3376	NC_020934	GCTG	2	8	152347	152354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3377	NC_020934	GA	3	6	152398	152403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3378	NC_020934	GCG	2	6	152435	152440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3379	NC_020934	GGA	2	6	152441	152446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3495	NC_020934	TGTT	2	8	157922	157929	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_020934	AG	3	6	157965	157970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_020934	TAA	2	6	157979	157984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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