MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_020934	TAG	2	6	833839	833844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450259
18503	NC_020934	AGA	2	6	833852	833857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450259
18504	NC_020934	TCA	2	6	833911	833916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450259
18505	NC_020934	CTC	2	6	833959	833964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450259
18506	NC_020934	ATC	2	6	833984	833989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450259
18507	NC_020934	ATA	2	6	834043	834048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450259
18508	NC_020934	TTC	2	6	834074	834079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450259
18509	NC_020934	AGCC	2	8	834120	834127	25 %	0 %	25 %	50 %	478450259
18510	NC_020934	CCT	2	6	834171	834176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450259
18511	NC_020934	AG	3	6	834192	834197	50 %	0 %	50 %	0 %	478450259
18512	NC_020934	AGA	2	6	834298	834303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450259
18513	NC_020934	TAG	2	6	834305	834310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450259
18514	NC_020934	AG	3	6	834309	834314	50 %	0 %	50 %	0 %	478450259
18515	NC_020934	GGA	2	6	834360	834365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450259
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18517	NC_020934	AAT	2	6	834467	834472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450259
18518	NC_020934	AGA	2	6	834497	834502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450259
18519	NC_020934	TAA	2	6	834589	834594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450259
18520	NC_020934	TACA	2	8	834713	834720	50 %	25 %	0 %	25 %	478450259
18521	NC_020934	T	6	6	834767	834772	0 %	100 %	0 %	0 %	478450259
18522	NC_020934	AGA	2	6	834815	834820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450259
18523	NC_020934	ATCACA	2	12	834837	834848	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	478450259
18524	NC_020934	ATG	2	6	834867	834872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450259
18525	NC_020934	T	7	7	834913	834919	0 %	100 %	0 %	0 %	478450259
18526	NC_020934	GAAG	2	8	834956	834963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18527	NC_020934	T	6	6	835021	835026	0 %	100 %	0 %	0 %	478450260
18528	NC_020934	AAAT	2	8	835124	835131	75 %	25 %	0 %	0 %	478450260
18529	NC_020934	AAT	2	6	835134	835139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450260
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18532	NC_020934	CAC	2	6	835236	835241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450260
18533	NC_020934	ATC	2	6	835339	835344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450260
18534	NC_020934	CATA	2	8	835476	835483	50 %	25 %	0 %	25 %	478450260
18535	NC_020934	GCA	2	6	835522	835527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450260
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18537	NC_020934	AAGC	2	8	835576	835583	50 %	0 %	25 %	25 %	478450260
18538	NC_020934	CGC	2	6	835598	835603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478450260
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18543	NC_020934	CGC	2	6	835970	835975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478450260
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18545	NC_020934	CCT	2	6	836137	836142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450260
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18549	NC_020934	TGA	2	6	836252	836257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450260
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18553	NC_020934	AAC	2	6	836436	836441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450260
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18555	NC_020934	GA	3	6	836788	836793	50 %	0 %	50 %	0 %	478450260
18556	NC_020934	AAG	2	6	836817	836822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450260
18557	NC_020934	ACG	2	6	836883	836888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450260
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18559	NC_020934	GA	3	6	836897	836902	50 %	0 %	50 %	0 %	478450260
18560	NC_020934	A	7	7	836937	836943	100 %	0 %	0 %	0 %	478450260
18561	NC_020934	A	6	6	836975	836980	100 %	0 %	0 %	0 %	478450260
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18567	NC_020934	GAAG	2	8	837146	837153	50 %	0 %	50 %	0 %	478450261
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18605	NC_020934	AGA	2	6	838572	838577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450262
18606	NC_020934	GCCA	2	8	838600	838607	25 %	0 %	25 %	50 %	478450262
18607	NC_020934	GGGA	2	8	838679	838686	25 %	0 %	75 %	0 %	478450262
18608	NC_020934	TCT	2	6	838794	838799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450262
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18611	NC_020934	ATA	2	6	838924	838929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450262
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18616	NC_020934	TGGG	2	8	839218	839225	0 %	25 %	75 %	0 %	478450263
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18618	NC_020934	TG	3	6	839248	839253	0 %	50 %	50 %	0 %	478450263
18619	NC_020934	TGT	2	6	839365	839370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450263
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18874	NC_020934	AC	3	6	852561	852566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18875	NC_020934	CAT	2	6	852576	852581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18989	NC_020934	AG	3	6	858964	858969	50 %	0 %	50 %	0 %	478450275
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18998	NC_020934	AAT	2	6	859283	859288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450275
18999	NC_020934	TTTA	2	8	859343	859350	25 %	75 %	0 %	0 %	478450275
19000	NC_020934	TGG	2	6	859352	859357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450275

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