MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_020934	GAAA	2	8	811095	811102	75 %	0 %	25 %	0 %	478450240
18003	NC_020934	GAG	2	6	811141	811146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450240
18004	NC_020934	CA	3	6	811178	811183	50 %	0 %	0 %	50 %	478450240
18005	NC_020934	CAA	2	6	811262	811267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450240
18006	NC_020934	TAT	2	6	811268	811273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450240
18007	NC_020934	ACA	2	6	811306	811311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450240
18008	NC_020934	T	8	8	811312	811319	0 %	100 %	0 %	0 %	478450240
18009	NC_020934	CTT	2	6	811334	811339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450240
18010	NC_020934	TG	3	6	811351	811356	0 %	50 %	50 %	0 %	478450240
18011	NC_020934	ACACA	2	10	811385	811394	60 %	0 %	0 %	40 %	478450240
18012	NC_020934	TCT	2	6	811405	811410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450240
18013	NC_020934	TGA	2	6	811497	811502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_020934	AGA	2	6	811564	811569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18015	NC_020934	A	7	7	811626	811632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_020934	T	6	6	811646	811651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_020934	GGT	2	6	811665	811670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_020934	A	7	7	811671	811677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_020934	GAA	2	6	811722	811727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_020934	AAG	2	6	811833	811838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450241
18021	NC_020934	GT	3	6	811933	811938	0 %	50 %	50 %	0 %	478450241
18022	NC_020934	TCTT	2	8	812133	812140	0 %	75 %	0 %	25 %	478450241
18023	NC_020934	GAG	2	6	812146	812151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450241
18024	NC_020934	GAG	2	6	812197	812202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450241
18025	NC_020934	TGC	2	6	812253	812258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450241
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18027	NC_020934	TGTTT	2	10	812328	812337	0 %	80 %	20 %	0 %	478450241
18028	NC_020934	A	7	7	812345	812351	100 %	0 %	0 %	0 %	478450241
18029	NC_020934	TCT	2	6	812363	812368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450241
18030	NC_020934	GAA	2	6	812495	812500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450241
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18033	NC_020934	GA	5	10	812699	812708	50 %	0 %	50 %	0 %	478450241
18034	NC_020934	AGA	2	6	812739	812744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450241
18035	NC_020934	CTTTG	2	10	812747	812756	0 %	60 %	20 %	20 %	478450241
18036	NC_020934	TTA	2	6	812818	812823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450241
18037	NC_020934	TTG	2	6	812837	812842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450241
18038	NC_020934	AGCA	2	8	812867	812874	50 %	0 %	25 %	25 %	478450241
18039	NC_020934	TTC	2	6	812876	812881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450241
18040	NC_020934	ATT	2	6	812902	812907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450241
18041	NC_020934	TGGA	2	8	813137	813144	25 %	25 %	50 %	0 %	478450241
18042	NC_020934	ACG	2	6	813173	813178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450241
18043	NC_020934	CTT	2	6	813197	813202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450241
18044	NC_020934	AAG	2	6	813218	813223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450241
18045	NC_020934	AG	3	6	813273	813278	50 %	0 %	50 %	0 %	478450241
18046	NC_020934	AGA	2	6	813288	813293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450241
18047	NC_020934	GAA	2	6	813351	813356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450241
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18049	NC_020934	GCATC	2	10	813396	813405	20 %	20 %	20 %	40 %	478450241
18050	NC_020934	TTTA	2	8	813439	813446	25 %	75 %	0 %	0 %	478450241
18051	NC_020934	TGA	2	6	813447	813452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450241
18052	NC_020934	ACT	2	6	813494	813499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450241
18053	NC_020934	ACTT	2	8	813548	813555	25 %	50 %	0 %	25 %	478450241
18054	NC_020934	GAA	2	6	813573	813578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450241
18055	NC_020934	CTT	2	6	813582	813587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450241
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18057	NC_020934	GCG	2	6	813624	813629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478450241
18058	NC_020934	A	6	6	813680	813685	100 %	0 %	0 %	0 %	478450241
18059	NC_020934	GAT	2	6	813733	813738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450241
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18062	NC_020934	AGAA	2	8	813920	813927	75 %	0 %	25 %	0 %	478450241
18063	NC_020934	ATT	2	6	814015	814020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450241
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18103	NC_020934	TAG	2	6	816222	816227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450242
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18105	NC_020934	CT	3	6	816302	816307	0 %	50 %	0 %	50 %	478450242
18106	NC_020934	TTA	2	6	816309	816314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450242
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18231	NC_020934	CTTC	2	8	821934	821941	0 %	50 %	0 %	50 %	478450246
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