MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_020934	TGCT	2	8	697846	697853	0 %	50 %	25 %	25 %	478450150
15503	NC_020934	TG	3	6	697881	697886	0 %	50 %	50 %	0 %	478450150
15504	NC_020934	TCA	2	6	697896	697901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450150
15505	NC_020934	ATA	2	6	697904	697909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450150
15506	NC_020934	AGCTG	2	10	697968	697977	20 %	20 %	40 %	20 %	478450150
15507	NC_020934	CTT	2	6	697993	697998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450150
15508	NC_020934	TTCT	2	8	698015	698022	0 %	75 %	0 %	25 %	478450150
15509	NC_020934	CTG	2	6	698108	698113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450150
15510	NC_020934	CGA	2	6	698138	698143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450150
15511	NC_020934	TCT	2	6	698181	698186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450150
15512	NC_020934	TAC	2	6	698260	698265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450150
15513	NC_020934	CTG	2	6	698278	698283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450150
15514	NC_020934	TGC	2	6	698290	698295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450150
15515	NC_020934	CTT	2	6	698307	698312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450150
15516	NC_020934	C	6	6	698314	698319	0 %	0 %	0 %	100 %	478450150
15517	NC_020934	TCC	2	6	698324	698329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450150
15518	NC_020934	CTC	2	6	698432	698437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450150
15519	NC_020934	TGGC	2	8	698446	698453	0 %	25 %	50 %	25 %	478450150
15520	NC_020934	TAAA	2	8	698500	698507	75 %	25 %	0 %	0 %	478450150
15521	NC_020934	AGT	2	6	698522	698527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450150
15522	NC_020934	AAG	2	6	698548	698553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450150
15523	NC_020934	AAAAC	2	10	698559	698568	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15524	NC_020934	A	6	6	698600	698605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_020934	T	7	7	698607	698613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_020934	TGTT	2	8	698617	698624	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15531	NC_020934	ATG	2	6	698857	698862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450151
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15533	NC_020934	TCT	2	6	698898	698903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450151
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15535	NC_020934	TC	3	6	699029	699034	0 %	50 %	0 %	50 %	478450151
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15538	NC_020934	TTTG	2	8	699119	699126	0 %	75 %	25 %	0 %	478450151
15539	NC_020934	ACT	2	6	699135	699140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450151
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15541	NC_020934	TCCT	2	8	699199	699206	0 %	50 %	0 %	50 %	478450151
15542	NC_020934	ATT	2	6	699275	699280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450151
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15545	NC_020934	TTC	2	6	699515	699520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450151
15546	NC_020934	TC	4	8	699519	699526	0 %	50 %	0 %	50 %	478450151
15547	NC_020934	TATC	2	8	699586	699593	25 %	50 %	0 %	25 %	478450151
15548	NC_020934	TA	3	6	699627	699632	50 %	50 %	0 %	0 %	478450151
15549	NC_020934	CT	3	6	699647	699652	0 %	50 %	0 %	50 %	478450151
15550	NC_020934	TCA	2	6	699682	699687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450151
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15553	NC_020934	GC	3	6	699770	699775	0 %	0 %	50 %	50 %	478450151
15554	NC_020934	AACT	2	8	699796	699803	50 %	25 %	0 %	25 %	478450151
15555	NC_020934	TGA	2	6	699845	699850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450151
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15609	NC_020934	GCAC	2	8	702628	702635	25 %	0 %	25 %	50 %	478450152
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15994	NC_020934	TAA	2	6	719176	719181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450165
15995	NC_020934	GAG	2	6	719191	719196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450165
15996	NC_020934	TTTG	2	8	719230	719237	0 %	75 %	25 %	0 %	478450165
15997	NC_020934	CCTT	2	8	719253	719260	0 %	50 %	0 %	50 %	478450165
15998	NC_020934	CTT	3	9	719336	719344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450165
15999	NC_020934	TAA	2	6	719416	719421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450165
16000	NC_020934	A	6	6	719431	719436	100 %	0 %	0 %	0 %	478450165

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