MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020934	GGC	2	6	653294	653299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478450111
14502	NC_020934	GTT	2	6	653444	653449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450111
14503	NC_020934	A	7	7	653460	653466	100 %	0 %	0 %	0 %	478450111
14504	NC_020934	AGA	2	6	653470	653475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450111
14505	NC_020934	TTGG	2	8	653527	653534	0 %	50 %	50 %	0 %	478450111
14506	NC_020934	GCT	2	6	653561	653566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450111
14507	NC_020934	ATT	2	6	653594	653599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450111
14508	NC_020934	AC	3	6	653640	653645	50 %	0 %	0 %	50 %	478450111
14509	NC_020934	CTT	2	6	653649	653654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450111
14510	NC_020934	GCT	2	6	653684	653689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450111
14511	NC_020934	A	6	6	653862	653867	100 %	0 %	0 %	0 %	478450111
14512	NC_020934	CTT	2	6	653882	653887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450111
14513	NC_020934	GAA	2	6	653999	654004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450111
14514	NC_020934	CT	3	6	654165	654170	0 %	50 %	0 %	50 %	478450112
14515	NC_020934	AGA	2	6	654203	654208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450112
14516	NC_020934	CAA	2	6	654246	654251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450112
14517	NC_020934	TCA	3	9	654284	654292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450112
14518	NC_020934	ATT	2	6	654335	654340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450112
14519	NC_020934	TTA	2	6	654422	654427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450112
14520	NC_020934	A	6	6	654528	654533	100 %	0 %	0 %	0 %	478450112
14521	NC_020934	ATC	2	6	654629	654634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450112
14522	NC_020934	CAA	2	6	654642	654647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450112
14523	NC_020934	CTTTT	2	10	654650	654659	0 %	80 %	0 %	20 %	478450112
14524	NC_020934	T	7	7	654656	654662	0 %	100 %	0 %	0 %	478450112
14525	NC_020934	ATT	2	6	654677	654682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450112
14526	NC_020934	AAG	2	6	654706	654711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450112
14527	NC_020934	CTC	2	6	654714	654719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450112
14528	NC_020934	CTT	2	6	654765	654770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450112
14529	NC_020934	GAC	2	6	654795	654800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450112
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14531	NC_020934	ACA	2	6	654936	654941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450113
14532	NC_020934	T	6	6	654954	654959	0 %	100 %	0 %	0 %	478450113
14533	NC_020934	GTT	2	6	654984	654989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450113
14534	NC_020934	ATG	2	6	655045	655050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450113
14535	NC_020934	TCA	2	6	655091	655096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450113
14536	NC_020934	CT	3	6	655153	655158	0 %	50 %	0 %	50 %	478450113
14537	NC_020934	A	7	7	655250	655256	100 %	0 %	0 %	0 %	478450113
14538	NC_020934	A	7	7	655268	655274	100 %	0 %	0 %	0 %	478450113
14539	NC_020934	AAG	2	6	655289	655294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450113
14540	NC_020934	GAA	2	6	655321	655326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450113
14541	NC_020934	ATC	2	6	655358	655363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14542	NC_020934	GAT	2	6	655372	655377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_020934	T	6	6	655500	655505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_020934	A	9	9	655526	655534	100 %	0 %	0 %	0 %	478450114
14545	NC_020934	TTC	2	6	655640	655645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450114
14546	NC_020934	ACT	2	6	655670	655675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450114
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14548	NC_020934	T	6	6	655818	655823	0 %	100 %	0 %	0 %	478450114
14549	NC_020934	GAA	2	6	655898	655903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450114
14550	NC_020934	A	6	6	656184	656189	100 %	0 %	0 %	0 %	478450114
14551	NC_020934	TTTA	2	8	656257	656264	25 %	75 %	0 %	0 %	478450114
14552	NC_020934	GAA	2	6	656294	656299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450114
14553	NC_020934	AGA	2	6	656302	656307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450114
14554	NC_020934	AGA	2	6	656368	656373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450114
14555	NC_020934	AATC	2	8	656374	656381	50 %	25 %	0 %	25 %	478450114
14556	NC_020934	CAA	2	6	656453	656458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450114
14557	NC_020934	A	6	6	656466	656471	100 %	0 %	0 %	0 %	478450114
14558	NC_020934	TAAA	2	8	656557	656564	75 %	25 %	0 %	0 %	478450114
14559	NC_020934	A	6	6	656562	656567	100 %	0 %	0 %	0 %	478450114
14560	NC_020934	AAC	2	6	656572	656577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_020934	TG	3	6	656585	656590	0 %	50 %	50 %	0 %	478450115
14562	NC_020934	GGA	3	9	656591	656599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450115
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14564	NC_020934	ATA	2	6	656796	656801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450115
14565	NC_020934	CTT	2	6	656839	656844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450115
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14567	NC_020934	TAC	2	6	656885	656890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450115
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14569	NC_020934	CTT	2	6	656939	656944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450115
14570	NC_020934	ATG	2	6	656949	656954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450115
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14573	NC_020934	CCT	2	6	657150	657155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450115
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14577	NC_020934	GAA	2	6	657392	657397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450115
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14591	NC_020934	A	7	7	657961	657967	100 %	0 %	0 %	0 %	478450115
14592	NC_020934	TGC	3	9	658009	658017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450115
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14594	NC_020934	ATTG	2	8	658093	658100	25 %	50 %	25 %	0 %	478450115
14595	NC_020934	TCT	2	6	658108	658113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450115
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14599	NC_020934	ACG	2	6	658303	658308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450115
14600	NC_020934	CAA	2	6	658334	658339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450115
14601	NC_020934	TAT	2	6	658360	658365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450115
14602	NC_020934	AAG	2	6	658395	658400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450115
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14604	NC_020934	AGC	2	6	658486	658491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450115
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14606	NC_020934	GCA	2	6	658541	658546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450115
14607	NC_020934	A	7	7	658546	658552	100 %	0 %	0 %	0 %	478450115
14608	NC_020934	CTC	2	6	658556	658561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450115
14609	NC_020934	GAA	3	9	658574	658582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450115
14610	NC_020934	CTA	2	6	658636	658641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14611	NC_020934	GGA	2	6	658694	658699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_020934	GTC	2	6	658765	658770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450116
14613	NC_020934	GA	3	6	658788	658793	50 %	0 %	50 %	0 %	478450116
14614	NC_020934	TCA	2	6	658835	658840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450116
14615	NC_020934	GCGT	2	8	658864	658871	0 %	25 %	50 %	25 %	478450116
14616	NC_020934	TGAT	2	8	659042	659049	25 %	50 %	25 %	0 %	478450116
14617	NC_020934	GCT	2	6	659122	659127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450116
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14991	NC_020934	A	6	6	675231	675236	100 %	0 %	0 %	0 %	478450128
14992	NC_020934	CAG	2	6	675375	675380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450128
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