MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020934	AAGA	2	8	631142	631149	75 %	0 %	25 %	0 %	478450090
14002	NC_020934	GATT	2	8	631170	631177	25 %	50 %	25 %	0 %	478450091
14003	NC_020934	TCT	2	6	631188	631193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450091
14004	NC_020934	GCA	2	6	631241	631246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450091
14005	NC_020934	CTT	2	6	631257	631262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450091
14006	NC_020934	CTC	2	6	631281	631286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450091
14007	NC_020934	A	6	6	631311	631316	100 %	0 %	0 %	0 %	478450091
14008	NC_020934	CCT	2	6	631376	631381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450091
14009	NC_020934	AAG	2	6	631383	631388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450091
14010	NC_020934	TCC	2	6	631394	631399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450091
14011	NC_020934	CCT	2	6	631491	631496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450091
14012	NC_020934	ATT	2	6	631508	631513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450091
14013	NC_020934	TTC	2	6	631521	631526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450091
14014	NC_020934	ACA	2	6	631546	631551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450091
14015	NC_020934	CCT	2	6	631556	631561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450091
14016	NC_020934	A	6	6	631643	631648	100 %	0 %	0 %	0 %	478450091
14017	NC_020934	TCGAG	2	10	631653	631662	20 %	20 %	40 %	20 %	478450091
14018	NC_020934	T	6	6	631680	631685	0 %	100 %	0 %	0 %	478450091
14019	NC_020934	TTG	2	6	631710	631715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450091
14020	NC_020934	TCCT	2	8	631745	631752	0 %	50 %	0 %	50 %	478450091
14021	NC_020934	CAA	2	6	631829	631834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450091
14022	NC_020934	ATC	2	6	631856	631861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450091
14023	NC_020934	TCA	2	6	631872	631877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450091
14024	NC_020934	CTTT	2	8	631926	631933	0 %	75 %	0 %	25 %	478450091
14025	NC_020934	ATG	3	9	631976	631984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450091
14026	NC_020934	TC	4	8	632001	632008	0 %	50 %	0 %	50 %	478450091
14027	NC_020934	CTA	2	6	632054	632059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450091
14028	NC_020934	TGA	2	6	632067	632072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450091
14029	NC_020934	CAA	2	6	632111	632116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450092
14030	NC_020934	TTTG	2	8	632130	632137	0 %	75 %	25 %	0 %	478450092
14031	NC_020934	TTA	2	6	632158	632163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450092
14032	NC_020934	CTC	2	6	632180	632185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450092
14033	NC_020934	TAT	2	6	632187	632192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450092
14034	NC_020934	TGG	2	6	632216	632221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450092
14035	NC_020934	AGC	2	6	632232	632237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450092
14036	NC_020934	GGCT	2	8	632314	632321	0 %	25 %	50 %	25 %	478450092
14037	NC_020934	TGC	2	6	632343	632348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450092
14038	NC_020934	GGCTC	2	10	632417	632426	0 %	20 %	40 %	40 %	478450093
14039	NC_020934	TA	3	6	632440	632445	50 %	50 %	0 %	0 %	478450093
14040	NC_020934	AGCC	2	8	632453	632460	25 %	0 %	25 %	50 %	478450093
14041	NC_020934	TCTT	2	8	632477	632484	0 %	75 %	0 %	25 %	478450093
14042	NC_020934	ATC	2	6	632518	632523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450093
14043	NC_020934	CT	3	6	632575	632580	0 %	50 %	0 %	50 %	478450093
14044	NC_020934	TGC	2	6	632591	632596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450093
14045	NC_020934	CTT	2	6	632659	632664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450093
14046	NC_020934	TGC	2	6	632721	632726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450093
14047	NC_020934	ACCA	2	8	632749	632756	50 %	0 %	0 %	50 %	478450093
14048	NC_020934	CT	3	6	632787	632792	0 %	50 %	0 %	50 %	478450093
14049	NC_020934	ATT	2	6	632834	632839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450093
14050	NC_020934	AGG	2	6	632865	632870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450093
14051	NC_020934	ATC	2	6	632911	632916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450093
14052	NC_020934	ATG	2	6	632944	632949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450093
14053	NC_020934	CAG	2	6	633029	633034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450093
14054	NC_020934	ATC	2	6	633070	633075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450093
14055	NC_020934	CTC	2	6	633086	633091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450093
14056	NC_020934	CTAC	2	8	633105	633112	25 %	25 %	0 %	50 %	478450093
14057	NC_020934	TGG	2	6	633160	633165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450093
14058	NC_020934	ATT	2	6	633185	633190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450093
14059	NC_020934	CTA	2	6	633218	633223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450093
14060	NC_020934	TCC	2	6	633240	633245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450093
14061	NC_020934	A	9	9	633262	633270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_020934	CTCC	2	8	633274	633281	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14063	NC_020934	A	6	6	633282	633287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_020934	TTC	2	6	633295	633300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_020934	TTG	2	6	633321	633326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_020934	TGC	2	6	633365	633370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450094
14067	NC_020934	AAT	2	6	633391	633396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450094
14068	NC_020934	CAA	2	6	633564	633569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450094
14069	NC_020934	CAC	2	6	633624	633629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450094
14070	NC_020934	C	6	6	633670	633675	0 %	0 %	0 %	100 %	478450094
14071	NC_020934	TG	3	6	633688	633693	0 %	50 %	50 %	0 %	478450094
14072	NC_020934	GAG	2	6	633749	633754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450094
14073	NC_020934	CT	3	6	633755	633760	0 %	50 %	0 %	50 %	478450094
14074	NC_020934	T	6	6	633794	633799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_020934	A	6	6	633860	633865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_020934	TCT	2	6	633882	633887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450095
14077	NC_020934	CAG	2	6	633950	633955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450095
14078	NC_020934	CTT	2	6	633978	633983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450095
14079	NC_020934	AAAG	2	8	633991	633998	75 %	0 %	25 %	0 %	478450095
14080	NC_020934	GCA	2	6	634081	634086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450095
14081	NC_020934	CTG	2	6	634116	634121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450095
14082	NC_020934	CG	3	6	634123	634128	0 %	0 %	50 %	50 %	478450095
14083	NC_020934	ATT	2	6	634179	634184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450095
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14085	NC_020934	CAAC	2	8	634314	634321	50 %	0 %	0 %	50 %	478450095
14086	NC_020934	GGA	2	6	634337	634342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450095
14087	NC_020934	CTCGAG	2	12	634373	634384	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	478450095
14088	NC_020934	AAT	2	6	634386	634391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450095
14089	NC_020934	AGCA	2	8	634404	634411	50 %	0 %	25 %	25 %	478450095
14090	NC_020934	GAA	2	6	634504	634509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450095
14091	NC_020934	ATT	2	6	634566	634571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450095
14092	NC_020934	GGC	2	6	634573	634578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478450095
14093	NC_020934	AAC	2	6	634620	634625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450095
14094	NC_020934	GCTCT	2	10	634658	634667	0 %	40 %	20 %	40 %	478450095
14095	NC_020934	TCGTT	2	10	634686	634695	0 %	60 %	20 %	20 %	478450095
14096	NC_020934	TTG	2	6	634728	634733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450095
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14100	NC_020934	AAAAT	2	10	634849	634858	80 %	20 %	0 %	0 %	478450095
14101	NC_020934	TGG	2	6	634904	634909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450096
14102	NC_020934	CCTT	2	8	634921	634928	0 %	50 %	0 %	50 %	478450096
14103	NC_020934	TCCAT	2	10	634987	634996	20 %	40 %	0 %	40 %	478450096
14104	NC_020934	AGAA	2	8	634997	635004	75 %	0 %	25 %	0 %	478450096
14105	NC_020934	CCT	2	6	635038	635043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450096
14106	NC_020934	CT	3	6	635042	635047	0 %	50 %	0 %	50 %	478450096
14107	NC_020934	CTA	2	6	635056	635061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450096
14108	NC_020934	GAAA	2	8	635150	635157	75 %	0 %	25 %	0 %	478450096
14109	NC_020934	A	6	6	635155	635160	100 %	0 %	0 %	0 %	478450096
14110	NC_020934	CTCTTT	2	12	635258	635269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450096
14111	NC_020934	ATATCC	2	12	635275	635286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450096
14112	NC_020934	AGC	2	6	635313	635318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450096
14113	NC_020934	T	6	6	635373	635378	0 %	100 %	0 %	0 %	478450096
14114	NC_020934	TAAACA	2	12	635386	635397	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478450096
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14116	NC_020934	CAA	2	6	635562	635567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450097
14117	NC_020934	GA	3	6	635588	635593	50 %	0 %	50 %	0 %	478450097
14118	NC_020934	TCC	2	6	635624	635629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450097
14119	NC_020934	A	7	7	635635	635641	100 %	0 %	0 %	0 %	478450097
14120	NC_020934	ATGC	2	8	635651	635658	25 %	25 %	25 %	25 %	478450097
14121	NC_020934	ACGA	2	8	635691	635698	50 %	0 %	25 %	25 %	478450097
14122	NC_020934	GA	4	8	635750	635757	50 %	0 %	50 %	0 %	478450097
14123	NC_020934	AAG	2	6	635758	635763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450097
14124	NC_020934	CTA	2	6	635769	635774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450097
14125	NC_020934	A	6	6	635777	635782	100 %	0 %	0 %	0 %	478450097
14126	NC_020934	ACA	2	6	635853	635858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450098
14127	NC_020934	TCAT	2	8	635874	635881	25 %	50 %	0 %	25 %	478450098
14128	NC_020934	AAG	2	6	635888	635893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450098
14129	NC_020934	TCT	2	6	635895	635900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450098
14130	NC_020934	AAG	2	6	635915	635920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450098
14131	NC_020934	TTTC	2	8	635921	635928	0 %	75 %	0 %	25 %	478450098
14132	NC_020934	CAC	2	6	635937	635942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450098
14133	NC_020934	TCT	2	6	635949	635954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450098
14134	NC_020934	CAT	2	6	636014	636019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450098
14135	NC_020934	CCA	2	6	636108	636113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450098
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14137	NC_020934	CAT	2	6	636140	636145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450098
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14139	NC_020934	TTC	2	6	636183	636188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450098
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14141	NC_020934	GAA	2	6	636236	636241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450099
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14143	NC_020934	ACC	2	6	636370	636375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450099
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14152	NC_020934	TCC	2	6	636726	636731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450099
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14155	NC_020934	CAC	2	6	636858	636863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450099
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14166	NC_020934	CGT	2	6	637333	637338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450099
14167	NC_020934	T	6	6	637338	637343	0 %	100 %	0 %	0 %	478450099
14168	NC_020934	CCT	2	6	637387	637392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14169	NC_020934	CGGAA	2	10	637603	637612	40 %	0 %	40 %	20 %	478450100
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14172	NC_020934	TTG	2	6	637765	637770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450100
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14183	NC_020934	TCC	2	6	638303	638308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450100
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14224	NC_020934	AGCG	2	8	640171	640178	25 %	0 %	50 %	25 %	478450101
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14231	NC_020934	AGA	2	6	640491	640496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450101
14232	NC_020934	CTT	2	6	640676	640681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450101
14233	NC_020934	GAT	2	6	640799	640804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450101
14234	NC_020934	C	9	9	640829	640837	0 %	0 %	0 %	100 %	478450101
14235	NC_020934	GTT	2	6	640883	640888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450101
14236	NC_020934	TC	3	6	640937	640942	0 %	50 %	0 %	50 %	478450101
14237	NC_020934	GA	3	6	640953	640958	50 %	0 %	50 %	0 %	478450101
14238	NC_020934	CTT	2	6	640964	640969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450101
14239	NC_020934	CAT	2	6	640988	640993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450101
14240	NC_020934	CAAA	2	8	641121	641128	75 %	0 %	0 %	25 %	478450101
14241	NC_020934	TCC	2	6	641172	641177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450102
14242	NC_020934	CAA	2	6	641270	641275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450102
14243	NC_020934	TCT	2	6	641383	641388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450102
14244	NC_020934	ATC	2	6	641442	641447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450102
14245	NC_020934	AGAA	2	8	641451	641458	75 %	0 %	25 %	0 %	478450102
14246	NC_020934	CTG	2	6	641474	641479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450102
14247	NC_020934	TAA	2	6	641480	641485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450102
14248	NC_020934	GAA	2	6	641554	641559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450102
14249	NC_020934	CTG	2	6	641580	641585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450102
14250	NC_020934	TCA	2	6	641588	641593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450102
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14252	NC_020934	ATC	2	6	641631	641636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450102
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14255	NC_020934	GCT	2	6	641864	641869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450102
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14271	NC_020934	A	6	6	642410	642415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14272	NC_020934	A	8	8	642442	642449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14273	NC_020934	T	7	7	642482	642488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14274	NC_020934	A	7	7	642492	642498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14275	NC_020934	A	7	7	642500	642506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14276	NC_020934	TTAAAT	2	12	642562	642573	50 %	50 %	0 %	0 %	478450103
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14279	NC_020934	ATGA	2	8	642743	642750	50 %	25 %	25 %	0 %	478450103
14280	NC_020934	TCCAT	2	10	642759	642768	20 %	40 %	0 %	40 %	478450103
14281	NC_020934	ATCC	2	8	642871	642878	25 %	25 %	0 %	50 %	478450103
14282	NC_020934	GCT	2	6	642883	642888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450103
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14335	NC_020934	GA	3	6	645388	645393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14336	NC_020934	AGG	2	6	645420	645425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14337	NC_020934	AC	3	6	645450	645455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14338	NC_020934	GCT	2	6	645456	645461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14340	NC_020934	TTA	2	6	645529	645534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14341	NC_020934	TAG	2	6	645574	645579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14342	NC_020934	TTATT	2	10	645587	645596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14343	NC_020934	T	7	7	645595	645601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14344	NC_020934	TCT	2	6	645627	645632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450105
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14347	NC_020934	TAA	2	6	645662	645667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450105
14348	NC_020934	A	6	6	645666	645671	100 %	0 %	0 %	0 %	478450105
14349	NC_020934	TGC	2	6	645695	645700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450105
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14351	NC_020934	TC	3	6	645830	645835	0 %	50 %	0 %	50 %	478450105
14352	NC_020934	TCC	2	6	645841	645846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450105
14353	NC_020934	ATG	2	6	645997	646002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450105
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14359	NC_020934	GCA	2	6	646180	646185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450105
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14361	NC_020934	CCT	2	6	646252	646257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450105
14362	NC_020934	A	6	6	646278	646283	100 %	0 %	0 %	0 %	478450105
14363	NC_020934	GCT	2	6	646284	646289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450105
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14488	NC_020934	TAT	2	6	652407	652412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450110
14489	NC_020934	TTTG	2	8	652425	652432	0 %	75 %	25 %	0 %	478450110
14490	NC_020934	ATT	2	6	652516	652521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450110
14491	NC_020934	GT	3	6	652727	652732	0 %	50 %	50 %	0 %	478450110
14492	NC_020934	TC	3	6	652757	652762	0 %	50 %	0 %	50 %	478450110
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14495	NC_020934	CA	3	6	652862	652867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14496	NC_020934	A	6	6	652940	652945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14497	NC_020934	CAGG	2	8	652964	652971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14499	NC_020934	AAT	2	6	653105	653110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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