MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020934	CGTC	2	8	563102	563109	0 %	25 %	25 %	50 %	478450018
12502	NC_020934	CCA	2	6	563129	563134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12503	NC_020934	A	6	6	563136	563141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_020934	ATT	2	6	563157	563162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_020934	A	6	6	563163	563168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_020934	ACAA	2	8	563174	563181	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12507	NC_020934	ATT	2	6	563189	563194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_020934	AAT	2	6	563200	563205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_020934	ATTTT	2	10	563212	563221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_020934	AAAAAT	2	12	563232	563243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_020934	A	6	6	563258	563263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_020934	TTG	2	6	563327	563332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450019
12513	NC_020934	TTC	2	6	563354	563359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450019
12514	NC_020934	CCT	2	6	563368	563373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450019
12515	NC_020934	AAAG	2	8	563428	563435	75 %	0 %	25 %	0 %	478450019
12516	NC_020934	CTA	2	6	563476	563481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450019
12517	NC_020934	ATC	2	6	563533	563538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450019
12518	NC_020934	AAC	2	6	563681	563686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450020
12519	NC_020934	ACA	2	6	563715	563720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450020
12520	NC_020934	TTC	2	6	563722	563727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450020
12521	NC_020934	ATCA	2	8	563863	563870	50 %	25 %	0 %	25 %	478450020
12522	NC_020934	TCC	2	6	563896	563901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450020
12523	NC_020934	GAA	2	6	563926	563931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450020
12524	NC_020934	GTT	2	6	564123	564128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450020
12525	NC_020934	CGA	2	6	564144	564149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450020
12526	NC_020934	TCA	2	6	564197	564202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450020
12527	NC_020934	ATT	2	6	564232	564237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450020
12528	NC_020934	GAG	2	6	564288	564293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450020
12529	NC_020934	T	6	6	564541	564546	0 %	100 %	0 %	0 %	478450020
12530	NC_020934	ACG	2	6	564556	564561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450020
12531	NC_020934	TCT	2	6	564587	564592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450020
12532	NC_020934	GGAA	2	8	564595	564602	50 %	0 %	50 %	0 %	478450020
12533	NC_020934	TCA	2	6	564680	564685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450020
12534	NC_020934	TTTC	2	8	564843	564850	0 %	75 %	0 %	25 %	478450020
12535	NC_020934	TCT	2	6	564851	564856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450020
12536	NC_020934	CTT	2	6	564882	564887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450020
12537	NC_020934	CT	3	6	564953	564958	0 %	50 %	0 %	50 %	478450020
12538	NC_020934	CGA	2	6	565006	565011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450021
12539	NC_020934	TTC	2	6	565014	565019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450021
12540	NC_020934	ATT	2	6	565029	565034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450021
12541	NC_020934	T	6	6	565061	565066	0 %	100 %	0 %	0 %	478450021
12542	NC_020934	AGA	2	6	565074	565079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450021
12543	NC_020934	T	7	7	565124	565130	0 %	100 %	0 %	0 %	478450021
12544	NC_020934	ACA	2	6	565211	565216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450021
12545	NC_020934	CAA	2	6	565280	565285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450021
12546	NC_020934	AC	3	6	565290	565295	50 %	0 %	0 %	50 %	478450021
12547	NC_020934	TCT	2	6	565312	565317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450021
12548	NC_020934	CTA	2	6	565369	565374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450021
12549	NC_020934	T	6	6	565581	565586	0 %	100 %	0 %	0 %	478450022
12550	NC_020934	ACAG	2	8	565614	565621	50 %	0 %	25 %	25 %	478450022
12551	NC_020934	TTC	2	6	565673	565678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450022
12552	NC_020934	ATA	2	6	565693	565698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450022
12553	NC_020934	AAT	2	6	565716	565721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450022
12554	NC_020934	TTAA	2	8	565779	565786	50 %	50 %	0 %	0 %	478450022
12555	NC_020934	GCA	2	6	565791	565796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450022
12556	NC_020934	AGC	2	6	565835	565840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450022
12557	NC_020934	CT	3	6	565880	565885	0 %	50 %	0 %	50 %	478450022
12558	NC_020934	TAA	2	6	565939	565944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450022
12559	NC_020934	CTG	2	6	565948	565953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450022
12560	NC_020934	CTG	2	6	566039	566044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450022
12561	NC_020934	CT	3	6	566170	566175	0 %	50 %	0 %	50 %	478450022
12562	NC_020934	AAT	2	6	566227	566232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450022
12563	NC_020934	CAG	2	6	566233	566238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450022
12564	NC_020934	A	6	6	566241	566246	100 %	0 %	0 %	0 %	478450022
12565	NC_020934	T	6	6	566258	566263	0 %	100 %	0 %	0 %	478450022
12566	NC_020934	ACA	2	6	566437	566442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450022
12567	NC_020934	AAT	2	6	566477	566482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450022
12568	NC_020934	TCT	2	6	566493	566498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450022
12569	NC_020934	TTC	2	6	566642	566647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450022
12570	NC_020934	TCT	2	6	566781	566786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450022
12571	NC_020934	AAAT	2	8	566795	566802	75 %	25 %	0 %	0 %	478450022
12572	NC_020934	C	6	6	566890	566895	0 %	0 %	0 %	100 %	478450022
12573	NC_020934	A	7	7	566905	566911	100 %	0 %	0 %	0 %	478450022
12574	NC_020934	CTT	2	6	566917	566922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450022
12575	NC_020934	GAAA	2	8	566954	566961	75 %	0 %	25 %	0 %	478450022
12576	NC_020934	CACT	2	8	566974	566981	25 %	25 %	0 %	50 %	478450022
12577	NC_020934	CTG	2	6	567004	567009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450022
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12579	NC_020934	A	6	6	567095	567100	100 %	0 %	0 %	0 %	478450022
12580	NC_020934	AAGCA	2	10	567107	567116	60 %	0 %	20 %	20 %	478450022
12581	NC_020934	TA	3	6	567140	567145	50 %	50 %	0 %	0 %	478450022
12582	NC_020934	AAG	2	6	567190	567195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450022
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12584	NC_020934	TGC	2	6	567348	567353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450022
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12587	NC_020934	TCT	2	6	567486	567491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450022
12588	NC_020934	AACT	2	8	567533	567540	50 %	25 %	0 %	25 %	478450022
12589	NC_020934	GAA	2	6	567618	567623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450022
12590	NC_020934	GCT	2	6	567737	567742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450022
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12592	NC_020934	T	6	6	567806	567811	0 %	100 %	0 %	0 %	478450022
12593	NC_020934	CAT	2	6	567829	567834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450022
12594	NC_020934	TTC	2	6	567851	567856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450022
12595	NC_020934	TTA	2	6	567978	567983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450022
12596	NC_020934	GA	3	6	568018	568023	50 %	0 %	50 %	0 %	478450022
12597	NC_020934	T	6	6	568157	568162	0 %	100 %	0 %	0 %	478450022
12598	NC_020934	TTG	2	6	568206	568211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450023
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12600	NC_020934	AACCC	2	10	568301	568310	40 %	0 %	0 %	60 %	478450023
12601	NC_020934	TTC	2	6	568353	568358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450023
12602	NC_020934	TGAT	2	8	568378	568385	25 %	50 %	25 %	0 %	478450023
12603	NC_020934	CCA	2	6	568391	568396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450023
12604	NC_020934	CTT	2	6	568400	568405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450023
12605	NC_020934	GCTT	2	8	568411	568418	0 %	50 %	25 %	25 %	478450023
12606	NC_020934	AATA	2	8	568422	568429	75 %	25 %	0 %	0 %	478450023
12607	NC_020934	AAC	2	6	568485	568490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450023
12608	NC_020934	GAA	2	6	568561	568566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450023
12609	NC_020934	CTT	2	6	568637	568642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450023
12610	NC_020934	ATA	2	6	568731	568736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450023
12611	NC_020934	TCC	2	6	568737	568742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450023
12612	NC_020934	TTC	2	6	568792	568797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450023
12613	NC_020934	AG	3	6	568803	568808	50 %	0 %	50 %	0 %	478450023
12614	NC_020934	CAC	2	6	568841	568846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450023
12615	NC_020934	ATA	2	6	568954	568959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450023
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12617	NC_020934	AAT	2	6	568983	568988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450023
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12619	NC_020934	ACAA	2	8	569041	569048	75 %	0 %	0 %	25 %	478450023
12620	NC_020934	AAAC	2	8	569121	569128	75 %	0 %	0 %	25 %	478450023
12621	NC_020934	A	6	6	569140	569145	100 %	0 %	0 %	0 %	478450023
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