MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_020934	GCA	2	6	316529	316534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449805
7003	NC_020934	GGA	2	6	316554	316559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449805
7004	NC_020934	GAT	2	6	316619	316624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449805
7005	NC_020934	TCC	2	6	316631	316636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449805
7006	NC_020934	CGC	2	6	316686	316691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478449805
7007	NC_020934	TGTGT	2	10	316698	316707	0 %	60 %	40 %	0 %	478449805
7008	NC_020934	TGA	2	6	316712	316717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449805
7009	NC_020934	CAT	3	9	316820	316828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449805
7010	NC_020934	GTG	2	6	316867	316872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449805
7011	NC_020934	TGC	2	6	316931	316936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449805
7012	NC_020934	AAG	2	6	316941	316946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449805
7013	NC_020934	AAG	2	6	317008	317013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449805
7014	NC_020934	TAA	2	6	317042	317047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449805
7015	NC_020934	GGA	2	6	317180	317185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449805
7016	NC_020934	AAG	2	6	317224	317229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449805
7017	NC_020934	CG	4	8	317241	317248	0 %	0 %	50 %	50 %	478449805
7018	NC_020934	AGA	2	6	317255	317260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449805
7019	NC_020934	GTT	2	6	317265	317270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449805
7020	NC_020934	AGA	3	9	317279	317287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449805
7021	NC_020934	TGA	2	6	317339	317344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449805
7022	NC_020934	CTC	3	9	317364	317372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449806
7023	NC_020934	TAAAG	2	10	317585	317594	60 %	20 %	20 %	0 %	478449806
7024	NC_020934	GAT	2	6	317595	317600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449806
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7033	NC_020934	A	6	6	318047	318052	100 %	0 %	0 %	0 %	478449806
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7039	NC_020934	CAA	2	6	318354	318359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449806
7040	NC_020934	CTC	2	6	318372	318377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449806
7041	NC_020934	CAA	2	6	318387	318392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449806
7042	NC_020934	CAT	2	6	318461	318466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_020934	A	7	7	318473	318479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_020934	A	7	7	318487	318493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_020934	GCC	2	6	318506	318511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_020934	AATT	2	8	318540	318547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_020934	A	6	6	318557	318562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_020934	TTG	2	6	318578	318583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_020934	A	6	6	318585	318590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7051	NC_020934	TCA	2	6	318656	318661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449807
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7054	NC_020934	TGC	2	6	318854	318859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449807
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7059	NC_020934	AAG	2	6	319093	319098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449807
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7065	NC_020934	TA	3	6	319357	319362	50 %	50 %	0 %	0 %	478449807
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7119	NC_020934	T	6	6	321353	321358	0 %	100 %	0 %	0 %	478449808
7120	NC_020934	ATA	2	6	321417	321422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449808
7121	NC_020934	T	6	6	321580	321585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_020934	T	6	6	321607	321612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7124	NC_020934	AAG	2	6	321773	321778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449809
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7481	NC_020934	AT	3	6	338204	338209	50 %	50 %	0 %	0 %	478449824
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7499	NC_020934	CTTCA	2	10	338923	338932	20 %	40 %	0 %	40 %	478449824
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