MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 complete genome

Total Repeats: 22942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_020933	TTC	2	6	585086	585091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467175
13003	NC_020933	AGA	2	6	585242	585247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467175
13004	NC_020933	TTC	2	6	585271	585276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467175
13005	NC_020933	ATA	2	6	585340	585345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467176
13006	NC_020933	AG	3	6	585357	585362	50 %	0 %	50 %	0 %	478467176
13007	NC_020933	ATT	2	6	585405	585410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467176
13008	NC_020933	CAT	2	6	585530	585535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467176
13009	NC_020933	TCC	2	6	585564	585569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467176
13010	NC_020933	T	6	6	585595	585600	0 %	100 %	0 %	0 %	478467176
13011	NC_020933	AGC	2	6	585603	585608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467176
13012	NC_020933	AAACT	2	10	585706	585715	60 %	20 %	0 %	20 %	478467176
13013	NC_020933	CCT	2	6	585721	585726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467176
13014	NC_020933	AAC	2	6	585729	585734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467176
13015	NC_020933	ACA	2	6	585738	585743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467176
13016	NC_020933	GAC	2	6	585750	585755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467176
13017	NC_020933	CT	3	6	585842	585847	0 %	50 %	0 %	50 %	478467177
13018	NC_020933	CTA	2	6	585868	585873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467177
13019	NC_020933	CTC	2	6	585892	585897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467177
13020	NC_020933	AAC	2	6	585905	585910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467177
13021	NC_020933	T	6	6	585978	585983	0 %	100 %	0 %	0 %	478467177
13022	NC_020933	AAAT	2	8	586024	586031	75 %	25 %	0 %	0 %	478467177
13023	NC_020933	CAT	2	6	586051	586056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467177
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13025	NC_020933	T	6	6	586220	586225	0 %	100 %	0 %	0 %	478467178
13026	NC_020933	GCT	2	6	586236	586241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467178
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13028	NC_020933	AACT	2	8	586343	586350	50 %	25 %	0 %	25 %	478467178
13029	NC_020933	GTCT	2	8	586585	586592	0 %	50 %	25 %	25 %	478467178
13030	NC_020933	CAA	2	6	586612	586617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467178
13031	NC_020933	CTT	2	6	586648	586653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467178
13032	NC_020933	TCA	2	6	586701	586706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467178
13033	NC_020933	ACCAA	2	10	586798	586807	60 %	0 %	0 %	40 %	478467179
13034	NC_020933	CGC	2	6	586819	586824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478467179
13035	NC_020933	GAG	2	6	586867	586872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478467179
13036	NC_020933	TGC	2	6	586919	586924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467179
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13038	NC_020933	TCT	2	6	587034	587039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467179
13039	NC_020933	TGC	2	6	587067	587072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467179
13040	NC_020933	CTT	2	6	587224	587229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467180
13041	NC_020933	ATTC	2	8	587302	587309	25 %	50 %	0 %	25 %	478467180
13042	NC_020933	ATC	2	6	587359	587364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467180
13043	NC_020933	CATA	2	8	587466	587473	50 %	25 %	0 %	25 %	478467180
13044	NC_020933	TTA	2	6	587649	587654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467180
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13047	NC_020933	TA	3	6	587733	587738	50 %	50 %	0 %	0 %	478467180
13048	NC_020933	T	7	7	587740	587746	0 %	100 %	0 %	0 %	478467180
13049	NC_020933	TC	4	8	587768	587775	0 %	50 %	0 %	50 %	478467181
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13051	NC_020933	ACGT	2	8	587885	587892	25 %	25 %	25 %	25 %	478467181
13052	NC_020933	GAG	2	6	587905	587910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478467181
13053	NC_020933	T	6	6	587961	587966	0 %	100 %	0 %	0 %	478467181
13054	NC_020933	CAA	3	9	587986	587994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467181
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13057	NC_020933	ATC	2	6	588209	588214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467182
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13062	NC_020933	CGA	2	6	588387	588392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467182
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13065	NC_020933	CTT	2	6	588569	588574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467183
13066	NC_020933	ATA	2	6	588597	588602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467183
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13069	NC_020933	T	6	6	588674	588679	0 %	100 %	0 %	0 %	478467183
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13073	NC_020933	TAT	2	6	588769	588774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467184
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13078	NC_020933	T	6	6	588871	588876	0 %	100 %	0 %	0 %	478467184
13079	NC_020933	TC	3	6	588915	588920	0 %	50 %	0 %	50 %	478467184
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13087	NC_020933	GGC	2	6	589237	589242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478467185
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13089	NC_020933	CAA	2	6	589291	589296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467185
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13091	NC_020933	ATA	2	6	589371	589376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467185
13092	NC_020933	CA	3	6	589380	589385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13093	NC_020933	GCA	2	6	589409	589414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467186
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13098	NC_020933	GAAA	2	8	589690	589697	75 %	0 %	25 %	0 %	478467186
13099	NC_020933	CGA	2	6	589731	589736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467186
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13102	NC_020933	GCA	2	6	589922	589927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467186
13103	NC_020933	AAG	2	6	589935	589940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467186
13104	NC_020933	TCT	2	6	589944	589949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467186
13105	NC_020933	ATT	2	6	590002	590007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467186
13106	NC_020933	CT	3	6	590097	590102	0 %	50 %	0 %	50 %	478467187
13107	NC_020933	CAA	2	6	590106	590111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467187
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13109	NC_020933	CAA	2	6	590337	590342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467187
13110	NC_020933	TCA	2	6	590355	590360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467187
13111	NC_020933	GTAT	2	8	590397	590404	25 %	50 %	25 %	0 %	478467187
13112	NC_020933	T	6	6	590449	590454	0 %	100 %	0 %	0 %	478467188
13113	NC_020933	TTG	2	6	590478	590483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467188
13114	NC_020933	GA	3	6	590484	590489	50 %	0 %	50 %	0 %	478467188
13115	NC_020933	ACG	2	6	590599	590604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467188
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13119	NC_020933	TTA	2	6	590743	590748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467189
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13121	NC_020933	CGA	2	6	590902	590907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467189
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13494	NC_020933	TCT	2	6	608436	608441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467208
13495	NC_020933	TC	3	6	608446	608451	0 %	50 %	0 %	50 %	478467208
13496	NC_020933	GGTT	2	8	608492	608499	0 %	50 %	50 %	0 %	478467208
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13499	NC_020933	ATA	2	6	608595	608600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467208
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