MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 complete genome

Total Repeats: 22942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020933	CCT	2	6	518617	518622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467110
11503	NC_020933	TCT	2	6	518804	518809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467110
11504	NC_020933	TAC	2	6	518820	518825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467110
11505	NC_020933	TGT	2	6	519010	519015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467110
11506	NC_020933	AGC	2	6	519021	519026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467110
11507	NC_020933	TTC	2	6	519027	519032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467110
11508	NC_020933	GCC	2	6	519304	519309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478467110
11509	NC_020933	AACT	2	8	519429	519436	50 %	25 %	0 %	25 %	478467110
11510	NC_020933	AGC	2	6	519447	519452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467110
11511	NC_020933	AAC	2	6	519475	519480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467110
11512	NC_020933	GA	3	6	519518	519523	50 %	0 %	50 %	0 %	478467110
11513	NC_020933	CAA	2	6	519536	519541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467110
11514	NC_020933	AAG	2	6	519602	519607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467110
11515	NC_020933	CTC	2	6	519618	519623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467110
11516	NC_020933	CTTC	2	8	519629	519636	0 %	50 %	0 %	50 %	478467110
11517	NC_020933	TGT	2	6	519646	519651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467110
11518	NC_020933	ATAA	2	8	519850	519857	75 %	25 %	0 %	0 %	478467110
11519	NC_020933	TTG	2	6	519860	519865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467110
11520	NC_020933	AAAG	2	8	519919	519926	75 %	0 %	25 %	0 %	478467110
11521	NC_020933	AAG	2	6	519941	519946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467110
11522	NC_020933	AAC	2	6	519969	519974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467110
11523	NC_020933	TC	3	6	519977	519982	0 %	50 %	0 %	50 %	478467110
11524	NC_020933	ACA	2	6	520003	520008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467110
11525	NC_020933	AATA	2	8	520062	520069	75 %	25 %	0 %	0 %	478467110
11526	NC_020933	TCT	2	6	520078	520083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467110
11527	NC_020933	TGC	2	6	520126	520131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467110
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11529	NC_020933	AAT	3	9	520329	520337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467110
11530	NC_020933	GAAG	2	8	520434	520441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_020933	AT	3	6	520460	520465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_020933	AAAG	2	8	520473	520480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_020933	T	6	6	520521	520526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_020933	TTGGA	2	10	520544	520553	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_020933	T	6	6	520567	520572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_020933	ACA	2	6	520575	520580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_020933	AACC	2	8	520608	520615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11538	NC_020933	A	7	7	520679	520685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_020933	T	6	6	520701	520706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_020933	A	7	7	520752	520758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_020933	AGA	2	6	520805	520810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467111
11542	NC_020933	AAAG	2	8	520818	520825	75 %	0 %	25 %	0 %	478467111
11543	NC_020933	CAA	2	6	520874	520879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467111
11544	NC_020933	GAACT	2	10	521031	521040	40 %	20 %	20 %	20 %	478467111
11545	NC_020933	TTG	2	6	521062	521067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467111
11546	NC_020933	TCA	2	6	521135	521140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_020933	A	7	7	521145	521151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_020933	CTAA	2	8	521166	521173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11549	NC_020933	AAT	2	6	521190	521195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020933	ACTT	2	8	521200	521207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11551	NC_020933	GCT	2	6	521291	521296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_020933	CAAAA	2	10	521310	521319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11553	NC_020933	AGA	2	6	521368	521373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_020933	ATA	2	6	521402	521407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_020933	CTA	2	6	521476	521481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_020933	TCCC	2	8	521638	521645	0 %	25 %	0 %	75 %	478467112
11557	NC_020933	CAT	3	9	521658	521666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467112
11558	NC_020933	TCG	2	6	521676	521681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467112
11559	NC_020933	TTG	2	6	521762	521767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467112
11560	NC_020933	ATT	2	6	521856	521861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467112
11561	NC_020933	GCA	2	6	521885	521890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467112
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11563	NC_020933	ACA	2	6	521969	521974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467112
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11566	NC_020933	A	7	7	522097	522103	100 %	0 %	0 %	0 %	478467112
11567	NC_020933	CAA	2	6	522313	522318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467112
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11569	NC_020933	GTC	2	6	522402	522407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467113
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11572	NC_020933	CTT	2	6	522483	522488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467113
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11575	NC_020933	TTCT	2	8	522663	522670	0 %	75 %	0 %	25 %	478467113
11576	NC_020933	CTT	2	6	522671	522676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467113
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11583	NC_020933	AGT	2	6	522953	522958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467113
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11589	NC_020933	TCC	2	6	523228	523233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467113
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11596	NC_020933	AAG	2	6	523521	523526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467114
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11599	NC_020933	CCTC	2	8	523723	523730	0 %	25 %	0 %	75 %	478467114
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11602	NC_020933	AGA	2	6	523963	523968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467115
11603	NC_020933	AAGC	2	8	523985	523992	50 %	0 %	25 %	25 %	478467115
11604	NC_020933	TAT	2	6	524013	524018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467115
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11607	NC_020933	ATTC	2	8	524114	524121	25 %	50 %	0 %	25 %	478467115
11608	NC_020933	TGC	2	6	524178	524183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467115
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11610	NC_020933	GGAG	2	8	524218	524225	25 %	0 %	75 %	0 %	478467115
11611	NC_020933	TCA	2	6	524228	524233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467115
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11613	NC_020933	ACT	2	6	524401	524406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467115
11614	NC_020933	A	6	6	524461	524466	100 %	0 %	0 %	0 %	478467115
11615	NC_020933	CAA	2	6	524530	524535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467115
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11618	NC_020933	TCA	2	6	524621	524626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467116
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11621	NC_020933	TCC	2	6	524777	524782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467116
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11990	NC_020933	TGC	2	6	540161	540166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467130
11991	NC_020933	GAA	2	6	540236	540241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467130
11992	NC_020933	CCA	2	6	540263	540268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478467130
11993	NC_020933	ACAAGA	2	12	540338	540349	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	478467130
11994	NC_020933	GGA	2	6	540363	540368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478467130
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11996	NC_020933	CTA	2	6	540461	540466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467130
11997	NC_020933	TCCC	2	8	540493	540500	0 %	25 %	0 %	75 %	478467130
11998	NC_020933	AGA	2	6	540515	540520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467130
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12000	NC_020933	TAC	2	6	540540	540545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467130

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